More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5598 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  100 
 
 
165 aa  327  3e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  38.85 
 
 
137 aa  92.8  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  42.67 
 
 
269 aa  88.2  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  43.24 
 
 
186 aa  88.2  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  43.61 
 
 
229 aa  87.4  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  40.94 
 
 
246 aa  86.3  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  39.6 
 
 
242 aa  86.3  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  40 
 
 
171 aa  84  9e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 
286 aa  80.9  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  40.5 
 
 
171 aa  80.9  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 
237 aa  80.1  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 
251 aa  80.1  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  42.22 
 
 
231 aa  78.2  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 
248 aa  78.6  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  37.86 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  41.35 
 
 
229 aa  77.8  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  39.72 
 
 
249 aa  77.4  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  45 
 
 
229 aa  77  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  39.86 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  42.34 
 
 
135 aa  76.6  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  43.8 
 
 
226 aa  74.7  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  37.76 
 
 
662 aa  74.7  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  46.46 
 
 
320 aa  74.3  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
273 aa  74.3  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  38.28 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
132 aa  74.3  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
248 aa  74.3  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  41.48 
 
 
154 aa  73.9  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  38.73 
 
 
228 aa  73.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2844  cytidyltransferase-related domain-containing protein  38.97 
 
 
342 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  47.01 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  41.61 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 
252 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  37.04 
 
 
232 aa  71.6  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 
303 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 
252 aa  71.2  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3292  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 
229 aa  70.1  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.238683 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  42.62 
 
 
345 aa  70.5  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0022  NUDIX hydrolase  41.32 
 
 
267 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0640861  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5608  cytidyltransferase-like protein  39.52 
 
 
378 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.400356 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 
219 aa  68.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05360  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  39.72 
 
 
345 aa  68.6  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04292  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  38.57 
 
 
351 aa  68.6  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
225 aa  67.8  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0836  NUDIX hydrolase  37.66 
 
 
263 aa  67.8  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550059  normal  0.10397 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0910  ADP-ribose pyrophosphatase  31.2 
 
 
245 aa  67.4  0.00000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0799533  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 
284 aa  67.4  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  37.06 
 
 
231 aa  67  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 
233 aa  66.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6281  NUDIX hydrolase  37.24 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000760196  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1851  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  40.91 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  40.15 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0189  NUDIX hydrolase  40.71 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3721  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000111164  decreased coverage  0.00513627 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0165  NUDIX hydrolase  38.73 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27477  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1530  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.249617  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  37.9 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  41.3 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1179  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
230 aa  64.3  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  37.59 
 
 
346 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  37.59 
 
 
346 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  37.76 
 
 
346 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  37.59 
 
 
346 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  38.97 
 
 
166 aa  63.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  38.81 
 
 
346 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0205  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  38.41 
 
 
338 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.445871 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 
225 aa  63.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0519  MutT/nudix family protein  35.21 
 
 
146 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  37.06 
 
 
346 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6270  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 
195 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6285  cytidyltransferase-related domain protein  38.84 
 
 
358 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000881728  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1061  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
179 aa  63.2  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  40.94 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1117  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 
229 aa  62.4  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  39.87 
 
 
140 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  43.65 
 
 
130 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 
212 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0679  cytidyltransferase-related domain protein  36.5 
 
 
344 aa  62  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0701  cytidyltransferase-like protein  36.5 
 
 
344 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.962082  normal  0.0273891 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5113  hypothetical protein  35.56 
 
 
252 aa  61.6  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2204  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  37.5 
 
 
349 aa  60.8  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.5504  decreased coverage  0.00753224 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2047  NUDIX hydrolase  46.75 
 
 
156 aa  60.8  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3993  NUDIX hydrolase  30.57 
 
 
234 aa  60.1  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0629305  normal  0.556995 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1913  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  37.5 
 
 
355 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.680637  decreased coverage  0.0000316043 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  41.75 
 
 
163 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3464  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
148 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  32.64 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5757  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 
244 aa  59.7  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165623  hitchhiker  0.000000000000529868 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  33.81 
 
 
252 aa  59.7  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2639  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
148 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0974  cytidyltransferase-like protein  35.77 
 
 
348 aa  58.5  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2458  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 
138 aa  58.2  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  46.99 
 
 
148 aa  58.2  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0783  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
238 aa  57.8  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>