More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5459 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5459  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 365 aa  720    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00365854  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11174  transposase  52.76 
 
 		 287 aa  160  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11059  transposase  55.15 
 
 		 145 aa  144  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3275  transposase IS4 family protein  48.17 
 
 		 177 aa  134  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  42.42 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  42.42 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  42.42 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  41.72 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4009  transposase, IS4  43.94 
 
 		 256 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2506  IS4 family transposase  42.68 
 
 		 158 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1979  transposase IS4 family protein  42.01 
 
 		 304 aa  103  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0285  transposase, IS4 family protein  44.59 
 
 		 184 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0496  transposase, IS4 family protein  44.59 
 
 		 184 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4463  transposase IS4 family protein  39.49 
 
 		 188 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0242  transposase (IS4 family)  36.71 
 
 		 171 aa  89  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0124  transposase (IS4 family)  36.71 
 
 		 171 aa  89  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0291  transposase (IS4 family)  36.71 
 
 		 171 aa  89  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.34578e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  35.93 
 
 		 253 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  35.93 
 
 		 253 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2677  transposase IS4 family protein  35.03 
 
 		 142 aa  79.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183927  normal  0.153389 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0250  transposase IS4 family protein  35.03 
 
 		 142 aa  79.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00554315  hitchhiker  0.00627953 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  35.93 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  35.93 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  35.93 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0548  hypothetical protein  34.84 
 
 		 128 aa  77.8  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2685  transposase, IS4  39.71 
 
 		 131 aa  77.8  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0310  transposase, IS4  32.14 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1095  transposase, IS4  32.14 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.282833 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0047  transposase IS4  34.97 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.683119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0621  transposase IS4  34.97 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0830  transposase IS4  34.97 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.172478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2019  transposase IS4  34.97 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2650  transposase IS4  34.97 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0563  hypothetical protein  32.91 
 
 		 159 aa  77  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2919  transposase, IS4  32.14 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15000  putative Transposase, IS4 family  40.56 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.09593  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23120  putative Transposase, IS4 family  40.56 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6136  transposase IS4 family protein  35.8 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1107  transposase IS4 family protein  35.8 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21800  putative Transposase, IS4 family  40.56 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.20472  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1158  transposase  35.67 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4159  transposase IS4 family protein  35.8 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06560  putative Transposase, IS4 family  40.56 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.180916  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14930  putative Transposase, IS4 family  40.56 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0216395  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14820  putative Transposase, IS4 family  40.56 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0399604  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14750  putative Transposase, IS4 family  40.56 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.337332  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.18 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00640  transposase family protein  41.96 
 
 		 136 aa  73.6  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7671  transposase  34.84 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807085  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  34.87 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3438  putative transposase  39.81 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  34.87 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  34.87 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  34.87 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  34.87 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  34.87 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20960  putative Transposase, IS4 family  44.34 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.592234  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  33.12 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  33.11 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  33.11 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  33.11 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  33.11 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.18 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.18 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  33.11 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01990  putative Transposase, IS4  45.71 
 
 		 124 aa  70.9  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13890  transposase family protein  44.44 
 
 		 103 aa  70.9  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.417706  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06540  putative Transposase IS4  45.71 
 
 		 124 aa  70.9  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231609  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9114  transposase protein  33.11 
 
 		 122 aa  70.5  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.82 
 
 		 251 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0435  transposase, IS4  33.74 
 
 		 176 aa  67  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1934  transposase, IS4  33.74 
 
 		 176 aa  67  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0180  transposase, IS4  33.74 
 
 		 176 aa  67  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.501437  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1015  transposase, IS4  33.74 
 
 		 176 aa  67  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186494 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  32.53 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  32.53 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  33.54 
 
 		 281 aa  65.5  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  31.85 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2092  transposase, IS4 family protein  29.7 
 
 		 186 aa  62  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  0.152141 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2976  transposase, IS4 family protein  29.7 
 
 		 186 aa  62  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.119595 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3333  transposase, IS4 family protein  29.7 
 
 		 186 aa  62.4  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3795  hypothetical protein  28.14 
 
 		 190 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1805  transposase, IS4 family protein  28.14 
 
 		 190 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1327  transposase, IS4 family protein  28.14 
 
 		 190 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0937  transposase, IS4 family protein  28.14 
 
 		 190 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119126  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2823  transposase, IS4 family protein  28.14 
 
 		 190 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1820  transposase, IS4 family protein  28.14 
 
 		 190 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0796894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3322  hypothetical protein  28.14 
 
 		 190 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0338257  normal  0.289383 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3493  hypothetical protein  28.14 
 
 		 190 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887255  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1815  transposase, IS4 family protein  28.14 
 
 		 190 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0486007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0877  transposase, IS4 family protein  28.14 
 
 		 190 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4189  putative transposase  43.84 
 
 		 79 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4225  putative transposase  43.84 
 
 		 79 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3849  hypothetical protein  28.14 
 
 		 190 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0531772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3789  hypothetical protein  28.14 
 
 		 190 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3079  hypothetical protein  44.44 
 
 		 121 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01953  ISSod6, transposase  27.1 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0375505  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0861  transposase, IS4 family protein  28.14 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0534  ISBm1, transposase orfB  33.11 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.162326  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0538  ISBm1, transposase orfB  33.11 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>