More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5185 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 307 aa  613  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  66.23 
 
 		 326 aa  418  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  64.41 
 
 		 317 aa  392  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  61.33 
 
 		 308 aa  366  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  59 
 
 		 335 aa  366  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  63.64 
 
 		 333 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  63.64 
 
 		 333 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  63.64 
 
 		 310 aa  359  3e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2721  protoheme IX farnesyltransferase  61.33 
 
 		 313 aa  353  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3691  protoheme IX farnesyltransferase  60.54 
 
 		 313 aa  348  4e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.358596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6012  protoheme IX farnesyltransferase  57.38 
 
 		 317 aa  328  6e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00798701  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2521  protoheme IX farnesyltransferase  55.67 
 
 		 328 aa  326  3e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1979  protoheme IX farnesyltransferase  54.64 
 
 		 317 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.969251 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2973  protoheme IX farnesyltransferase  55.67 
 
 		 321 aa  318  5e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  53.53 
 
 		 312 aa  313  2.9999999999999996e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  57.8 
 
 		 289 aa  312  4.999999999999999e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  53.02 
 
 		 304 aa  312  5.999999999999999e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2160  protoheme IX farnesyltransferase  57.49 
 
 		 293 aa  311  1e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  55.02 
 
 		 328 aa  301  7.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  53.27 
 
 		 341 aa  301  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2075  protoheme IX farnesyltransferase  55.39 
 
 		 313 aa  298  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0259319  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  56.46 
 
 		 294 aa  298  1e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2060  protoheme IX farnesyltransferase  52.61 
 
 		 306 aa  296  3e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  52.63 
 
 		 317 aa  296  4e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11440  protoheme IX farnesyltransferase  53.16 
 
 		 326 aa  295  5e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0124066  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19930  protoheme IX farnesyltransferase  55.86 
 
 		 294 aa  295  8e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.440013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3088  protoheme IX farnesyltransferase  53.77 
 
 		 342 aa  293  4e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.604618  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2542  protoheme IX farnesyltransferase  51.32 
 
 		 314 aa  291  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.988716  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2098  protoheme IX farnesyltransferase  52.92 
 
 		 315 aa  289  3e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.562695  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2001  protoheme IX farnesyltransferase  53.33 
 
 		 325 aa  286  2e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0149749  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1839  protoheme IX farnesyltransferase  51.89 
 
 		 319 aa  283  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000154836 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2215  protoheme IX farnesyltransferase  54.55 
 
 		 328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125005  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1128  protoheme IX farnesyltransferase  54.33 
 
 		 307 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2921  protoheme IX farnesyltransferase  51.79 
 
 		 339 aa  280  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1933  protoheme IX farnesyltransferase  52.96 
 
 		 342 aa  278  1e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1265  protoheme IX farnesyltransferase  53.52 
 
 		 332 aa  271  1e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  42.67 
 
 		 317 aa  233  3e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  45.94 
 
 		 534 aa  226  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1711  protoheme IX farnesyltransferase  51.2 
 
 		 297 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  43.6 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  42.55 
 
 		 535 aa  216  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  41.46 
 
 		 323 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  41.46 
 
 		 323 aa  212  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  41 
 
 		 622 aa  211  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  45.3 
 
 		 302 aa  208  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  42.16 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3662  protoheme IX farnesyltransferase  46.67 
 
 		 586 aa  203  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  42.91 
 
 		 312 aa  202  8e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  40.71 
 
 		 328 aa  201  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  42.36 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2798  protoheme IX farnesyltransferase  41.52 
 
 		 472 aa  194  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  44.44 
 
 		 624 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  40.85 
 
 		 309 aa  192  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  39.67 
 
 		 324 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  41.14 
 
 		 443 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  39.6 
 
 		 312 aa  185  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  37.97 
 
 		 302 aa  185  1.0000000000000001e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  41.49 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1181  protoheme IX farnesyltransferase  41.26 
 
 		 482 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  39.66 
 
 		 318 aa  183  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  44.8 
 
 		 310 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  38.68 
 
 		 315 aa  182  6e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2302  protoheme IX farnesyltransferase  39.86 
 
 		 495 aa  182  6e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  38.85 
 
 		 303 aa  182  8.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2487  protoheme IX farnesyltransferase  37.5 
 
 		 478 aa  181  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.316472  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  42.11 
 
 		 306 aa  181  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0479  protoheme IX farnesyltransferase  41.76 
 
 		 294 aa  180  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  39.6 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  40.34 
 
 		 313 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  38.28 
 
 		 321 aa  179  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0270  protoheme IX farnesyltransferase  38.57 
 
 		 312 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.80654 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2852  protoheme IX farnesyltransferase  39.93 
 
 		 483 aa  178  9e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  38.01 
 
 		 301 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  40.43 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0455  protoheme IX farnesyltransferase  41.38 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0323  protoheme IX farnesyltransferase  36.7 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  37.63 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  39.73 
 
 		 325 aa  176  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3527  protoheme IX farnesyltransferase  38.68 
 
 		 306 aa  176  7e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.153236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2850  protoheme IX farnesyltransferase  38.68 
 
 		 306 aa  176  7e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  38.03 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4504  protoheme IX farnesyltransferase  42.34 
 
 		 345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0247  protoheme IX farnesyltransferase  36.84 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  37.99 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  37.67 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  38.13 
 
 		 295 aa  173  3.9999999999999995e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0372  protoheme IX farnesyltransferase  36.84 
 
 		 310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591826  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  38.41 
 
 		 328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  38.41 
 
 		 328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  39.2 
 
 		 300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0228  protoheme IX farnesyltransferase  36.49 
 
 		 313 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  41.22 
 
 		 296 aa  172  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04005  protoheme IX farnesyltransferase  39.51 
 
 		 305 aa  172  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  37.33 
 
 		 300 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  37.33 
 
 		 300 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  37.79 
 
 		 305 aa  172  5.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  37.33 
 
 		 300 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  37.37 
 
 		 300 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0031  protoheme IX farnesyltransferase  40.61 
 
 		 316 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823652  normal  0.697538 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  38.26 
 
 		 312 aa  172  9e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>