More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5280 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5280  Na+/solute symporter  100 
 
 		 573 aa  1100    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135801  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3170  Na+/solute symporter  64.07 
 
 		 575 aa  618  1e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0609078  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3375  Na+/solute symporter  60.49 
 
 		 580 aa  591  1e-167  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5011  Na+/solute symporter  56.08 
 
 		 546 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410087 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4497  Na+/solute symporter  57.32 
 
 		 546 aa  509  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108837  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4282  Na+/solute symporter  53.09 
 
 		 578 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4053  Na+/solute symporter  53.09 
 
 		 578 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4128  Na+/solute symporter  53.09 
 
 		 578 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0931478  normal  0.469675 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4562  Na+/solute symporter  53.16 
 
 		 580 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2141  Na+/solute symporter  52.88 
 
 		 580 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.598944  normal  0.213031 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0697  Na+/solute symporter  52.62 
 
 		 580 aa  453  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0069  Na+/solute symporter  48.85 
 
 		 603 aa  446  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4131  Na+/solute symporter  47.4 
 
 		 551 aa  422  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1063  Na+/solute symporter  50.45 
 
 		 614 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0264456  normal  0.304939 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00890  predicted symporter  44.58 
 
 		 579 aa  394  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12120  predicted symporter  44.41 
 
 		 591 aa  394  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2860  putative transmembrane transport protein  44.63 
 
 		 562 aa  384  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00253612  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6322  SSS sodium solute transporter superfamily  63.6 
 
 		 499 aa  322  9.000000000000001e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.950827  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2131  Na+/solute symporter  62.17 
 
 		 492 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0355  Na+/solute symporter  69.65 
 
 		 505 aa  273  8.000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1373  Na+/solute symporter  53.87 
 
 		 498 aa  249  1e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1391  Na+/solute symporter  53.16 
 
 		 488 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000394975 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1155  Na+/solute symporter  64.92 
 
 		 495 aa  224  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1570  Na+/solute symporter  40.48 
 
 		 693 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2096  Na+/solute symporter  30.95 
 
 		 590 aa  162  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.566252  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2764  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  48.98 
 
 		 518 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0739  Na+/solute symporter  24.91 
 
 		 584 aa  157  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000119238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0319  Na+/solute symporter  29.43 
 
 		 566 aa  157  7e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  0.0129001 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3139  Na+ symporter  28.75 
 
 		 637 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0525  Na+/solute symporter  27.59 
 
 		 573 aa  150  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2352  sodium/solute symporter family protein  26.25 
 
 		 584 aa  150  8e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1397  SSS sodium solute transporter superfamily  25.63 
 
 		 665 aa  150  8e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1379  acetate permease  28.99 
 
 		 574 aa  144  4e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.644113  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1068  sodium/solute symporter family protein  26.83 
 
 		 584 aa  143  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272224  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2431  acetate permease  27.5 
 
 		 577 aa  141  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.157146  normal  0.21776 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1936  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.14 
 
 		 672 aa  139  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1865  putative sodium symporter protein  29.59 
 
 		 592 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151601  normal  0.340772 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0912  acetate permease  26.67 
 
 		 552 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2228  Na+/solute symporter  28.39 
 
 		 683 aa  134  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3111  solute/Na+ symporter  30.14 
 
 		 672 aa  134  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392033  decreased coverage  0.0000204813 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1696  Na+/solute symporter  26.78 
 
 		 572 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1608  acetate permease  25.49 
 
 		 552 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0958  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.81 
 
 		 570 aa  133  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.483778 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1418  Na+/solute symporter  29.39 
 
 		 672 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181341 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1980  Na+/solute symporter  27.52 
 
 		 576 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1449  acetate permease  28.82 
 
 		 574 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.463386  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4211  acetate permease  27.71 
 
 		 571 aa  132  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.31095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0683  acetate permease  26.67 
 
 		 552 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2269  Na+/solute symporter  27.52 
 
 		 683 aa  130  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0596593  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1070  sodium/solute symporter family protein  25.24 
 
 		 584 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00394385  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3879  acetate permease  27.71 
 
 		 576 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.262245  normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3142  acetate permease  27.71 
 
 		 576 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1774  Na+/solute symporter  27.62 
 
 		 687 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2828  putative sodium/solute symporter  26.03 
 
 		 567 aa  128  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2098  SSS sodium solute transporter superfamily  27.8 
 
 		 687 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1951  solute:Na+ symporter permease transmembrane protein  28.39 
 
 		 688 aa  125  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.788395  normal  0.806133 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0245  SSS sodium solute transporter superfamily  28.01 
 
 		 729 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2015  sodium:solute symporter family protein  29.09 
 
 		 671 aa  125  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168656  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2264  Na+/solute symporter  30.68 
 
 		 722 aa  124  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152914 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2647  SSS sodium solute transporter superfamily  26.21 
 
 		 681 aa  124  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.81017  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1628  Na+/solute symporter  30.35 
 
 		 722 aa  123  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0263  Na+/solute symporter  28.49 
 
 		 572 aa  123  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03080  SSS sodium solute transporter  30.17 
 
 		 528 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1637  Na+/solute symporter  26.21 
 
 		 678 aa  120  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.75635 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1746  Na+/solute symporter  27.62 
 
 		 572 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905196 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1087  Na+/solute symporter  28.6 
 
 		 671 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.215072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5518  Na+/solute symporter  27.8 
 
 		 671 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2831  Na+/solute symporter  26.17 
 
 		 703 aa  119  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0532  solute/sodium symporter (SSS) family protein  28.88 
 
 		 671 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3462  Na+/solute symporter  30.66 
 
 		 719 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141049  normal  0.192987 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3155  ribonuclease E and G  27.97 
 
 		 589 aa  118  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  35.59 
 
 		 516 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1075  SSS sodium solute transporter superfamily  30.15 
 
 		 546 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.099805  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1547  Na+/solute symporter  25.58 
 
 		 572 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  37.28 
 
 		 513 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  37.28 
 
 		 516 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  36.69 
 
 		 516 aa  115  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  37.28 
 
 		 516 aa  115  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  37.28 
 
 		 516 aa  115  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  37.28 
 
 		 516 aa  115  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  37.28 
 
 		 516 aa  115  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  37.28 
 
 		 516 aa  115  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  37.28 
 
 		 516 aa  115  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  37.28 
 
 		 516 aa  115  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  37.28 
 
 		 516 aa  115  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2638  Na+/solute symporter  29.35 
 
 		 578 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1711  Na+/solute symporter  28.84 
 
 		 578 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.18634  hitchhiker  0.000000238348 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2673  Na+/solute symporter  29.35 
 
 		 578 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2752  Na+/solute symporter  28.63 
 
 		 578 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1420  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.14 
 
 		 659 aa  114  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140042  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2260  acetate permease  28.88 
 
 		 561 aa  114  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.081454  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12100  SSS sodium solute transporter  29.62 
 
 		 532 aa  114  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2874  acetate permease  28.88 
 
 		 561 aa  114  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2885  acetate permease  28.88 
 
 		 561 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.360969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1523  sodium/solute symporter family protein  27.84 
 
 		 572 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0219  SSS sodium solute transporter superfamily  29.17 
 
 		 552 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1967  SSS sodium solute transporter superfamily  28.43 
 
 		 552 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.732438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1542  SSS sodium solute transporter superfamily  26.11 
 
 		 577 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000862893  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3696  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.63 
 
 		 582 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3039  Na+/solute symporter  27.68 
 
 		 703 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>