More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5344 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5344  protein of unknown function DUF21  100 
 
 
444 aa  870    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.308769  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22510  CBS domain-containing protein  65.43 
 
 
438 aa  565  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0516538  normal  0.801852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2814  hypothetical protein  59.86 
 
 
471 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2858  hypothetical protein  59.86 
 
 
471 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.860129  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2841  hypothetical protein  59.86 
 
 
470 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245306  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2764  protein of unknown function DUF21  59.62 
 
 
461 aa  474  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3094  hypothetical protein  58.88 
 
 
451 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.292492  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3364  hypothetical protein  58.64 
 
 
457 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2317  protein of unknown function DUF21  56.29 
 
 
450 aa  464  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11870  hypothetical protein  56.92 
 
 
455 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0136182  normal  0.440152 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6404  hypothetical protein  49.3 
 
 
452 aa  395  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1954  hypothetical protein  51.3 
 
 
574 aa  382  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0113455  normal  0.562335 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2999  hypothetical protein  50.72 
 
 
503 aa  365  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280207  normal  0.727721 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1722  protein of unknown function DUF21  49.42 
 
 
460 aa  364  1e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1234  protein of unknown function DUF21  54.5 
 
 
453 aa  360  3e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.106715 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5679  protein of unknown function DUF21  52.51 
 
 
450 aa  359  6e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.372603  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0914  hypothetical protein  51.38 
 
 
474 aa  357  2.9999999999999997e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447806  normal  0.0678288 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31520  CBS domain-containing protein  48.22 
 
 
455 aa  349  4e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2371  protein of unknown function DUF21  48.51 
 
 
490 aa  347  3e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.304604 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1222  protein of unknown function DUF21  49.41 
 
 
439 aa  347  3e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.250523  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2962  protein of unknown function DUF21  48.99 
 
 
486 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.387429  hitchhiker  0.00195258 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09590  CBS domain-containing protein  46.65 
 
 
443 aa  341  2e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0508  protein of unknown function DUF21  50.49 
 
 
451 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2378  protein of unknown function DUF21  49.76 
 
 
443 aa  338  9.999999999999999e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000393714 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2720  hypothetical protein  52.43 
 
 
451 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2643  hypothetical protein  49.27 
 
 
445 aa  328  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3662  hypothetical protein  47.18 
 
 
453 aa  322  8e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0063  protein of unknown function DUF21  46.12 
 
 
452 aa  321  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07750  CBS domain-containing protein  49.03 
 
 
438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2484  protein of unknown function DUF21  45.66 
 
 
442 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1409  hypothetical protein  45.61 
 
 
452 aa  305  8.000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.464754 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1368  hypothetical protein  45.12 
 
 
452 aa  298  1e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0047  hypothetical protein  45.23 
 
 
520 aa  290  4e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3477  hypothetical protein  39.51 
 
 
458 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3540  hypothetical protein  39.51 
 
 
458 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228644  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3490  hypothetical protein  39.51 
 
 
458 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24020  CBS domain-containing protein  40.38 
 
 
451 aa  255  1.0000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.94366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4665  protein of unknown function DUF21  39.62 
 
 
441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6909  hypothetical protein  39.44 
 
 
451 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97846  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1685  CBS  38.96 
 
 
462 aa  248  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2683  CBS domain-containing protein  39.13 
 
 
455 aa  248  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.522065  normal  0.368276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0119  protein of unknown function DUF21  44.33 
 
 
486 aa  247  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458192  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1941  protein of unknown function DUF21  35.09 
 
 
460 aa  247  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164047  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0412  protein of unknown function DUF21  37.91 
 
 
459 aa  246  8e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29322  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5779  protein of unknown function DUF21  43.28 
 
 
468 aa  243  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3860  hypothetical protein  39.08 
 
 
453 aa  242  7.999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.188072  normal  0.0935065 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0445  protein of unknown function DUF21  37.45 
 
 
451 aa  241  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0534885  normal  0.0812429 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2179  protein of unknown function DUF21  37.73 
 
 
431 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05880  CBS domain-containing protein  39.51 
 
 
478 aa  239  9e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.927545 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0318  protein of unknown function DUF21  35.27 
 
 
496 aa  233  3e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.00000000206585  hitchhiker  0.00828276 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  33.1 
 
 
446 aa  234  3e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  35.32 
 
 
446 aa  229  7e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2949  protein of unknown function DUF21  38.02 
 
 
469 aa  229  9e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  35.97 
 
 
446 aa  228  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  32.35 
 
 
448 aa  227  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2206  hypothetical protein  30.86 
 
 
437 aa  226  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.287876  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2595  hypothetical protein  32.73 
 
 
476 aa  226  7e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2793  protein of unknown function DUF21  38.65 
 
 
464 aa  222  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  33.02 
 
 
437 aa  221  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  35.01 
 
 
442 aa  219  6e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  36.5 
 
 
433 aa  219  6e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3115  hypothetical protein  34.83 
 
 
456 aa  219  6e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0519  hypothetical protein  31.81 
 
 
432 aa  216  7e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0522  hypothetical protein  32.34 
 
 
432 aa  216  9e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0519  hypothetical protein  31.81 
 
 
432 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  32.03 
 
 
432 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0664  CBS domain protein  31.88 
 
 
432 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7650000000000002e-36 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0389  hypothetical protein  36.39 
 
 
438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  29.63 
 
 
442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  29.59 
 
 
440 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  33.57 
 
 
430 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  29.4 
 
 
442 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  29.4 
 
 
442 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  31.34 
 
 
435 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  29.4 
 
 
442 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  29.4 
 
 
442 aa  213  7e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0735  CBS domain protein  32.03 
 
 
432 aa  213  7e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0646  magnesium and cobalt efflux protein CorC  31.81 
 
 
432 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0238417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  31.34 
 
 
435 aa  212  9e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  31.34 
 
 
435 aa  212  9e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  31.34 
 
 
435 aa  212  9e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  31.34 
 
 
435 aa  212  9e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  29.4 
 
 
442 aa  212  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1910  hypothetical protein  31.04 
 
 
435 aa  212  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  29.4 
 
 
442 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  31.11 
 
 
435 aa  212  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  29.17 
 
 
442 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0525  hypothetical protein  30.18 
 
 
441 aa  211  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.806161  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1913  CBS domain-containing protein  31.11 
 
 
435 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.378516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2059  CBS domain-containing protein  31.11 
 
 
435 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0015  protein of unknown function DUF21  36.87 
 
 
450 aa  209  6e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.309554  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2128  CBS domain-containing protein  30.73 
 
 
435 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.695041  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  30.05 
 
 
434 aa  208  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  28.9 
 
 
440 aa  207  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  29.48 
 
 
435 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2966  protein of unknown function DUF21  33.49 
 
 
439 aa  206  9e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4692  magnesium and cobalt efflux protein CorC  31.7 
 
 
425 aa  206  9e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.200662  hitchhiker  0.0000000000000291685 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1770  protein of unknown function DUF21  30.39 
 
 
444 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0703  protein of unknown function DUF21  30.58 
 
 
477 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.401824 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4410  protein of unknown function DUF21  33.04 
 
 
444 aa  204  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>