263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4953 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4953  Aminopeptidase Y  100 
 
 
312 aa  629  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000539028  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  65.14 
 
 
502 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1367  aminopeptidase Y  62.03 
 
 
519 aa  372  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.227193  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1408  aminopeptidase Y  61.69 
 
 
518 aa  368  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  64.18 
 
 
1147 aa  352  5e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  62.41 
 
 
1077 aa  348  6e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  56.38 
 
 
947 aa  298  8e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3786  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  54.33 
 
 
1131 aa  291  8e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550121  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5720  peptidase M28  51.56 
 
 
313 aa  275  9e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311136  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5560  peptidase M28  49.83 
 
 
437 aa  263  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1604  peptidase M28  49.47 
 
 
291 aa  259  5.0000000000000005e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2223  putative aminopeptidase  56.22 
 
 
535 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  55.76 
 
 
536 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.394851 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3548  aminopeptidase Y  53.46 
 
 
555 aa  227  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0650469 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01630  aminopeptidase Y  49.38 
 
 
509 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.777606  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0754  Aminopeptidase S  56.02 
 
 
512 aa  220  3e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  51.56 
 
 
515 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2070  peptidase M28  42.76 
 
 
309 aa  216  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0141  Aminopeptidase Y  48.84 
 
 
506 aa  209  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  48.89 
 
 
548 aa  206  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  47.33 
 
 
518 aa  205  7e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3913  Aminopeptidase Y  50 
 
 
512 aa  202  6e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  47.58 
 
 
512 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  48.64 
 
 
512 aa  200  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0793  Aminopeptidase Y  49.09 
 
 
514 aa  199  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  48.4 
 
 
503 aa  194  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2343  Aminopeptidase Y  44.35 
 
 
512 aa  188  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.362822  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  43.61 
 
 
513 aa  180  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  48.78 
 
 
534 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1182  Aminopeptidase Y  44.18 
 
 
481 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0553  aminopeptidase Y  42.21 
 
 
501 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0565  aminopeptidase Y  42.21 
 
 
501 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0543  aminopeptidase Y  42.21 
 
 
501 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.207964  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03918  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00220)  41.46 
 
 
502 aa  180  2.9999999999999997e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0943032 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10423  lipoprotein aminopeptidase lpqL  45.98 
 
 
500 aa  177  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0596975  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0190  aminopeptidase Y  44.69 
 
 
510 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0141  peptidase M28  44.78 
 
 
524 aa  170  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.481582 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0715  aminopeptidase Y  43.11 
 
 
502 aa  169  8e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0168155 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89245  Aminopeptidase yscIII Transferrin receptor  42.99 
 
 
533 aa  169  8e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0554  aminopeptidase Y  42.08 
 
 
479 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0566  aminopeptidase Y  42.08 
 
 
479 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0537512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0544  aminopeptidase Y  42.08 
 
 
479 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.282981  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0716  aminopeptidase Y  42.41 
 
 
488 aa  159  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.841416  normal  0.0176108 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0189  aminopeptidase Y  42.86 
 
 
488 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  37.42 
 
 
466 aa  86.3  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  37.42 
 
 
466 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  37.42 
 
 
466 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  37.42 
 
 
466 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  37.42 
 
 
466 aa  85.9  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  37.42 
 
 
466 aa  85.9  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  37.42 
 
 
466 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  37.42 
 
 
466 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  33.93 
 
 
584 aa  85.5  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  31.88 
 
 
450 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  36.77 
 
 
466 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  36.77 
 
 
466 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  37.86 
 
 
465 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  28.07 
 
 
497 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  25.48 
 
 
487 aa  77.4  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  34.87 
 
 
346 aa  77  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  33.33 
 
 
391 aa  75.9  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  26.71 
 
 
334 aa  76.3  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07020  leucyl aminopeptidase  31.02 
 
 
483 aa  74.7  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.384558  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1537  peptidase M28  34.01 
 
 
571 aa  73.6  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000191422 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0809  peptidase M28  32.16 
 
 
625 aa  72.8  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1976  peptidase M28  30.74 
 
 
347 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.242432  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5675  peptidase M28  29.61 
 
 
457 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00555231 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  31.82 
 
 
559 aa  70.9  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  32.54 
 
 
775 aa  70.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  32.2 
 
 
563 aa  70.1  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  31.21 
 
 
323 aa  69.7  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  28.46 
 
 
539 aa  68.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  30.11 
 
 
579 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  29.55 
 
 
1247 aa  67.8  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  28.35 
 
 
333 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2866  hypothetical protein  31.97 
 
 
401 aa  67  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2729  hypothetical protein  31.03 
 
 
401 aa  66.6  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  27.94 
 
 
563 aa  66.6  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0319  peptidase M28  33.94 
 
 
416 aa  65.9  0.0000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  32.69 
 
 
424 aa  65.1  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  29.95 
 
 
308 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000295021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  32.11 
 
 
308 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2040  peptidase M28  28.28 
 
 
578 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194253  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0054  peptidase M28  28.49 
 
 
335 aa  63.9  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  28.77 
 
 
598 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  31.63 
 
 
944 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0578  peptidase M28  28.01 
 
 
373 aa  63.5  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.43286  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  26 
 
 
420 aa  63.2  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  28.34 
 
 
544 aa  63.2  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  26.94 
 
 
555 aa  63.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  30.05 
 
 
330 aa  62.8  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  30.08 
 
 
552 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04018  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03740)  34.78 
 
 
772 aa  61.2  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.791672 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  28.02 
 
 
674 aa  61.2  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0653  peptidase M28  29.09 
 
 
438 aa  61.2  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.602384  normal  0.117412 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  29.11 
 
 
556 aa  61.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  28.85 
 
 
525 aa  60.8  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  30.52 
 
 
553 aa  60.1  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  26.41 
 
 
495 aa  59.7  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2848  aminopeptidase  26.34 
 
 
457 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000136315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>