110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5168 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5168  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 322 aa  629  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251951  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16080  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  56.21 
 
 		 323 aa  302  4.0000000000000003e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2553  cytochrome oxidase assembly  53.31 
 
 		 304 aa  244  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2268  cytochrome oxidase assembly  45.62 
 
 		 337 aa  232  6e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00686495  normal  0.0860504 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2474  cytochrome oxidase assembly  50.76 
 
 		 342 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2429  cytochrome oxidase assembly  50.38 
 
 		 342 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2467  cytochrome oxidase assembly  50.19 
 
 		 342 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3684  cytochrome oxidase assembly  51.47 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2726  cytochrome oxidase assembly  50.73 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0568935  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6009  hypothetical protein  43.69 
 
 		 329 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00257584  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1977  cytochrome oxidase assembly  43.2 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.628163 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11484  antibiotic ABC transporter membrane protein  49.65 
 
 		 310 aa  185  7e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.802636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2430  cytochrome oxidase assembly  40.74 
 
 		 325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13300  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  44.87 
 
 		 287 aa  182  6e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0813876  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2514  cytochrome oxidase assembly  42.16 
 
 		 326 aa  182  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787939  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3312  cytochrome oxidase assembly  44.13 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000656603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2078  cytochrome oxidase assembly  44.14 
 
 		 351 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1653  cytochrome oxidase assembly  45.39 
 
 		 342 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2347  cytochrome oxidase assembly  42.09 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0173507  normal  0.0130822 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2217  cytochrome oxidase assembly  44.89 
 
 		 351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000899528  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3085  cytochrome oxidase assembly  44.19 
 
 		 326 aa  171  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734948  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2543  cytochrome oxidase assembly  42.21 
 
 		 305 aa  166  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0684946  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2249  cytochrome oxidase assembly  41.18 
 
 		 386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165994 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1135  cytochrome oxidase assembly  39.27 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2971  cytochrome oxidase assembly  41.64 
 
 		 370 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22000  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  42.59 
 
 		 313 aa  161  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.891794  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2061  cytochrome oxidase assembly  44.91 
 
 		 309 aa  159  8e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.603923  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2378  cytochrome oxidase assembly  39.12 
 
 		 337 aa  152  5.9999999999999996e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1133  cytochrome oxidase assembly  39.13 
 
 		 370 aa  150  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2099  cytochrome oxidase assembly  38.93 
 
 		 301 aa  150  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1666  cytochrome oxidase assembly  38.44 
 
 		 348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00799414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1353  cytochrome oxidase assembly  39.12 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1841  cytochrome oxidase assembly  38.14 
 
 		 314 aa  146  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355712 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1995  putative integral membrane transport protein  37.58 
 
 		 351 aa  142  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0193  cytochrome oxidase assembly  35.79 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14570  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  39.62 
 
 		 307 aa  135  9e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852831  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11450  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  34.36 
 
 		 338 aa  129  8.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.314019  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  33.93 
 
 		 331 aa  102  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3264  cytochrome oxidase assembly  37.89 
 
 		 298 aa  93.2  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  29.08 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  27.75 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  31.29 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  22.05 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  29.63 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  32.73 
 
 		 622 aa  59.7  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  28.39 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  29.79 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0296  cytochrome oxidase assembly  25.62 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300662  normal  0.0109948 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  30.4 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  34.96 
 
 		 313 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  34.96 
 
 		 313 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  33.09 
 
 		 307 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  27.27 
 
 		 285 aa  53.1  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  28.12 
 
 		 323 aa  52.4  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  26.99 
 
 		 363 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  24.69 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06105  cytochrome oxidase assembly protein  38.78 
 
 		 343 aa  51.2  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0109  cytochrome oxidase assembly  30.5 
 
 		 359 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.475032  normal  0.476439 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  29.05 
 
 		 335 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0126  cytochrome oxidase assembly  30.5 
 
 		 359 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1853  cytochrome oxidase assembly  30.37 
 
 		 317 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  26.62 
 
 		 327 aa  50.4  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  26.78 
 
 		 363 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0981  cytochrome oxidase assembly  25.77 
 
 		 319 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  28.57 
 
 		 335 aa  49.7  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  27.61 
 
 		 363 aa  49.3  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3858  cytochrome aa3 controlling protein  22.87 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3689  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  22.87 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3706  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  22.87 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.006652  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0072  cytochrome oxidase assembly  29.27 
 
 		 359 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4156  cytochrome aa3 controlling protein  22.87 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3993  cytochrome aa3 controlling protein  24.87 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0334  putative cytochrome aa3 oxidase assembly protein,related to CtaA  30.07 
 
 		 327 aa  48.5  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2601  putative cytochrome aa3 controlling protein  29.37 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.705731 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  25 
 
 		 325 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4064  cytochrome aa3 controlling protein  24.87 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.839964  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4049  cytochrome aa3 controlling protein  24.87 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1191  cytochrome aa3 controlling protein  24.87 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3961  cytochrome aa3 controlling protein  25.4 
 
 		 311 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0705  cytochrome oxidase assembly protein  24.44 
 
 		 302 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  33.33 
 
 		 383 aa  47.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  33.04 
 
 		 361 aa  47.8  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  29.41 
 
 		 404 aa  47.8  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1175  cytochrome oxidase assembly  20.92 
 
 		 356 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1197  cytochrome oxidase assembly  20.92 
 
 		 356 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  25.34 
 
 		 367 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1780  cytochrome oxidase assembly  32.71 
 
 		 304 aa  47  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3772  cytochrome oxidase assembly  23.92 
 
 		 311 aa  47  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161471  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  30.37 
 
 		 348 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1387  cytochrome oxidase assembly  35 
 
 		 407 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  30.49 
 
 		 369 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  36.26 
 
 		 392 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  26.96 
 
 		 327 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  26.88 
 
 		 373 aa  44.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1210  cytochrome oxidase assembly  29.91 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.294531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  30.16 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0527  cytochrome oxidase assembly  29.52 
 
 		 333 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0149  cytochrome oxidase assembly  30.89 
 
 		 345 aa  44.3  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04451  hypothetical protein  29.85 
 
 		 288 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.898486  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  30.84 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>