65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5506 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5506  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  756    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344164  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5433  hypothetical protein  44.53 
 
 		 420 aa  273  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3224  hypothetical protein  46.57 
 
 		 378 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3543  putative integral membrane protein  42.66 
 
 		 428 aa  210  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2968  putative integral membrane protein  41.67 
 
 		 430 aa  208  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3287  putative integral membrane protein  41.62 
 
 		 418 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505534  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3276  putative integral membrane protein  41.44 
 
 		 418 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3338  putative integral membrane protein  41.44 
 
 		 418 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2502  Protein of unknown function DUF2029  38.61 
 
 		 414 aa  204  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12209  integral membrane protein  40.83 
 
 		 427 aa  202  6e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06020  Protein of unknown function (DUF2029)  37.8 
 
 		 444 aa  176  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.179625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4234  sugar transporter superfamily protein  39.59 
 
 		 402 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2198  hypothetical protein  34.93 
 
 		 408 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2153  mannosyltransferase  32.63 
 
 		 369 aa  150  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0955915  normal  0.0100871 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3057  hypothetical protein  35.95 
 
 		 494 aa  146  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21610  Protein of unknown function (DUF2029)  35.37 
 
 		 421 aa  143  4e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0338543  normal  0.0110628 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0743  mannosyltransferase  35.54 
 
 		 398 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1126  Protein of unknown function DUF2029  35.6 
 
 		 425 aa  142  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2916  hypothetical protein  33.33 
 
 		 470 aa  139  6e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189824  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4322  mannosyltransferase  34.07 
 
 		 417 aa  137  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4020  Protein of unknown function DUF2029  32.93 
 
 		 426 aa  137  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643753  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0139  hypothetical protein  34.16 
 
 		 437 aa  136  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0243  putative integral membrane protein  35.31 
 
 		 417 aa  136  8e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155978 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4274  mannosyltransferase  35.15 
 
 		 443 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4045  mannosyltransferase  35.15 
 
 		 443 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4120  mannosyltransferase  35.15 
 
 		 443 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.703888 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11183  mannosyltransferase  33.33 
 
 		 431 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4550  mannosyltransferase  32.43 
 
 		 406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5329  hypothetical protein  33.22 
 
 		 478 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0070  hypothetical protein  34.06 
 
 		 455 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0468  mannosyltransferase  32.89 
 
 		 422 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0479  mannosyltransferase  32.89 
 
 		 422 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0455  mannosyltransferase  32.89 
 
 		 422 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2282  Protein of unknown function DUF2029  31.28 
 
 		 469 aa  129  9.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291881  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21600  Protein of unknown function (DUF2029)  32.7 
 
 		 467 aa  129  9.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0988113  hitchhiker  0.00696231 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0453  mannosyltransferase  31.17 
 
 		 438 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0466  mannosyltransferase  31.17 
 
 		 438 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0477  mannosyltransferase  31.17 
 
 		 438 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1385  hypothetical protein  33.53 
 
 		 412 aa  127  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6115  hypothetical protein  31.11 
 
 		 479 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112096  normal  0.027736 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0993  hypothetical protein  37.36 
 
 		 411 aa  123  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3060  hypothetical protein  34.4 
 
 		 434 aa  123  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.647331  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3057  Protein of unknown function DUF2029  32.03 
 
 		 455 aa  120  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0888832  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3685  hypothetical protein  34.8 
 
 		 420 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1016  hypothetical protein  35.26 
 
 		 419 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0119  hypothetical protein  35.18 
 
 		 429 aa  116  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  32.8 
 
 		 570 aa  116  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0467  mannosyltransferase  31.21 
 
 		 428 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0454  mannosyltransferase  31.21 
 
 		 428 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0478  mannosyltransferase  31.21 
 
 		 428 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1343  hypothetical protein  31.9 
 
 		 410 aa  112  9e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4089  hypothetical protein  35.11 
 
 		 408 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1125  hypothetical protein  32.72 
 
 		 408 aa  97.4  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.51418  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0435  hypothetical protein  39.23 
 
 		 417 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0425  hypothetical protein  39.23 
 
 		 417 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4545  hypothetical protein  27.83 
 
 		 477 aa  93.2  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5055  hypothetical protein  30.58 
 
 		 477 aa  90.9  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2285  Protein of unknown function DUF2029  35.19 
 
 		 463 aa  89.7  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3880  putative conserved membrane protein  30.53 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561968 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0753  hypothetical protein  25.54 
 
 		 437 aa  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9362  integral membrane protein-like protein  27.16 
 
 		 435 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1662  hypothetical protein  27.53 
 
 		 427 aa  47.8  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2388  hypothetical protein  26.49 
 
 		 469 aa  44.3  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3146  Thiolase  29.77 
 
 		 468 aa  43.1  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6881  hypothetical protein  27.83 
 
 		 417 aa  42.7  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.822628  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>