More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4912 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  33.19 
 
 		 6403 aa  645    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4912  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 		 1715 aa  3285    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.650159  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  33.15 
 
 		 1776 aa  649    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  28.25 
 
 		 2791 aa  692    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  30.67 
 
 		 4336 aa  628  1e-178  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  33.65 
 
 		 4318 aa  627  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3680  amino acid adenylation domain protein  34.8 
 
 		 2721 aa  629  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  31.06 
 
 		 4336 aa  615  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  30.67 
 
 		 1801 aa  614  9.999999999999999e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  32.95 
 
 		 1789 aa  607  9.999999999999999e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  34.67 
 
 		 3208 aa  605  1.0000000000000001e-171  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  30.58 
 
 		 2820 aa  605  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  31.97 
 
 		 4342 aa  590  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  31.92 
 
 		 4342 aa  593  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  31.97 
 
 		 4317 aa  588  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  32.71 
 
 		 3235 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  31.7 
 
 		 4317 aa  569  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  31.41 
 
 		 4317 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  27.56 
 
 		 2997 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  30.92 
 
 		 4317 aa  559  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  26.91 
 
 		 1753 aa  530  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  30.48 
 
 		 3231 aa  520  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  24.67 
 
 		 3235 aa  514  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  27.19 
 
 		 7122 aa  450  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3109  aspartate racemase  29.99 
 
 		 1981 aa  447  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  34.45 
 
 		 2250 aa  446  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5195  amino acid adenylation domain protein  25.32 
 
 		 2753 aa  413  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.628302 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  27.43 
 
 		 6676 aa  399  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  23.72 
 
 		 2156 aa  395  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  28.75 
 
 		 8646 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  23.34 
 
 		 2156 aa  391  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  29.8 
 
 		 2370 aa  393  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  23.36 
 
 		 2156 aa  389  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  26.14 
 
 		 5738 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1879  amino acid adenylation domain-containing protein  28.92 
 
 		 2419 aa  386  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  28.17 
 
 		 3176 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  23.69 
 
 		 3291 aa  382  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  28.86 
 
 		 3308 aa  380  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  32.94 
 
 		 2448 aa  376  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  28.21 
 
 		 6889 aa  367  1e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  26.74 
 
 		 4968 aa  367  2e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  34.56 
 
 		 8211 aa  366  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  25.61 
 
 		 2571 aa  365  5.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  25.61 
 
 		 2571 aa  365  5.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  29.57 
 
 		 3629 aa  364  8e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  26.6 
 
 		 4960 aa  363  1e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  23.01 
 
 		 2193 aa  363  2e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  26.6 
 
 		 4960 aa  363  2e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2384  amino acid adenylation domain protein  24.24 
 
 		 2508 aa  362  3e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  33.85 
 
 		 7310 aa  362  4e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  30.62 
 
 		 3639 aa  361  7e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  28 
 
 		 3002 aa  360  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  24.29 
 
 		 3695 aa  360  1.9999999999999998e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3740  amino acid adenylation domain protein  22.8 
 
 		 2395 aa  359  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.209532 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  28.9 
 
 		 3331 aa  359  2.9999999999999997e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3686  amino acid adenylation domain protein  22.89 
 
 		 2395 aa  358  5e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  25.94 
 
 		 1786 aa  358  5.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5065  amino acid adenylation domain protein  32.31 
 
 		 2333 aa  357  1e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  27.96 
 
 		 5953 aa  356  2e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  29.05 
 
 		 2125 aa  355  2.9999999999999997e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1887  amino acid adenylation domain protein  29.03 
 
 		 2614 aa  355  2.9999999999999997e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  31.08 
 
 		 4136 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  29.04 
 
 		 3432 aa  355  4e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  36.47 
 
 		 1067 aa  355  5e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  25.66 
 
 		 2386 aa  353  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  22.16 
 
 		 3086 aa  352  3e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3737  amino acid adenylation domain protein  22.6 
 
 		 3824 aa  352  3e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0118377 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  32.26 
 
 		 1829 aa  352  5e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  31.08 
 
 		 5149 aa  350  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  27.55 
 
 		 8914 aa  348  5e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2961  amino acid adenylation domain-containing protein  31.77 
 
 		 2201 aa  348  5e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956293  hitchhiker  0.00505571 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  28.89 
 
 		 2561 aa  348  5e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  28.15 
 
 		 3498 aa  348  6e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  28.47 
 
 		 4502 aa  348  6e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  29.72 
 
 		 4332 aa  348  6e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  28.73 
 
 		 4468 aa  348  7e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3683  amino acid adenylation domain protein  22.77 
 
 		 2664 aa  347  8.999999999999999e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2266  amino acid adenylation  31.18 
 
 		 1369 aa  347  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5751  amino acid adenylation domain protein  27.92 
 
 		 1578 aa  347  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3874  amino acid adenylation domain protein  29.11 
 
 		 1665 aa  346  2e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0218124 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  27.1 
 
 		 5929 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  26.23 
 
 		 7168 aa  345  5e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  29.27 
 
 		 5213 aa  343  1e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  29.99 
 
 		 4747 aa  343  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1858  amino acid adenylation domain-containing protein  28.41 
 
 		 1528 aa  342  2.9999999999999998e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3744  amino acid adenylation domain protein  31.48 
 
 		 1110 aa  342  4e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696362  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4084  amino acid adenylation domain-containing protein  29.29 
 
 		 1114 aa  342  4e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  39.97 
 
 		 592 aa  342  4e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1886  amino acid adenylation domain protein  31.95 
 
 		 3710 aa  342  4e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4086  amino acid adenylation domain-containing protein  29.8 
 
 		 2155 aa  342  5e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  28.9 
 
 		 2174 aa  340  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  38.01 
 
 		 1656 aa  340  9.999999999999999e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  30.37 
 
 		 4882 aa  340  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  31.92 
 
 		 4383 aa  339  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  29.17 
 
 		 4037 aa  340  1.9999999999999998e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  30.37 
 
 		 2189 aa  339  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  30.03 
 
 		 5926 aa  339  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  24.98 
 
 		 1833 aa  339  2.9999999999999997e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1680  amino acid adenylation domain-containing protein  30.71 
 
 		 1405 aa  339  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  30.72 
 
 		 3021 aa  338  5.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>