More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4915 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4915  aldo/keto reductase  100 
 
 
348 aa  674    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000579413  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0644  aldo/keto reductase  38.24 
 
 
315 aa  200  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282625  normal  0.269213 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3927  aldo/keto reductase  36.79 
 
 
321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.124161 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0492  aldo/keto reductase  39.53 
 
 
311 aa  187  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.339705 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0026  hypothetical protein  38.54 
 
 
325 aa  186  7e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.838821 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4579  aldo/keto reductase  37.12 
 
 
312 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4115  aldo/keto reductase  34.85 
 
 
315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.905016 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0494  aldo/keto reductase  38.41 
 
 
318 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0804  aldo/keto reductase  38.54 
 
 
308 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01490  conserved hypothetical protein  36.99 
 
 
334 aa  180  4e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0458  aldo/keto reductase  32.21 
 
 
314 aa  179  5.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0654121  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2380  aldo/keto reductase  28.57 
 
 
316 aa  153  4e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.919819999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1807  aldo/keto reductase  33.1 
 
 
314 aa  149  7e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0131606 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5143  aldo/keto reductase  32.82 
 
 
333 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0017  aldo/keto reductase  33.33 
 
 
343 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0136  aldo/keto reductase  33.12 
 
 
324 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0019  aldo/keto reductase  33.33 
 
 
343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2905  aldo/keto reductase  39.3 
 
 
329 aa  132  6.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.789445  normal  0.760917 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49777  predicted protein  33.45 
 
 
418 aa  131  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2612  aldo/keto reductase  34.81 
 
 
317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0428761  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3684  aldo/keto reductase  33.82 
 
 
317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2155  aldo/keto reductase  30.72 
 
 
326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20371  hypothetical protein  29.05 
 
 
323 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3722  aldo/keto reductase  34.95 
 
 
319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110699  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4646  aldo/keto reductase  34.95 
 
 
319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3061  aldo/keto reductase  31.49 
 
 
326 aa  129  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7134  aldo/keto reductase  34.46 
 
 
317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.480122  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1162  oxidoreductase  28.38 
 
 
323 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5658  aldo/keto reductase  34.26 
 
 
319 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.582812 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0196  aldo/keto reductase  31.39 
 
 
331 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0217  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.39 
 
 
324 aa  125  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2010  aryl-alcohol dehydrogenase  27.22 
 
 
324 aa  125  8.000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0053  aldo/keto reductase  28.33 
 
 
327 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_194  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  31.13 
 
 
324 aa  122  9e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00647949  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2308  aldo/keto reductase  35.22 
 
 
373 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00621  aldo/keto reductase  26.97 
 
 
320 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.669789  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00601  aldo/keto reductase  26.73 
 
 
320 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16993  predicted protein  32.37 
 
 
297 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00591  aldo/keto reductase  27.57 
 
 
320 aa  116  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.165952  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3297  aldo/keto reductase  28.99 
 
 
326 aa  115  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.229625  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2200  aldo/keto reductase  31.91 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154507  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18160  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  31 
 
 
313 aa  108  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0475  aldo/keto reductase  30.38 
 
 
331 aa  106  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  33.21 
 
 
327 aa  106  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12321  hypothetical protein  33.33 
 
 
323 aa  105  9e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3050  aldo/keto reductase  35.82 
 
 
319 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0652752  normal  0.843265 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3132  aldo/keto reductase  29.22 
 
 
319 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2987  aldo/keto reductase  29.07 
 
 
319 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6423  aldo/keto reductase  34.42 
 
 
339 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.251084  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3016  aldo/keto reductase  33.1 
 
 
325 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  32.63 
 
 
309 aa  102  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0716  aldo/keto reductase  33.11 
 
 
306 aa  101  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.93631  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0471  aldo/keto reductase  29.05 
 
 
337 aa  100  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00023215  normal  0.05091 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1918  hypothetical protein  31.09 
 
 
327 aa  100  4e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.228007  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3045  aldo/keto reductase  31.75 
 
 
326 aa  99.4  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.686286  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0589  aldo/keto reductase  35.27 
 
 
322 aa  99.4  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.460548  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1185  aldo/keto reductase  28.8 
 
 
319 aa  99  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0397337 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20030  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  29.9 
 
 
321 aa  98.6  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47510  predicted protein  26.67 
 
 
381 aa  99  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0788  aldo/keto reductase  31.52 
 
 
315 aa  99  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2949  aldo/keto reductase  30.89 
 
 
336 aa  99  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2991  aldo/keto reductase  32.62 
 
 
325 aa  97.8  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1314  aldo/keto reductase  31.18 
 
 
321 aa  98.2  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127438  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49800  oxidoreductase  30.95 
 
 
329 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3100  aldo/keto reductase  29.18 
 
 
319 aa  97.4  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.124867  normal  0.776601 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4543  aldo/keto reductase  29.41 
 
 
315 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.785787  normal  0.78245 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1082  aldo/keto reductase  29.13 
 
 
274 aa  97.8  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1038  aldo/keto reductase  29.13 
 
 
274 aa  97.8  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2659  aldo/keto reductase  35.69 
 
 
326 aa  97.1  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0194115  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1234  aldo/keto reductase  29.27 
 
 
317 aa  96.7  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0495818  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2860  aldo/keto reductase  33.44 
 
 
331 aa  96.3  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0184279  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  31.43 
 
 
339 aa  95.9  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  30.58 
 
 
322 aa  95.9  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  31.43 
 
 
339 aa  95.9  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6124  aldo/keto reductase  33.45 
 
 
326 aa  95.9  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516846  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0430  aldo/keto reductase  28.14 
 
 
326 aa  95.9  9e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.542765  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4221  aldo/keto reductase  28.42 
 
 
390 aa  95.9  9e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.886889  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  32.7 
 
 
328 aa  95.9  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0958  aldo/keto reductase  30.82 
 
 
331 aa  94.7  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.420577  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3225  aldo/keto reductase  35.76 
 
 
323 aa  95.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.779629  normal  0.443318 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0298  aldo/keto reductase  34.31 
 
 
317 aa  94.7  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1003  aldo/keto reductase  28.85 
 
 
319 aa  95.1  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  30.67 
 
 
345 aa  95.1  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4295  aldo/keto reductase  29.19 
 
 
327 aa  94  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895367  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  30.38 
 
 
352 aa  94  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1860  aldo/keto reductase  28 
 
 
338 aa  94  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.599659  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0804  aldo/keto reductase  30.03 
 
 
348 aa  94  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.825748  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1786  aldo/keto reductase  36.05 
 
 
317 aa  94  4e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.561691 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4632  aldo/keto reductase  30.19 
 
 
319 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.962922 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  33.55 
 
 
351 aa  93.6  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1681  aldo/keto reductase  32.27 
 
 
316 aa  93.2  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7438  aldo/keto reductase  34.05 
 
 
360 aa  93.2  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.798482 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2012  aldo/keto reductase  32.45 
 
 
328 aa  93.2  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0143  aldo/keto reductase  30.45 
 
 
318 aa  93.2  6e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0990  aldo/keto reductase  32.74 
 
 
315 aa  93.2  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0722  aldo/keto reductase  32.68 
 
 
338 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.462105 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1146  aldo/keto reductase  26.65 
 
 
315 aa  92.8  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3924  aldo/keto reductase  29.22 
 
 
326 aa  93.2  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.281437  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3286  aldo/keto reductase  29.25 
 
 
323 aa  92.8  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.278509 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0454  aldo/keto reductase  31.73 
 
 
314 aa  92.8  8e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.240409  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>