190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5177 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5177  protein of unknown function DUF885  100 
 
 		 543 aa  1082    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2501  putative lipoprotein  65.17 
 
 		 540 aa  670    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.137553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1391  protein of unknown function DUF885  54.33 
 
 		 583 aa  524  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2188  protein of unknown function DUF885  31.05 
 
 		 542 aa  258  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.667858 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1976  protein of unknown function DUF885  30.57 
 
 		 628 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0897671 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1237  protein of unknown function DUF885  25.35 
 
 		 602 aa  134  6e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157803  normal  0.118959 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2334  protein of unknown function DUF885  26.17 
 
 		 590 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000423863  normal  0.0462508 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2005  hypothetical protein  26.17 
 
 		 590 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0461311  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2053  hypothetical protein  26.17 
 
 		 590 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.807252  hitchhiker  0.000853258 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1990  hypothetical protein  26.17 
 
 		 590 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  27.53 
 
 		 625 aa  127  5e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1770  hypothetical protein  24.95 
 
 		 590 aa  125  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.989562  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2949  hypothetical protein  23.47 
 
 		 635 aa  124  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2167  hypothetical protein  24.75 
 
 		 596 aa  124  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.363343  normal  0.850087 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  28.97 
 
 		 622 aa  124  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2244  hypothetical protein  24.65 
 
 		 596 aa  123  9e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.81668  normal  0.576675 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  25.86 
 
 		 595 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  30.06 
 
 		 605 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2375  putative lipoprotein  24.75 
 
 		 596 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0787288 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  26 
 
 		 614 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  29.12 
 
 		 629 aa  121  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  24.72 
 
 		 614 aa  121  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  23.89 
 
 		 585 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27240  hypothetical protein  29.49 
 
 		 551 aa  121  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0417  protein of unknown function DUF885  28.01 
 
 		 581 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.974704 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  29.13 
 
 		 611 aa  120  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  26 
 
 		 614 aa  120  7e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2570  putative lipoprotein  24.6 
 
 		 592 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  30.29 
 
 		 628 aa  120  7.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  28.79 
 
 		 621 aa  120  9e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  31.14 
 
 		 619 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  25.75 
 
 		 614 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  26.2 
 
 		 607 aa  118  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  25.75 
 
 		 617 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  26.2 
 
 		 607 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  26.2 
 
 		 607 aa  117  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  24.32 
 
 		 627 aa  117  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5817  hypothetical protein  28.39 
 
 		 536 aa  117  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  27.64 
 
 		 587 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  23.67 
 
 		 616 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  26.98 
 
 		 611 aa  114  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  29.7 
 
 		 1283 aa  115  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1907  hypothetical protein  24.46 
 
 		 609 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000056708  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  22.45 
 
 		 615 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2237  hypothetical protein  23.88 
 
 		 590 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000589696  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  26.28 
 
 		 599 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  27.43 
 
 		 589 aa  113  9e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1222  protein of unknown function DUF885  34.05 
 
 		 546 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  25.72 
 
 		 608 aa  112  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2151  hypothetical protein  24.4 
 
 		 599 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0849922  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4531  hypothetical protein  26.75 
 
 		 582 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1935  hypothetical protein  23.95 
 
 		 592 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00034791  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0692  protein of unknown function DUF885  31.82 
 
 		 547 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  25.66 
 
 		 619 aa  111  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0768  protein of unknown function DUF885  34 
 
 		 593 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  27.91 
 
 		 609 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  33.04 
 
 		 607 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  27 
 
 		 609 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  29.08 
 
 		 609 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  27 
 
 		 609 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  23.5 
 
 		 616 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  27 
 
 		 609 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  23.5 
 
 		 616 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  28.22 
 
 		 609 aa  110  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  23.5 
 
 		 616 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  32.18 
 
 		 586 aa  109  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  28.5 
 
 		 633 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  29.58 
 
 		 628 aa  109  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  22.32 
 
 		 615 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  33.48 
 
 		 609 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  33.48 
 
 		 609 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  26 
 
 		 613 aa  108  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  33.48 
 
 		 611 aa  108  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  27.61 
 
 		 609 aa  108  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2293  hypothetical protein  24.95 
 
 		 591 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000993307  normal  0.679763 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  36.21 
 
 		 602 aa  108  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  34.3 
 
 		 603 aa  108  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2317  hypothetical protein  22.86 
 
 		 592 aa  108  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000037575  hitchhiker  0.00132048 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0408  protein of unknown function DUF885  31.91 
 
 		 610 aa  108  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  30.03 
 
 		 608 aa  107  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  34.3 
 
 		 591 aa  107  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  28.89 
 
 		 605 aa  107  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  30.47 
 
 		 608 aa  107  5e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  25.75 
 
 		 615 aa  107  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  34.88 
 
 		 601 aa  107  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  34.88 
 
 		 601 aa  107  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  34.88 
 
 		 601 aa  107  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  29.13 
 
 		 637 aa  107  7e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  33.62 
 
 		 611 aa  106  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  27.62 
 
 		 616 aa  107  8e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  34.88 
 
 		 601 aa  106  9e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  28.76 
 
 		 592 aa  106  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  22.22 
 
 		 615 aa  106  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  31.86 
 
 		 609 aa  106  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  34.68 
 
 		 599 aa  106  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  33.04 
 
 		 616 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  33.72 
 
 		 603 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  33.72 
 
 		 603 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  33.72 
 
 		 603 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  34.5 
 
 		 599 aa  105  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>