79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5325 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5325  protein of unknown function DUF75  100 
 
 
298 aa  594  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1658  protein of unknown function DUF75  59.4 
 
 
304 aa  346  3e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14850  ATP-grasp superfamily enzyme  58.14 
 
 
307 aa  330  2e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6868  hypothetical protein  54.24 
 
 
302 aa  315  7e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3749  hypothetical protein  55.93 
 
 
301 aa  315  8e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0709366  normal  0.107675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5648  protein of unknown function DUF75  54.39 
 
 
307 aa  311  8e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.424673 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1737  hypothetical protein  54.88 
 
 
306 aa  305  6e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226503  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1722  hypothetical protein  54.88 
 
 
306 aa  302  4e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.000637714 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2326  hypothetical protein  50.85 
 
 
301 aa  301  9e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.402322 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0926  hypothetical protein  51.83 
 
 
313 aa  300  3e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5208  hypothetical protein  51.18 
 
 
307 aa  289  4e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00169383  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2427  protein of unknown function DUF75  56.99 
 
 
315 aa  282  4e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175054  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1247  hypothetical protein  50.33 
 
 
312 aa  278  7e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0984474 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2446  hypothetical protein  52.13 
 
 
329 aa  278  9e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.211453 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3951  hypothetical protein  51.24 
 
 
330 aa  276  3e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.731534 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1579  protein of unknown function DUF75  51.32 
 
 
314 aa  273  3e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2219  hypothetical protein  48.33 
 
 
334 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.849197  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2173  hypothetical protein  48.33 
 
 
334 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2162  hypothetical protein  48.33 
 
 
334 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530975  hitchhiker  0.00210211 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2852  hypothetical protein  48.68 
 
 
311 aa  267  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22940  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  46.73 
 
 
312 aa  266  3e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.15902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4966  protein of unknown function DUF75  46.67 
 
 
304 aa  266  3e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0798  protein of unknown function DUF75  48.01 
 
 
319 aa  262  6e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1266  protein of unknown function DUF75  50.17 
 
 
312 aa  259  4e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.825703  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0028  hypothetical protein  47.67 
 
 
310 aa  259  4e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12728  hypothetical protein  49.83 
 
 
324 aa  256  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2127  protein of unknown function DUF75  50 
 
 
316 aa  250  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1509  protein of unknown function DUF75  46.78 
 
 
311 aa  238  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0466221  normal  0.187119 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1825  protein of unknown function DUF75  44.56 
 
 
311 aa  237  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2232  protein of unknown function DUF75  42.9 
 
 
342 aa  230  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.553046  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1060  protein of unknown function DUF75  44.64 
 
 
310 aa  224  2e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419014  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1614  hypothetical protein  42.14 
 
 
312 aa  220  2e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125325  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1608  protein of unknown function DUF75  41.14 
 
 
312 aa  214  1e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.05047e-11 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16730  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  38.93 
 
 
348 aa  196  4e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13300  Protein of unknown function DUF75  39.04 
 
 
318 aa  196  4e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00661171  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10660  Protein of unknown function DUF75  38.8 
 
 
325 aa  191  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.120435  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15610  Protein of unknown function DUF75  33.45 
 
 
353 aa  157  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1077  hypothetical protein  29.97 
 
 
299 aa  112  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.370003  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2210  protein of unknown function DUF75  29.93 
 
 
298 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2290  protein of unknown function DUF75  32.53 
 
 
286 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00121228  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22220  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  30.41 
 
 
290 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.737687 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3475  hypothetical protein  28.07 
 
 
296 aa  105  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5919  hypothetical protein  28.28 
 
 
284 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3162  hypothetical protein  28.72 
 
 
296 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3212  hypothetical protein  28.47 
 
 
296 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.550185  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3150  hypothetical protein  28.47 
 
 
296 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0142521  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2630  hypothetical protein  28.96 
 
 
282 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1855  hypothetical protein  28.42 
 
 
284 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.982924 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2444  protein of unknown function DUF75  27.4 
 
 
288 aa  102  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1826  hypothetical protein  29.27 
 
 
281 aa  102  9e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0638514  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3052  hypothetical protein  26.9 
 
 
292 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5826  protein of unknown function DUF75  27.53 
 
 
297 aa  99  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22756  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1842  protein of unknown function DUF75  30.6 
 
 
294 aa  98.6  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16230  Protein of unknown function DUF75  28.06 
 
 
269 aa  98.6  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5396  protein of unknown function DUF75  29.37 
 
 
302 aa  96.3  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  0.382515 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2670  protein of unknown function DUF75  28.37 
 
 
286 aa  95.1  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361609  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12157  hypothetical protein  26.67 
 
 
292 aa  94  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00120164  normal  0.853503 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4500  hypothetical protein  27.97 
 
 
282 aa  94  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00701907 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2785  protein of unknown function DUF75  27.92 
 
 
286 aa  93.6  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  7.87132e-05  hitchhiker  7.05422e-05 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0888  protein of unknown function DUF75  24.41 
 
 
311 aa  93.2  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13900  ATP-grasp superfamily enzyme  28.04 
 
 
286 aa  90.9  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331595  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0447  hypothetical protein  24.45 
 
 
277 aa  90.9  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  1.6468e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2246  protein of unknown function DUF75  28.67 
 
 
283 aa  87  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640776  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2143  protein of unknown function DUF75  26.37 
 
 
301 aa  87.4  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0211773  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1480  protein of unknown function DUF75  29.08 
 
 
283 aa  87.4  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1548  protein of unknown function DUF75  27.08 
 
 
279 aa  84.3  2e-15  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal  0.218022 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20950  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  25.09 
 
 
306 aa  84.3  2e-15  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4890  hypothetical protein  28.22 
 
 
280 aa  82.8  6e-15  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.0846818 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2009  protein of unknown function DUF75  27.68 
 
 
285 aa  80.5  3e-14  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.547664  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2324  hypothetical protein  25.09 
 
 
289 aa  79.7  5e-14  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.102651  decreased coverage  0.000172466 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2169  hypothetical protein  27.66 
 
 
301 aa  79.3  7e-14  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0362139  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2640  hypothetical protein  27.37 
 
 
280 aa  79.3  7e-14  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512604  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2170  hypothetical protein  25.89 
 
 
289 aa  79.3  8e-14  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260059  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1173  hypothetical protein  26.35 
 
 
283 aa  78.2  1e-13  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1912  protein of unknown function DUF75  26.87 
 
 
301 aa  74.3  2e-12  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83665e-10 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1837  protein of unknown function DUF75  29.39 
 
 
284 aa  74.7  2e-12  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11820  ATP-grasp superfamily enzyme  27.61 
 
 
316 aa  70.1  4e-11  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0485047  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1196  protein of unknown function DUF75  24.19 
 
 
296 aa  68.6  1e-10  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00179103  normal  0.0638399 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3209  hypothetical protein  22.31 
 
 
312 aa  55.1  1e-06  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>