More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5206 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2175  excinuclease ABC, C subunit  64.33 
 
 
693 aa  805    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1947  excinuclease ABC, C subunit  63.82 
 
 
670 aa  808    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122446  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  63.01 
 
 
708 aa  795    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11300  excinuclease ABC subunit C  58.28 
 
 
643 aa  728    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222126  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3715  excinuclease ABC subunit C  69.22 
 
 
678 aa  892    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  71.43 
 
 
671 aa  926    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13070  Excinuclease ABC subunit C  59.17 
 
 
651 aa  703    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15160  Excinuclease ABC subunit C  56.46 
 
 
650 aa  687    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3014  excinuclease ABC, C subunit  61.93 
 
 
675 aa  780    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  100 
 
 
649 aa  1306    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6042  excinuclease ABC, C subunit  64.8 
 
 
649 aa  815    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  61.5 
 
 
656 aa  774    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1544  excinuclease ABC, C subunit  62.34 
 
 
659 aa  769    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.519608  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11449  excinuclease ABC subunit C  69.64 
 
 
646 aa  877    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.185294 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2796  excinuclease ABC, C subunit  67.12 
 
 
679 aa  869    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172579  decreased coverage  0.00000392618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5613  excinuclease ABC, C subunit  64.54 
 
 
663 aa  797    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143768  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1633  excinuclease ABC subunit C  65.29 
 
 
705 aa  828    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.860828  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2935  excinuclease ABC subunit C  61.94 
 
 
704 aa  769    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2042  excinuclease ABC, C subunit  72.01 
 
 
690 aa  876    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  75.57 
 
 
658 aa  978    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3337  excinuclease ABC subunit C  66.11 
 
 
660 aa  848    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0998705  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1997  excinuclease ABC subunit C  65.7 
 
 
644 aa  789    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.657306 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2697  excinuclease ABC subunit C  71.08 
 
 
678 aa  916    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2395  excinuclease ABC subunit C  70.26 
 
 
676 aa  897    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2059  excinuclease ABC subunit C  67.21 
 
 
692 aa  846    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373675  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2436  excinuclease ABC subunit C  70.26 
 
 
676 aa  896    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3109  excinuclease ABC subunit C  65.63 
 
 
665 aa  854    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.116982  normal  0.254629 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2194  excinuclease ABC, C subunit  61.63 
 
 
684 aa  758    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010209  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20070  Excinuclease ABC subunit C  63.09 
 
 
703 aa  776    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0431256  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2550  excinuclease ABC, C subunit  70.07 
 
 
675 aa  904    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.295738  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1252  excinuclease ABC, C subunit  57.57 
 
 
647 aa  734    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2082  excinuclease ABC subunit C  59 
 
 
669 aa  743    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0649427  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1110  excinuclease ABC subunit C  60.74 
 
 
641 aa  763    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.537728  normal  0.126972 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  64.36 
 
 
666 aa  811    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2442  excinuclease ABC subunit C  70.26 
 
 
676 aa  897    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1823  excinuclease ABC subunit C  57.06 
 
 
674 aa  730    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000135046 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0428  excinuclease ABC subunit C  44.9 
 
 
746 aa  597  1e-169  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0815  excinuclease ABC, C subunit  42.11 
 
 
780 aa  563  1.0000000000000001e-159  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  43.04 
 
 
624 aa  485  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  39.14 
 
 
607 aa  466  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  37.82 
 
 
625 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  39.16 
 
 
641 aa  456  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  40.71 
 
 
653 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  38.46 
 
 
685 aa  449  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  41.41 
 
 
611 aa  451  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0845  excinuclease ABC, C subunit  42.68 
 
 
620 aa  445  1e-123  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.866518  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  37.89 
 
 
669 aa  437  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  38.05 
 
 
604 aa  437  1e-121  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  36.25 
 
 
620 aa  436  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  39.06 
 
 
619 aa  434  1e-120  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  41.49 
 
 
613 aa  433  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  36.25 
 
 
620 aa  435  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  37.12 
 
 
607 aa  430  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  36.42 
 
 
613 aa  430  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  39.53 
 
 
588 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  38.62 
 
 
665 aa  432  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  36.81 
 
 
607 aa  426  1e-118  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4536  excinuclease ABC, C subunit  41.49 
 
 
647 aa  429  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00719023  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  38.59 
 
 
601 aa  424  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  36.49 
 
 
607 aa  419  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  38.51 
 
 
616 aa  416  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  39.38 
 
 
624 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  40.22 
 
 
607 aa  413  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  42.11 
 
 
622 aa  409  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1945  excinuclease ABC subunit C  40.98 
 
 
643 aa  409  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.892148  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  37.52 
 
 
627 aa  409  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  37.32 
 
 
629 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  41.08 
 
 
614 aa  409  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  36.57 
 
 
615 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  38.3 
 
 
638 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  36.7 
 
 
644 aa  400  9.999999999999999e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  40.22 
 
 
609 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  37.77 
 
 
627 aa  400  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  37.42 
 
 
625 aa  399  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  37.91 
 
 
617 aa  400  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  38.91 
 
 
628 aa  396  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  37.04 
 
 
613 aa  399  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0328  excinuclease ABC subunit C  35.36 
 
 
640 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.462253  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0046  excinuclease ABC subunit C  38.7 
 
 
629 aa  393  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.714841  hitchhiker  0.00962006 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10610  excinuclease ABC, C subunit  36.63 
 
 
666 aa  394  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1784  excinuclease ABC, C subunit  37.16 
 
 
737 aa  393  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10011  excinuclease ABC subunit C  35.36 
 
 
640 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.404154  normal  0.496638 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  36.72 
 
 
631 aa  393  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  36.19 
 
 
613 aa  392  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  37.83 
 
 
622 aa  390  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07090  excinuclease ABC, C subunit  35.99 
 
 
682 aa  388  1e-106  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.914637 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  34.08 
 
 
598 aa  388  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  38.77 
 
 
617 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  38.77 
 
 
617 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  38.31 
 
 
677 aa  388  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2859  excinuclease ABC subunit C  37.7 
 
 
623 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41177  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0644  excinuclease ABC subunit C  37.8 
 
 
631 aa  384  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1082  excinuclease ABC subunit C  38.19 
 
 
644 aa  384  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  38.76 
 
 
613 aa  384  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  36.38 
 
 
628 aa  384  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  37.8 
 
 
608 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1074  excinuclease ABC subunit C  38.02 
 
 
623 aa  382  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.969621  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  36.49 
 
 
599 aa  380  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  40.03 
 
 
615 aa  382  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  35.58 
 
 
628 aa  381  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>