270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5321 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  100 
 
 		 426 aa  868    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  49.08 
 
 		 423 aa  390  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  60.08 
 
 		 283 aa  311  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  57.94 
 
 		 289 aa  301  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  52.42 
 
 		 627 aa  250  3e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  51.19 
 
 		 588 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  51.04 
 
 		 291 aa  238  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  47.64 
 
 		 641 aa  238  1e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  47.64 
 
 		 642 aa  238  1e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  48.06 
 
 		 282 aa  235  9e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  48.18 
 
 		 281 aa  226  7e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  44.1 
 
 		 279 aa  225  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  46.22 
 
 		 1290 aa  224  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  44.88 
 
 		 288 aa  216  5.9999999999999996e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  46.15 
 
 		 569 aa  202  8e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  42.69 
 
 		 1321 aa  193  5e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  36.05 
 
 		 446 aa  192  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  40.78 
 
 		 286 aa  187  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  37.41 
 
 		 409 aa  187  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  42.02 
 
 		 883 aa  186  7e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  40.07 
 
 		 274 aa  186  8e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  43.53 
 
 		 389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  43.82 
 
 		 383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  38.82 
 
 		 252 aa  184  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  42.69 
 
 		 633 aa  180  4e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  37.24 
 
 		 276 aa  180  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  36.47 
 
 		 394 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  39.17 
 
 		 328 aa  176  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  40.71 
 
 		 556 aa  172  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  40.81 
 
 		 269 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  40 
 
 		 742 aa  169  7e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  39.1 
 
 		 260 aa  169  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  40.3 
 
 		 1028 aa  166  8e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  37.16 
 
 		 330 aa  164  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  38.58 
 
 		 469 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.55 
 
 		 261 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  37.88 
 
 		 384 aa  160  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  32.19 
 
 		 503 aa  160  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  38.04 
 
 		 1332 aa  158  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  34.92 
 
 		 291 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  38.13 
 
 		 271 aa  157  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.27 
 
 		 815 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  39.61 
 
 		 752 aa  155  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.12 
 
 		 532 aa  152  8e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  39 
 
 		 286 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.76 
 
 		 1694 aa  151  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  35.43 
 
 		 301 aa  150  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.2 
 
 		 358 aa  150  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  37.69 
 
 		 427 aa  147  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.53 
 
 		 912 aa  145  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  33.22 
 
 		 346 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.4 
 
 		 315 aa  140  4.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  34.22 
 
 		 1059 aa  140  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  51.67 
 
 		 634 aa  140  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.46 
 
 		 306 aa  139  7e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.52 
 
 		 884 aa  139  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  33.54 
 
 		 694 aa  138  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  35.63 
 
 		 1441 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  38.21 
 
 		 238 aa  137  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.33 
 
 		 819 aa  134  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  52.07 
 
 		 522 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.57 
 
 		 328 aa  131  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  50.42 
 
 		 1072 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.88 
 
 		 290 aa  128  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  33.23 
 
 		 464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  48.39 
 
 		 414 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  32.27 
 
 		 306 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  34.13 
 
 		 1918 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  45.97 
 
 		 488 aa  121  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  48.76 
 
 		 452 aa  120  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  34.41 
 
 		 470 aa  120  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2739  glycoside hydrolase family protein  36.02 
 
 		 308 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  47.15 
 
 		 417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  32.7 
 
 		 479 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  37.31 
 
 		 320 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.88 
 
 		 933 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  34.63 
 
 		 275 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  33.09 
 
 		 479 aa  116  8.999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.82 
 
 		 547 aa  115  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  33.92 
 
 		 405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3954  glycoside hydrolase family 16  32.36 
 
 		 318 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.913325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  44.54 
 
 		 492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  45.38 
 
 		 890 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  46.72 
 
 		 732 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  47.54 
 
 		 384 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  46.67 
 
 		 496 aa  113  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  31.02 
 
 		 313 aa  113  8.000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  43.7 
 
 		 516 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  42.86 
 
 		 803 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  33.72 
 
 		 286 aa  109  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  45.08 
 
 		 373 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  44.26 
 
 		 1128 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0284  glycoside hydrolase family 16  35.46 
 
 		 256 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  39.84 
 
 		 492 aa  107  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  40.3 
 
 		 1207 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  40 
 
 		 469 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  42.11 
 
 		 548 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  42.02 
 
 		 801 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  42.61 
 
 		 489 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  37.72 
 
 		 608 aa  103  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>