250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4978 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4978  glycosyltransferase, MGT family  100 
 
 
389 aa  749    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2047  glycosyl transferase family protein  50.38 
 
 
395 aa  330  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.555181  hitchhiker  0.0026549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4977  glycosyltransferase, MGT family  51.3 
 
 
378 aa  298  7e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2896  glycosyltransferase, MGT family  43.15 
 
 
330 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5567  hypothetical protein  39.12 
 
 
387 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.661467  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3816  glycosyltransferase, MGT family  36.78 
 
 
383 aa  184  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000289865  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3553  glycosyltransferase, MGT family  31.8 
 
 
390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000992125  hitchhiker  0.0041282 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2790  protein of unknown function DUF1205  33.42 
 
 
380 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0162419  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2418  glycosyl transferase family protein  26.75 
 
 
397 aa  124  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8226  hypothetical protein  29.62 
 
 
407 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4716  protein of unknown function DUF1205  30.97 
 
 
424 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.397708  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4711  protein of unknown function DUF1205  30.71 
 
 
429 aa  116  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.890895 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4727  protein of unknown function DUF1205  29.55 
 
 
416 aa  109  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2220  hypothetical protein  38.43 
 
 
346 aa  106  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1369  glycosyl transferase  27.84 
 
 
374 aa  106  9e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1886  glycosyl transferase family protein  26.23 
 
 
403 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3071  hypothetical protein  28.53 
 
 
371 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2335  glycosyltransferase, MGT family  29.84 
 
 
395 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2915  IroB  28.53 
 
 
371 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0618266 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2949  glycosyltransferase  28.53 
 
 
371 aa  99.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.63295e-18 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2885  IroB  28.86 
 
 
371 aa  99.8  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11390  glycosyltransferase, MGT family  25.99 
 
 
396 aa  99.4  9e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4715  protein of unknown function DUF1205  28.04 
 
 
419 aa  99.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.683026  normal  0.640764 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2968  hypothetical protein  28.28 
 
 
371 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000610556 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2711  glycosyltransferase, MGT family  44.58 
 
 
387 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271214  normal  0.0182222 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4707  protein of unknown function DUF1205  31.32 
 
 
428 aa  97.8  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4700  protein of unknown function DUF1205  29.21 
 
 
424 aa  97.8  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.626027  normal  0.337723 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4699  protein of unknown function DUF1205  27.36 
 
 
417 aa  97.4  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.363631  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4185  IroB  31.23 
 
 
382 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0479104  normal  0.936172 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4408  glycosyltransferase, MGT family  29.85 
 
 
389 aa  95.5  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2825  glycosyltransferase, putative  22.99 
 
 
397 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00274597  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2213  hypothetical protein  28.39 
 
 
380 aa  92.8  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2486  macrolide glycosyltransferase  22.4 
 
 
397 aa  92  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.182202  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3487  protein of unknown function DUF1205  27.87 
 
 
417 aa  92.8  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2846  macrolide glycosyltransferase  22.91 
 
 
397 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0273308  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2033  hypothetical protein  30.75 
 
 
378 aa  91.7  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0492847  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2021  glycosyl transferase family protein  29.16 
 
 
402 aa  90.9  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32980  glycosyltransferase, MGT family  26.37 
 
 
381 aa  90.9  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1263  hypothetical protein  27.5 
 
 
387 aa  90.9  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3265  glycosyltransferase, MGT family  30.49 
 
 
390 aa  90.5  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.085728 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0972  glycosyltransferase, MGT family  21.29 
 
 
417 aa  90.5  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2801  macrolide glycosyltransferase  22.74 
 
 
397 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756004 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2600  glycosyl transferase family protein  22.14 
 
 
398 aa  88.6  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29850  glycosyltransferase, MGT family  35.97 
 
 
404 aa  88.6  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2804  macrolide glycosyltransferase  22.11 
 
 
397 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2036  glycosyl transferase family protein  27.99 
 
 
397 aa  87.8  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746123 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1898  glycosyltransferase; macrolide glycosyltransferase  28.29 
 
 
402 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000618321  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1888  glycosyltransferase; macrolide glycosyltransferase  28.29 
 
 
402 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.213265  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1867  glycosyl transferase family protein  38.36 
 
 
419 aa  85.5  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2933  hypothetical protein  28.81 
 
 
472 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697027  normal  0.639426 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2168  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 
400 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1935  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 
402 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0505353  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3785  macrolide glycosyltransferase-like  31.14 
 
 
265 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.498719 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2776  protein of unknown function DUF1205  29.78 
 
 
380 aa  85.5  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00637482  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3181  glycosyltransferase, MGT family  26.6 
 
 
405 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3843  Glycosyltransferase 28 domain protein  30.06 
 
 
434 aa  84.3  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2182  glycosyltransferase, MGT family  27.52 
 
 
402 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0820  glycosyltransferase, MGT family  28.61 
 
 
398 aa  83.2  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.894116  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1936  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 
402 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.527298  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2114  glycosyltransferase, MGT family  28.29 
 
 
403 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2083  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 
402 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2112  hypothetical protein  27.78 
 
 
467 aa  82.8  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0819565  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3232  glycosyltransferase, MGT family  26.85 
 
 
402 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.26433 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2325  glycosyltransferase, MGT family  25.77 
 
 
406 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1565  glycosyl transferase family protein  20.31 
 
 
409 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.906358  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2073  glycosyltransferase, MGT family  26.17 
 
 
402 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4361  protein of unknown function DUF1205  31.54 
 
 
411 aa  77.8  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000257109  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1806  macrolide glycosyltransferase  36.02 
 
 
423 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2497  glycosyltransferase, MGT family  29.67 
 
 
380 aa  77  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2664  glycosyl transferase, putative  26.62 
 
 
392 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.38781  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22760  glycosyltransferase, MGT family  35.66 
 
 
389 aa  73.9  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2842  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 
422 aa  73.6  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.142528  normal  0.0240997 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2662  glycosyl transferase  25.9 
 
 
395 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2662  glycosyl transferase  23.81 
 
 
395 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.925673  hitchhiker  0.000211315 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4726  protein of unknown function DUF1205  27.23 
 
 
418 aa  72.4  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4922  glycosyl transferase family protein  37.16 
 
 
435 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2655  putative glycosyl transferase  25.9 
 
 
392 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000652274 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5029  glycosyl transferase family protein  24.69 
 
 
408 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.153009  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0478  glycosyltransferase family 28 protein  32.67 
 
 
433 aa  71.2  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1445  glycosyltransferase, MGT family  24.22 
 
 
399 aa  70.9  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2421  glycosyl transferase  24.82 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0361033  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2502  glycosyl transferase family protein  24.82 
 
 
391 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000624738  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5063  UDP-glycosyltransferase, MGT  34.33 
 
 
412 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0423  glycosyltransferase 28-like protein  21.01 
 
 
408 aa  70.1  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2327  glycosyltransferase, MGT family  25.19 
 
 
398 aa  69.7  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3579  glycosyl transferase family protein  24.69 
 
 
418 aa  69.3  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00269686  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2382  glycosyl transferase  25.55 
 
 
392 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172083  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2652  Glycosyltransferase 28 domain protein  37.76 
 
 
423 aa  68.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00514492  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3557  glycosyltransferase MGT family  27.93 
 
 
366 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12972  glycosyl transferase  33.33 
 
 
428 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3139  glycosyl transferase  25.49 
 
 
400 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.924253  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2095  rhamnosyltransferase I, subunit B  36.65 
 
 
439 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000117382  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1905  glycosyl transferase family protein  21.38 
 
 
410 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0812  rhamnosyltransferase I, subunit B  41.09 
 
 
439 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000142515  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1919  rhamnosyl transferase  41.09 
 
 
439 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000883643  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6314  glycosyl transferase family protein  36.28 
 
 
402 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1765  glycosyl transferase family protein  36.28 
 
 
402 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3897  Glycosyltransferase 28 domain protein  26.72 
 
 
429 aa  67.8  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2458  glycosyl transferase  24.46 
 
 
392 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.091231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2638  glycosyl transferase  24.46 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.408902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>