256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5215 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  100 
 
 
450 aa  882    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  37.41 
 
 
466 aa  259  6e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  37.65 
 
 
465 aa  252  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  37.29 
 
 
466 aa  249  5e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2848  aminopeptidase  35.37 
 
 
457 aa  249  9e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000136315 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  37.68 
 
 
466 aa  248  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  37.44 
 
 
466 aa  247  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  37.89 
 
 
466 aa  246  4e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  37.89 
 
 
466 aa  246  4e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5675  peptidase M28  35.75 
 
 
457 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00555231 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  36.34 
 
 
466 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  37.65 
 
 
466 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  37.65 
 
 
466 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  36.1 
 
 
466 aa  242  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  32.52 
 
 
584 aa  218  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1537  peptidase M28  28.6 
 
 
571 aa  152  8.999999999999999e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000191422 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  29.18 
 
 
518 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  30.88 
 
 
515 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3548  aminopeptidase Y  28.64 
 
 
555 aa  114  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0650469 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  28.26 
 
 
536 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.394851 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2223  putative aminopeptidase  29.12 
 
 
535 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  28.49 
 
 
512 aa  99  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1408  aminopeptidase Y  33.46 
 
 
518 aa  98.2  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  31.3 
 
 
391 aa  97.1  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  29.65 
 
 
534 aa  97.1  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  32.66 
 
 
502 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1367  aminopeptidase Y  33.09 
 
 
519 aa  95.5  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.227193  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  33.21 
 
 
512 aa  94  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2343  Aminopeptidase Y  28.33 
 
 
512 aa  94  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.362822  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89245  Aminopeptidase yscIII Transferrin receptor  30.11 
 
 
533 aa  93.2  8e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  35.19 
 
 
503 aa  92.4  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  32.02 
 
 
947 aa  91.7  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0715  aminopeptidase Y  32.08 
 
 
502 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0168155 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0793  Aminopeptidase Y  33.05 
 
 
514 aa  89.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01630  aminopeptidase Y  29.33 
 
 
509 aa  89.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.777606  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  30.8 
 
 
513 aa  88.6  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1182  Aminopeptidase Y  30.92 
 
 
481 aa  89  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0754  Aminopeptidase S  30 
 
 
512 aa  88.2  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1604  peptidase M28  35.81 
 
 
291 aa  87  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10423  lipoprotein aminopeptidase lpqL  37.82 
 
 
500 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0596975  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0141  Aminopeptidase Y  32.56 
 
 
506 aa  85.9  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  33.95 
 
 
333 aa  85.1  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4953  Aminopeptidase Y  31.88 
 
 
312 aa  84  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000539028  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0190  aminopeptidase Y  29.84 
 
 
510 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  40.16 
 
 
539 aa  82  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0141  peptidase M28  32.27 
 
 
524 aa  82  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.481582 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03918  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00220)  27.03 
 
 
502 aa  81.3  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0943032 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3786  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  32.6 
 
 
1131 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550121  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0189  aminopeptidase Y  28.91 
 
 
488 aa  80.1  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0809  peptidase M28  37.5 
 
 
625 aa  80.1  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0554  aminopeptidase Y  28.63 
 
 
479 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293801  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3155  peptidase M28  31.67 
 
 
436 aa  79.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000680764  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0566  aminopeptidase Y  28.63 
 
 
479 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0537512 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0716  aminopeptidase Y  31.79 
 
 
488 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.841416  normal  0.0176108 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0544  aminopeptidase Y  28.63 
 
 
479 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.282981  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3913  Aminopeptidase Y  28.94 
 
 
512 aa  79  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  29.49 
 
 
1147 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5720  peptidase M28  28.44 
 
 
313 aa  76.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311136  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5560  peptidase M28  31.46 
 
 
437 aa  75.5  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2070  peptidase M28  28.51 
 
 
309 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  30.35 
 
 
775 aa  74.7  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  43.56 
 
 
548 aa  74.3  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0553  aminopeptidase Y  30.2 
 
 
501 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0565  aminopeptidase Y  30.2 
 
 
501 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0543  aminopeptidase Y  30.2 
 
 
501 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.207964  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0319  peptidase M28  27.34 
 
 
416 aa  73.9  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  31 
 
 
544 aa  73.9  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  29 
 
 
1077 aa  73.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1065  peptidase M28  29.5 
 
 
455 aa  72.4  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.377443  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  30.96 
 
 
574 aa  72.4  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2681  peptidase M28  29.19 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2040  peptidase M28  32.41 
 
 
578 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194253  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1976  peptidase M28  45.88 
 
 
347 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.242432  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  29.38 
 
 
491 aa  69.3  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  35.17 
 
 
552 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4664  peptidase M28  37.5 
 
 
526 aa  67.4  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062927  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  22.64 
 
 
487 aa  67.4  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  32.46 
 
 
338 aa  67  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0754  peptidase M28  41.77 
 
 
339 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.050482 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  31.51 
 
 
1247 aa  64.7  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  31.64 
 
 
526 aa  64.3  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  25.79 
 
 
462 aa  64.3  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3990  peptidase M28  29.29 
 
 
447 aa  63.2  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.558433  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1190  peptidase M28  31.86 
 
 
629 aa  63.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.909659  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2866  hypothetical protein  28.27 
 
 
401 aa  62.4  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2729  hypothetical protein  27.75 
 
 
401 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  33.79 
 
 
525 aa  61.2  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  24.73 
 
 
497 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  27.27 
 
 
346 aa  60.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1748  peptidase M28  26.5 
 
 
430 aa  60.5  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0419  hypothetical protein  38.53 
 
 
647 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0487  putative leucine aminopeptidase  28.07 
 
 
408 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2124  aminopeptidase  28.07 
 
 
408 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6133  peptidase M28  27.93 
 
 
461 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4460  aminopeptidase  30.1 
 
 
794 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000347887  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0694  putative leucine aminopeptidase  28.07 
 
 
384 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.832714  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0990  putative leucine aminopeptidase  28.07 
 
 
384 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1962  putative leucine aminopeptidase  28.07 
 
 
384 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0845  peptidase family protein  28.07 
 
 
384 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.292004  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0757  peptidase family protein  27.63 
 
 
408 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>