More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5281 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 391 aa  781    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  66.05 
 
 		 394 aa  497  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6326  signal transduction histidine kinase, LytS  65.28 
 
 		 398 aa  486  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3173  signal transduction histidine kinase, LytS  65 
 
 		 411 aa  476  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0466454  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0358  histidine kinase internal region  62.67 
 
 		 374 aa  442  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3378  signal transduction histidine kinase, LytS  64.89 
 
 		 394 aa  431  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4493  histidine kinase internal region  60.32 
 
 		 408 aa  418  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal  0.320157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2761  signal transduction histidine kinase, LytS  60.97 
 
 		 394 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1394  signal transduction histidine kinase, LytS  58.13 
 
 		 393 aa  402  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000264266 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1376  signal transduction histidine kinase, LytS  57.1 
 
 		 405 aa  397  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0069  signal transduction histidine kinase, LytS  57.26 
 
 		 400 aa  392  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0746502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5007  signal transduction histidine kinase, LytS  58.78 
 
 		 408 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131071  decreased coverage  0.00000540633 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1329  signal transduction histidine kinase LytS  54.65 
 
 		 432 aa  346  3e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268235  normal  0.0194209 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1152  signal transduction histidine kinase, LytS  50 
 
 		 394 aa  339  5.9999999999999996e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4559  signal transduction histidine kinase, LytS  52.89 
 
 		 409 aa  333  3e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0064  signal transduction histidine kinase, LytS  48.55 
 
 		 428 aa  332  6e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2144  signal transduction histidine kinase, LytS  52.12 
 
 		 408 aa  330  3e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0137321  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4050  signal transduction histidine kinase, LytS  53.55 
 
 		 403 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4125  signal transduction histidine kinase, LytS  53.55 
 
 		 403 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489404  normal  0.628392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4279  signal transduction histidine kinase, LytS  53.55 
 
 		 403 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0700  histidine kinase internal region  51.06 
 
 		 402 aa  320  3e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00850  putative regulator of cell autolysis  44.19 
 
 		 428 aa  278  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.432322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2857  ATP-binding region, ATPase-like  45.11 
 
 		 363 aa  263  3e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  39.53 
 
 		 446 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  39.83 
 
 		 450 aa  256  4e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  39.22 
 
 		 465 aa  252  6e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  37.47 
 
 		 455 aa  248  9e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4128  signal transduction histidine kinase, LytS  47.21 
 
 		 338 aa  246  4e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  33.77 
 
 		 578 aa  236  5.0000000000000005e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  36.8 
 
 		 426 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  36.2 
 
 		 576 aa  231  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12150  putative regulator of cell autolysis  43.24 
 
 		 325 aa  225  9e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  37.31 
 
 		 576 aa  223  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0899  signal transduction histidine kinase, LytS  38.04 
 
 		 572 aa  215  9e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144133  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  34.92 
 
 		 568 aa  208  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0160  ATP-binding region, ATPase-like  34.25 
 
 		 567 aa  196  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  34.26 
 
 		 580 aa  196  7e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1225  signal transduction histidine kinase, LytS  34.05 
 
 		 603 aa  194  3e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.247489 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0377  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  31.09 
 
 		 576 aa  187  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2958  signal transduction histidine kinase, LytS  32.75 
 
 		 568 aa  185  9e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.177996  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1441  signal transduction histidine kinase, LytS  32.57 
 
 		 559 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5383  sensor histidine kinase LytS  31.94 
 
 		 522 aa  184  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.498572  normal  0.326696 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2792  signal transduction histidine kinase, LytS  33.94 
 
 		 564 aa  184  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000275265  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5566  sensor histidine kinase LytS  31.94 
 
 		 589 aa  182  6e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5123  sensor histidine kinase  31.94 
 
 		 589 aa  182  7e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5138  sensor histidine kinase  31.94 
 
 		 589 aa  182  7e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5537  sensor histidine kinase LytS  31.94 
 
 		 589 aa  182  7e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5296  sensor histidine kinase LytS  31.94 
 
 		 589 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5692  sensor histidine kinase LytS  31.94 
 
 		 589 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5622  sensor histidine kinase LytS  31.94 
 
 		 589 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0276  signal transduction histidine kinase, LytS  30.67 
 
 		 561 aa  182  9.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5574  sensor histidine kinase LytS  31.67 
 
 		 589 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5235  signal transduction histidine kinase, LytS  33.24 
 
 		 589 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3959  signal transduction histidine kinase, LytS  31.48 
 
 		 591 aa  179  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0918  sensor histidine kinase  29.41 
 
 		 561 aa  177  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.817517 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4117  sensor histidine kinase  29.18 
 
 		 565 aa  176  6e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.645201 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4007  sensor histidine kinase  29.18 
 
 		 565 aa  176  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02055  predicted sensory kinase in two-component system with YehT  29.41 
 
 		 561 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02290  predicted sensory kinase in two-component system with YpdB  31.01 
 
 		 565 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1277  signal transduction histidine kinase, LytS  31.01 
 
 		 565 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1532  signal transduction histidine kinase, LytS  29.41 
 
 		 561 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.363202  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3612  sensor histidine kinase  31.01 
 
 		 559 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02251  hypothetical protein  31.01 
 
 		 565 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2532  sensor histidine kinase  31.01 
 
 		 559 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1521  signal transduction histidine kinase, LytS  29.41 
 
 		 561 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02013  hypothetical protein  29.41 
 
 		 561 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2670  sensor histidine kinase  31.01 
 
 		 559 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0222  signal transduction histidine kinase, LytS  30.75 
 
 		 561 aa  175  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2260  sensor histidine kinase  29.41 
 
 		 561 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1289  signal transduction histidine kinase, LytS  31.01 
 
 		 559 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2414  sensor histidine kinase  29.41 
 
 		 561 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2517  sensor histidine kinase  31.01 
 
 		 559 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0956  signal transduction histidine kinase, LytS  28.34 
 
 		 563 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324121  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  29.22 
 
 		 572 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1324  signal transduction histidine kinase, LytS  33.25 
 
 		 433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0634382  hitchhiker  0.00226936 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2749  sensor histidine kinase  30.72 
 
 		 559 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3404  signal transduction histidine kinase, LytS  32.14 
 
 		 563 aa  173  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.823402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2919  signal transduction histidine kinase, LytS  31.21 
 
 		 565 aa  173  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  28.95 
 
 		 572 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0866  sensor histidine kinase  29.41 
 
 		 561 aa  173  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3113  sensor histidine kinase  29.14 
 
 		 561 aa  173  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.212432 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0146  signal transduction histidine kinase, LytS  28.91 
 
 		 565 aa  173  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889074  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00985  hypothetical protein  28.38 
 
 		 556 aa  172  7.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1480  signal transduction histidine kinase, LytS  27.76 
 
 		 557 aa  172  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336148  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0245  signal transduction histidine kinase, LytS  28.57 
 
 		 584 aa  172  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0251  5TM Receptors of the LytS-YhcK type transmembrane region  28.57 
 
 		 584 aa  172  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4588  signal transduction histidine kinase, LytS  29.37 
 
 		 561 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2398  sensor histidine kinase  28.88 
 
 		 561 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2394  sensor histidine kinase  28.88 
 
 		 561 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2305  sensor histidine kinase  28.88 
 
 		 561 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2349  sensor histidine kinase  28.88 
 
 		 561 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1084  histidine kinase internal region  29.6 
 
 		 575 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0370265  normal  0.975996 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2094  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase internal region:5TM Receptors of the LytS-YhcK type, transmembrane region  30.03 
 
 		 577 aa  169  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2506  sensor histidine kinase  28.88 
 
 		 561 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2024  sensor histidine kinase LytS  28.02 
 
 		 591 aa  168  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  30.32 
 
 		 557 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004413  autolysin sensor kinase  27.81 
 
 		 556 aa  168  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2882  signal transduction histidine kinase, LytS  27.27 
 
 		 558 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0010106  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3169  signal transduction histidine kinase, LytS  32.9 
 
 		 560 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0058  signal transduction histidine kinase, LytS  30.32 
 
 		 557 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>