More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5081 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5081  Carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
122 aa  239  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7932  4-carboxymuconolactone decarboxylase  67.52 
 
 
132 aa  153  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  64.66 
 
 
391 aa  142  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  64.41 
 
 
393 aa  141  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0618  4-carboxymuconolactone decarboxylase  60.34 
 
 
400 aa  136  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  57.98 
 
 
402 aa  135  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  52.85 
 
 
129 aa  133  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  57.14 
 
 
134 aa  133  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  53.85 
 
 
161 aa  133  9e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  54.17 
 
 
132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2126  carboxymuconolactone decarboxylase  54.17 
 
 
132 aa  131  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191574  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2322  4-carboxymuconolactone decarboxylase  56.03 
 
 
129 aa  131  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254356  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0318  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  53.33 
 
 
133 aa  130  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623335  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2249  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  57.14 
 
 
131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0833929  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3004  3-oxoadipate enol-lactonase  56.67 
 
 
390 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38170  4-carboxymuconolactone decarboxylase  53.33 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.230767  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02850  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  52.5 
 
 
133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181902 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2692  4-carboxymuconolactone decarboxylase  56.3 
 
 
133 aa  129  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00273056  normal  0.231258 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  52.5 
 
 
132 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0594936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2687  4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.26 
 
 
140 aa  127  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.22317 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1577  4-carboxymuconolactone decarboxylase  56.03 
 
 
128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00107459  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4074  4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.26 
 
 
154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  52.85 
 
 
128 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  49.59 
 
 
373 aa  126  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1381  4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.67 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760953  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2061  4-carboxymuconolactone decarboxylase  55.46 
 
 
132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  62.71 
 
 
397 aa  126  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4433  4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.67 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145648  hitchhiker  0.00893399 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.67 
 
 
130 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0210047  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2454  4-carboxymuconolactone decarboxylase  55.46 
 
 
132 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.835529  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0058  4-carboxymuconolactone decarboxylase  52.03 
 
 
128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161595  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5284  4-carboxymuconolactone decarboxylase  52.03 
 
 
128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.327444  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1204  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  52.03 
 
 
128 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4316  4-carboxymuconolactone decarboxylase  52.07 
 
 
131 aa  125  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146371  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1557  4-carboxymuconolactone decarboxylase  52.03 
 
 
128 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0060  4-carboxymuconolactone decarboxylase  52.03 
 
 
128 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.34038  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4461  4-carboxymuconolactone decarboxylase  50.41 
 
 
128 aa  124  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.273934 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1487  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  52.03 
 
 
128 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1729  4-carboxymuconolactone decarboxylase  52.94 
 
 
393 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1745  4-carboxymuconolactone decarboxylase  52.94 
 
 
393 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0527  4-carboxymuconolactone decarboxylase  52.94 
 
 
393 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1679  4-carboxymuconolactone decarboxylase  52.94 
 
 
393 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412767  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1701  4-carboxymuconolactone decarboxylase  52.94 
 
 
393 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186237  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0563  4-carboxymuconolactone decarboxylase  52.1 
 
 
393 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0071  4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.22 
 
 
128 aa  123  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499909  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5750  4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.22 
 
 
129 aa  123  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5940  4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.67 
 
 
134 aa  123  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3125  carboxymuconolactone decarboxylase  51.22 
 
 
129 aa  123  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4473  4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.22 
 
 
128 aa  123  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5109  4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.22 
 
 
129 aa  123  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7078  4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.26 
 
 
134 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0342158  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3726  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.93 
 
 
135 aa  122  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0647  4-carboxymuconolactone decarboxylase (PcaC)  51.24 
 
 
130 aa  122  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.153527 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3162  4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.22 
 
 
128 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.22 
 
 
128 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  51.69 
 
 
392 aa  121  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2190  4-carboxymuconolactone decarboxylase  55.08 
 
 
133 aa  121  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0644  4-carboxymuconolactone decarboxylase  48.74 
 
 
138 aa  120  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1275  4-carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 
130 aa  121  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.537713  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0606  4-carboxymuconolactone decarboxylase  48.74 
 
 
138 aa  120  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  52.14 
 
 
396 aa  119  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  55.93 
 
 
386 aa  120  9e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2974  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.97 
 
 
125 aa  119  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 
123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4207  4-carboxymuconolactone decarboxylase  49.15 
 
 
135 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1984  4-carboxymuconolactone decarboxylase  53.04 
 
 
134 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1912  carboxymuconolactone decarboxylase  51.26 
 
 
126 aa  117  7.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.955365  normal  0.169242 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3459  carboxymuconolactone decarboxylase  53.72 
 
 
136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.462387  hitchhiker  0.00164993 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2568  carboxymuconolactone decarboxylase  47.01 
 
 
132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.136392 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3648  carboxymuconolactone decarboxylase  44.26 
 
 
129 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00963465  normal  0.158809 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2082  carboxymuconolactone decarboxylase  44.26 
 
 
129 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.984068 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02910  4-carboxymuconolactone decarboxylase  52.14 
 
 
137 aa  114  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2255  carboxymuconolactone decarboxylase  44.26 
 
 
129 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344767  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  50.85 
 
 
397 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2734  4-carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 
127 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.888805  hitchhiker  0.0000628107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4821  carboxymuconolactone decarboxylase  50.43 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0925911  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2260  carboxymuconolactone decarboxylase  44.26 
 
 
129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6127  4-carboxymuconolactone decarboxylase  49.56 
 
 
136 aa  111  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0448  carboxymuconolactone decarboxylase  48.72 
 
 
131 aa  110  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2049  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.83 
 
 
133 aa  110  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0437123  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0381  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  48.72 
 
 
131 aa  110  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.07667  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5222  Carboxymuconolactone decarboxylase  44.44 
 
 
126 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1473  Carboxymuconolactone decarboxylase  54.13 
 
 
137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.362759  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3478  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.53 
 
 
128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1216  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  48.72 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0658576  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2282  Carboxymuconolactone decarboxylase  56.88 
 
 
114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.175309  normal  0.232521 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0830  carboxymuconolactone decarboxylase  44.44 
 
 
126 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3382  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.9 
 
 
134 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0571  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.9 
 
 
134 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0939  carboxymuconolactone decarboxylase  44.44 
 
 
126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.947177  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3442  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.48 
 
 
127 aa  107  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222691  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3552  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.9 
 
 
134 aa  107  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3235  4-carboxymuconolactone decarboxylase  46.02 
 
 
129 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621974  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  51.75 
 
 
393 aa  106  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4162  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.18 
 
 
124 aa  106  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.441447 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  46.28 
 
 
129 aa  105  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  47.93 
 
 
393 aa  104  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5508  Carboxymuconolactone decarboxylase  47.79 
 
 
129 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000984625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3215  carboxymuconolactone decarboxylase  44.44 
 
 
124 aa  104  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0976  putative gamma carboxymuconolactone decarboxylase  43.8 
 
 
131 aa  103  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.602862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>