More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5124 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5124  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
272 aa  546  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  65.56 
 
 
288 aa  360  1e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6199  alpha/beta hydrolase fold protein  50.75 
 
 
296 aa  244  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.82135  normal  0.298395 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3441  alpha/beta hydrolase fold  52.85 
 
 
309 aa  240  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4242  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 
271 aa  236  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.992424  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  50.96 
 
 
276 aa  230  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1381  alpha/beta hydrolase fold protein  47.01 
 
 
277 aa  208  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4800  alpha/beta hydrolase fold protein  45.7 
 
 
283 aa  205  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176635  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  43.73 
 
 
291 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  45.72 
 
 
273 aa  193  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0146  alpha/beta hydrolase fold protein  44.32 
 
 
281 aa  186  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2129  alpha/beta hydrolase fold protein  40.82 
 
 
291 aa  181  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  38.91 
 
 
311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  38.91 
 
 
311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  38.91 
 
 
296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  38.91 
 
 
296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  38.91 
 
 
296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  38.91 
 
 
296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  38.91 
 
 
349 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  40.82 
 
 
288 aa  177  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  38.81 
 
 
296 aa  176  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  45.26 
 
 
278 aa  176  5e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287872  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3859  alpha/beta hydrolase fold  43.43 
 
 
278 aa  169  7e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  40.65 
 
 
289 aa  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1694  alpha/beta hydrolase fold protein  42.69 
 
 
277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0287329  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37.98 
 
 
293 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  39.7 
 
 
288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  38.95 
 
 
288 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  39.1 
 
 
287 aa  160  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  37.46 
 
 
297 aa  158  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  36.8 
 
 
283 aa  158  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  34.78 
 
 
287 aa  156  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0496  alpha/beta hydrolase fold  42.54 
 
 
284 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0507  alpha/beta hydrolase fold  42.54 
 
 
284 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.697131 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0485  alpha/beta hydrolase fold  42.8 
 
 
284 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.891583  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3635  alpha/beta hydrolase fold protein  36.6 
 
 
281 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  40.87 
 
 
274 aa  152  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  35.97 
 
 
297 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4229  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  35.69 
 
 
293 aa  145  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  35.88 
 
 
288 aa  142  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  35.16 
 
 
301 aa  141  9e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  31.39 
 
 
300 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  36.07 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  36.29 
 
 
270 aa  139  7e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  30.07 
 
 
290 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  31.27 
 
 
289 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1845  alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 
306 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.12367 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  31.27 
 
 
289 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 
287 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  36.07 
 
 
287 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2917  alpha/beta hydrolase  32.17 
 
 
295 aa  135  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  34.2 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  35.42 
 
 
311 aa  133  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  34.57 
 
 
289 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  32.19 
 
 
307 aa  132  5e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  36.6 
 
 
304 aa  132  6e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  36.12 
 
 
313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  32.71 
 
 
304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  31.95 
 
 
328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  33.7 
 
 
308 aa  130  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  33.56 
 
 
308 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  34.8 
 
 
308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  36.5 
 
 
300 aa  129  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
308 aa  128  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 
284 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 
287 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3189  alpha/beta hydrolase  32.32 
 
 
306 aa  125  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 
291 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1416  Alpha/beta hydrolase fold  31.12 
 
 
306 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75275  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  34.77 
 
 
301 aa  122  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  30.5 
 
 
303 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  32.58 
 
 
287 aa  120  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  33.21 
 
 
308 aa  118  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0770  alpha/beta hydrolase fold  33.02 
 
 
325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1919  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  33.1 
 
 
307 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  31.39 
 
 
337 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  35.21 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0982  alpha/beta hydrolase fold  34.42 
 
 
308 aa  113  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485669  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  29.13 
 
 
322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  28.34 
 
 
312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  34.51 
 
 
294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  31.34 
 
 
323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  32.45 
 
 
299 aa  109  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 
328 aa  108  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0688  alpha/beta hydrolase fold protein  33.57 
 
 
309 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170834  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  32.65 
 
 
311 aa  108  9.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0708  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 
309 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.149589 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  31.84 
 
 
293 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1129  alpha/beta hydrolase fold protein  28.72 
 
 
303 aa  106  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 
305 aa  105  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  29.49 
 
 
341 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  34.57 
 
 
308 aa  105  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  32.88 
 
 
323 aa  105  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
314 aa  105  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 
308 aa  104  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  29.49 
 
 
315 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>