223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5015 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5015  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 137 aa  281  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168597  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37230  predicted thioesterase  69.92 
 
 		 136 aa  196  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0929724 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6680  thioesterase  66.92 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0588358  normal  0.343275 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4685  thioesterase superfamily protein  62.5 
 
 		 138 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  59.56 
 
 		 175 aa  173  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  61.19 
 
 		 145 aa  169  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1902  thioesterase superfamily protein  61.19 
 
 		 163 aa  169  7.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.119468 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  61.19 
 
 		 145 aa  169  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  59.7 
 
 		 149 aa  168  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  60.45 
 
 		 145 aa  167  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  60.45 
 
 		 145 aa  167  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  58.96 
 
 		 145 aa  167  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  58.82 
 
 		 149 aa  167  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  55.22 
 
 		 142 aa  167  5e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  59.7 
 
 		 145 aa  167  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1608  thioesterase superfamily protein  59.56 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4906  thioesterase superfamily protein  59.12 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.825665  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  55.47 
 
 		 143 aa  163  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  57.04 
 
 		 203 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2340  thioesterase superfamily protein  54.74 
 
 		 148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280619  normal  0.0595669 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  56.72 
 
 		 147 aa  161  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  60.45 
 
 		 145 aa  161  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1213  thioesterase superfamily protein  60.43 
 
 		 150 aa  160  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00301171  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  59.26 
 
 		 153 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  55.97 
 
 		 147 aa  160  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  53.68 
 
 		 143 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  58.21 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  58.21 
 
 		 153 aa  157  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  57.35 
 
 		 145 aa  157  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68490  hypothetical protein  58.14 
 
 		 147 aa  156  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.222508 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1437  thioesterase family protein  57.03 
 
 		 181 aa  156  9e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0719  thioesterase family protein  57.03 
 
 		 149 aa  155  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1824  thioesterase family protein  57.03 
 
 		 181 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.814646  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  52.24 
 
 		 147 aa  155  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4741  thioesterase superfamily protein  54.81 
 
 		 153 aa  156  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0117203  normal  0.418796 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0443  thioesterase family protein  57.03 
 
 		 149 aa  155  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1648  thioesterase family protein  57.03 
 
 		 149 aa  155  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1670  thioesterase family protein  57.03 
 
 		 149 aa  155  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895942  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  53.28 
 
 		 144 aa  155  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2066  thioesterase superfamily protein  54.48 
 
 		 160 aa  155  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  hitchhiker  0.00365834 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5810  thioesterase superfamily protein  59.26 
 
 		 143 aa  155  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1508  putative thioesterase  58.59 
 
 		 153 aa  154  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0888126  normal  0.372254 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5927  hypothetical protein  56.3 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.266343  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  49.63 
 
 		 164 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000226869  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1367  thioesterase superfamily protein  53.68 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000075245  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2493  thioesterase superfamily protein  53.68 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808355  normal  0.025023 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3308  thioesterase superfamily protein  52.99 
 
 		 188 aa  148  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362677  normal  0.831787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  51.13 
 
 		 156 aa  144  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0906  thioesterase family protein  59.29 
 
 		 125 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.661315  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1026  thioesterase superfamily protein  56.49 
 
 		 137 aa  142  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3086  thioesterase superfamily protein  50.37 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000791205  normal  0.0550819 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  51.85 
 
 		 150 aa  141  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3262  putative thioesterase  52.63 
 
 		 143 aa  141  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849103  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  51.49 
 
 		 150 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3994  thioesterase superfamily protein  51.88 
 
 		 143 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3281  hypothetical protein  50.72 
 
 		 150 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.704366  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  44.85 
 
 		 148 aa  138  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0426  thioesterase superfamily protein  47.79 
 
 		 155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3146  thioesterase superfamily protein  49.64 
 
 		 143 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1614  thioesterase superfamily protein  49.64 
 
 		 155 aa  132  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  46.56 
 
 		 147 aa  126  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  46.56 
 
 		 147 aa  126  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  46.56 
 
 		 147 aa  126  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  43.17 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  46.56 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3272  thioesterase superfamily protein  45.26 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.96014  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07356  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16350)  38.16 
 
 		 169 aa  110  8.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.374208 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0279  thioesterase superfamily protein  37.23 
 
 		 146 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1058  putative thioesterase  39.42 
 
 		 151 aa  100  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0254  thioesterase superfamily protein  35.77 
 
 		 146 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0152562 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0269  thioesterase superfamily protein  36.03 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4956  thioesterase superfamily protein  35.56 
 
 		 146 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294278 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  31.4 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  29.77 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  31.75 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  30.43 
 
 		 154 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 		 136 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  31.11 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0101  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  31.48 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  30.4 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3415  GCN5-related N-acetyltransferase  31.06 
 
 		 289 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.229891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  27.54 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  29.69 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  30.88 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3385  GCN5-related N-acetyltransferase  27.74 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00858508  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  31.4 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  28.79 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.136919 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  27.05 
 
 		 139 aa  62  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4381  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 		 148 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  33.07 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  30.6 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2862  thioesterase superfamily protein  24.82 
 
 		 292 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>