More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5162 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  100 
 
 		 312 aa  616  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  77.63 
 
 		 308 aa  470  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  66.56 
 
 		 338 aa  396  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  65.71 
 
 		 308 aa  394  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  64.72 
 
 		 319 aa  387  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  64.36 
 
 		 309 aa  385  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  64.36 
 
 		 310 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  64.36 
 
 		 310 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  64.36 
 
 		 310 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  63.49 
 
 		 302 aa  371  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  64.54 
 
 		 313 aa  369  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  60.32 
 
 		 314 aa  369  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  63.02 
 
 		 310 aa  366  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  59.8 
 
 		 308 aa  361  8e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  62.34 
 
 		 309 aa  360  2e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  66.09 
 
 		 388 aa  360  2e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  62.7 
 
 		 313 aa  350  2e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  63.73 
 
 		 374 aa  347  1e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  61.39 
 
 		 308 aa  340  1e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  58.96 
 
 		 304 aa  335  5e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  54.81 
 
 		 315 aa  310  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2919  ABC transporter related  60.33 
 
 		 334 aa  303  2.0000000000000002e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.748186  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1668  ABC transporter related protein  56.73 
 
 		 329 aa  294  2e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0326508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  50.33 
 
 		 311 aa  288  7e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  50.97 
 
 		 299 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2342  ABC transporter related  50.79 
 
 		 319 aa  253  3e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.2832 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1843  ABC transporter related  44.58 
 
 		 322 aa  250  3e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163971 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2101  ABC transporter related  44.58 
 
 		 322 aa  245  8e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  45.85 
 
 		 300 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  44.55 
 
 		 306 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  45.9 
 
 		 302 aa  238  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  44.19 
 
 		 302 aa  228  7e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  43.42 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  44.63 
 
 		 330 aa  218  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  43.33 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  39.34 
 
 		 305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  42.58 
 
 		 301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  39.02 
 
 		 305 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  42.95 
 
 		 331 aa  216  5e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14590  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.86 
 
 		 331 aa  215  8e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.294178  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  38.91 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  44.33 
 
 		 322 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  38.94 
 
 		 304 aa  211  9e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  43.85 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0191  ABC transporter related  44.85 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.668087  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  54.3 
 
 		 313 aa  209  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  53.25 
 
 		 297 aa  209  6e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  35.95 
 
 		 283 aa  209  7e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  36.3 
 
 		 305 aa  207  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  44.7 
 
 		 254 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  50.68 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  40.45 
 
 		 322 aa  206  6e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  35.97 
 
 		 301 aa  206  6e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  40.47 
 
 		 280 aa  205  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  43.51 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  35.86 
 
 		 308 aa  203  3e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  40.33 
 
 		 282 aa  202  7e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  44.67 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  43.52 
 
 		 314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  40.33 
 
 		 290 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  47.2 
 
 		 284 aa  200  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  39.29 
 
 		 306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  35.03 
 
 		 295 aa  198  9e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  42.17 
 
 		 301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  39.87 
 
 		 319 aa  196  5.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1677  ABC transporter, ATPase subunit  38.21 
 
 		 353 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  38.44 
 
 		 324 aa  193  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  39.49 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  41.31 
 
 		 256 aa  192  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  39.43 
 
 		 319 aa  192  5e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  34.3 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6786  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.74 
 
 		 322 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00659712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  39.35 
 
 		 310 aa  190  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  37.2 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3171  ABC transporter related  47.79 
 
 		 294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0428846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  42.03 
 
 		 302 aa  189  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  47.2 
 
 		 284 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  37.21 
 
 		 321 aa  187  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3531  ABC transporter related protein  39.02 
 
 		 319 aa  186  5e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33070  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.19 
 
 		 286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.468184  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  39.23 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  40.59 
 
 		 741 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11470  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.26 
 
 		 321 aa  183  3e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160218  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  40.4 
 
 		 276 aa  183  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3387  ABC transporter related  38.51 
 
 		 324 aa  183  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  39.24 
 
 		 310 aa  183  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  45.37 
 
 		 289 aa  182  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  40.2 
 
 		 300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7156  ABC transporter related protein  45.81 
 
 		 281 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.023596 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3162  ABC transporter related  38.83 
 
 		 324 aa  182  6e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0228051 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.87 
 
 		 308 aa  182  7e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  37.85 
 
 		 308 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  38.46 
 
 		 326 aa  182  9.000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  38.14 
 
 		 321 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3107  ABC transporter related protein  45.36 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  41.33 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.02 
 
 		 319 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  38.1 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2940  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.84 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.121696 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0144  ABC transporter related protein  40.66 
 
 		 300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.113236 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>