23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5159 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5159  Patatin  100 
 
 		 1320 aa  2555    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.51871  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2776  Patatin  39.59 
 
 		 1383 aa  345  4e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5555  patatin  36.99 
 
 		 954 aa  228  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1675  patatin family phospholipase  36.13 
 
 		 1153 aa  214  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160434  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2668  hypothetical protein  35.33 
 
 		 978 aa  211  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7272  patatin  33.73 
 
 		 1101 aa  134  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.341762  normal  0.239541 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0052  hypothetical protein  33.16 
 
 		 1142 aa  125  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2615  patatin  37.54 
 
 		 926 aa  125  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0888746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1147  patatin-related protein  35.12 
 
 		 818 aa  124  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0770474  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3961  Patatin  27.56 
 
 		 1056 aa  110  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1602  Patatin  26.96 
 
 		 1137 aa  96.7  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1052  patatin  26.23 
 
 		 1171 aa  96.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0045  Patatin  26.7 
 
 		 1107 aa  92.8  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.604758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13514  hypothetical protein  34.16 
 
 		 1031 aa  81.6  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.577448 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2051  hypothetical protein  26.76 
 
 		 773 aa  72.8  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.475949  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0742  patatin  26.29 
 
 		 816 aa  67.8  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.885952  normal  0.0715613 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0030  patatin  35.4 
 
 		 770 aa  57  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.491773  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3407  patatin-related protein  26.6 
 
 		 818 aa  56.6  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4091  patatin  39.47 
 
 		 774 aa  55.5  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1083  patatin  23.51 
 
 		 818 aa  55.1  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25380  Patatin-like phospholipase  24.94 
 
 		 825 aa  52.8  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.969394  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0553  Patatin  25.12 
 
 		 828 aa  46.6  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5025  Patatin  24.58 
 
 		 563 aa  45.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.71929  normal  0.155032 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>