153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5448 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5448  DNA-3-methyladenine glycosylase  100 
 
 
209 aa  414  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25550  DNA-3-methyladenine glycosylase  74.38 
 
 
212 aa  290  9e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2159  DNA-3-methyladenine glycosylase  55.38 
 
 
209 aa  201  5e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000743794  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1255  3-methyladenine DNA glycosylase  53.27 
 
 
213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.139992 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4123  DNA-3-methyladenine glycosylase  55.28 
 
 
211 aa  184  7e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.069572  hitchhiker  0.000036152 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3021  DNA-3-methyladenine glycosylase  52.24 
 
 
214 aa  184  8e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1896  DNA-3-methyladenine glycosylase  58.7 
 
 
216 aa  180  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2363  DNA-3-methyladenine glycosylase  53.89 
 
 
219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.701689  decreased coverage  0.00325367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6069  3-methyladenine DNA glycosylase  53.46 
 
 
228 aa  178  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4447  DNA-3-methyladenine glycosylase  52.55 
 
 
216 aa  178  5.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.272988 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5463  DNA-3-methyladenine glycosylase  53.72 
 
 
206 aa  176  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00957524  decreased coverage  0.00095084 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1509  DNA-3-methyladenine glycosylase  50.74 
 
 
230 aa  175  5e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000383053 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2476  3-methyladenine DNA glycosylase  54.87 
 
 
197 aa  173  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1890  DNA-3-methyladenine glycosylase  60.75 
 
 
220 aa  171  5.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118243  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1508  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.45 
 
 
217 aa  165  5e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.14598  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1335  DNA-3-methyladenine glycosylase  53.09 
 
 
226 aa  159  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377862  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2389  DNA-3-methyladenine glycosylase  50.53 
 
 
195 aa  159  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0121289  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3154  DNA-3-methyladenine glycosylase  52.97 
 
 
215 aa  159  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0540  3-methyladenine DNA glycosylase  50.56 
 
 
258 aa  159  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6105  3-methyladenine DNA glycosylase  49.71 
 
 
207 aa  156  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2023  DNA-3-methyladenine glycosylase  47.75 
 
 
234 aa  155  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.319248 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1651  DNA-3-methyladenine glycosylase  49.5 
 
 
240 aa  155  6e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2161  3-methyladenine DNA glycosylase  48.55 
 
 
207 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2775  3-methyladenine DNA glycosylase  48.55 
 
 
207 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539823  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3295  3-methyladenine DNA glycosylase  45.81 
 
 
203 aa  150  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.619589  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1635  DNA-3-methyladenine glycosylase  47.43 
 
 
190 aa  148  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2786  3-methyladenine DNA glycosylase  47.98 
 
 
207 aa  148  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.477163 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22240  DNA-3-methyladenine glycosylase  48.83 
 
 
219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1287  DNA-3-methyladenine glycosylase  52.05 
 
 
210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11704  3-methyladenine DNA glycosylase  47.09 
 
 
203 aa  143  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.336317 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2971  3-methyladenine DNA glycosylase  46 
 
 
203 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.596495  hitchhiker  0.00962435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2956  3-methyladenine DNA glycosylase  47.18 
 
 
204 aa  138  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3000  3-methyladenine DNA glycosylase  47.18 
 
 
204 aa  138  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3167  DNA-3-methyladenine glycosylase  48.55 
 
 
212 aa  135  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1170  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.98 
 
 
216 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1745  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.54 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00627267 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0903  DNA-3-methyladenine glycosylase  48.02 
 
 
192 aa  131  6e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1057  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.71 
 
 
187 aa  127  9.000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2889  3-methyladenine DNA glycosylase  45.08 
 
 
201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833932  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2393  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.93 
 
 
192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.412729  normal  0.610671 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1650  3-methyladenine DNA glycosylase  41.88 
 
 
217 aa  125  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.9528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6283  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.33 
 
 
182 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.620932  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0321  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  39.38 
 
 
196 aa  122  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0107419 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1802  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  37.36 
 
 
203 aa  121  7e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.856729  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2583  3-methyladenine DNA glycosylase  41.15 
 
 
202 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  0.011747 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2856  3-methyladenine DNA glycosylase  43.58 
 
 
206 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.371559  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3514  3-methyladenine DNA glycosylase  49.4 
 
 
174 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1889  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.01 
 
 
208 aa  119  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3948  3-methyladenine DNA glycosylase  43.17 
 
 
196 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2057  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.97 
 
 
201 aa  118  6e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2098  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.36 
 
 
196 aa  118  7.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1264  3-methyladenine DNA glycosylase  41.71 
 
 
193 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.754746  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1657  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  42.16 
 
 
168 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.29752  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2381  3-methyladenine DNA glycosylase  46.86 
 
 
184 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1042  3-methyladenine DNA glycosylase  46.29 
 
 
184 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0126779  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0710  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.87 
 
 
198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0774  3-methyladenine DNA glycosylase  40.72 
 
 
205 aa  116  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4712  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.32 
 
 
207 aa  116  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0959  3-methyladenine DNA glycosylase  40.72 
 
 
205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0319  DNA-3-methyladenine glycosylase  40 
 
 
211 aa  115  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44968  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0611  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.92 
 
 
199 aa  115  6e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.307609 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2571  3-methyladenine DNA glycosylase  46.06 
 
 
224 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08299  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0826  3-methyladenine DNA glycosylase  40.21 
 
 
205 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0869  3-methyladenine DNA glycosylase  40.21 
 
 
205 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0960  3-methyladenine DNA glycosylase  40.21 
 
 
205 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0773  3-methyladenine DNA glycosylase  40.21 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1048  3-methyladenine DNA glycosylase  39.69 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.467167  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0157  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.42 
 
 
224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.798535 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0774  3-methyladenine DNA glycosylase  40.72 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0922  3-methyladenine DNA glycosylase  40.72 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.904428  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4408  3-methyladenine DNA glycosylase  40.21 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047944 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4271  3-methyladenine DNA glycosylase  48.43 
 
 
185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1529  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.29 
 
 
216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2679  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.71 
 
 
206 aa  111  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0045181  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2275  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.27 
 
 
206 aa  112  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3243  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.42 
 
 
212 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1309  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.69 
 
 
190 aa  111  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0425543  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2088  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.69 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0898  hypothetical protein  40.43 
 
 
183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1438  3-methyladenine DNA glycosylase  42.86 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.180983  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0277  3-methyladenine DNA glycosylase  34.39 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0750  3-methyladenine DNA glycosylase  35.08 
 
 
189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0079  DNA-3-methyladenine glycosylase II  40.11 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1894  3-methyladenine DNA glycosylase  46.98 
 
 
184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754193  normal  0.935927 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1011  3-methyladenine DNA glycosylase  41.52 
 
 
170 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.836846 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0703  3-methyladenine DNA glycosylase  37.63 
 
 
204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2004  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.11 
 
 
201 aa  108  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1611  3-methyladenine DNA glycosylase  36.05 
 
 
198 aa  108  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.289887  normal  0.460246 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1830  3-methyladenine DNA glycosylase  41.99 
 
 
206 aa  107  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.688106  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0929  hypothetical protein  38.95 
 
 
183 aa  106  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4364  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.97 
 
 
210 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45851  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01450  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.86 
 
 
232 aa  106  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3543  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.12 
 
 
204 aa  105  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.241526  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4387  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.45 
 
 
210 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3642  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.7 
 
 
197 aa  104  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4231  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.76 
 
 
207 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625933  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2580  3-methyladenine DNA glycosylase  34.34 
 
 
205 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1678  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  36.89 
 
 
213 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218414  normal  0.683693 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2041  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.44 
 
 
201 aa  102  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.117286  hitchhiker  0.00692573 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1432  3-methyladenine DNA glycosylase  41.94 
 
 
181 aa  102  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>