More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4894 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4894  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
558 aa  1108    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6081  serine/threonine protein kinase  60.54 
 
 
542 aa  340  5.9999999999999996e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.168714 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32580  protein kinase family protein  57.09 
 
 
637 aa  312  1e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.356943  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4722  serine/threonine protein kinase  59.38 
 
 
749 aa  299  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32590  serine/threonine protein kinase  58.94 
 
 
630 aa  292  1e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5244  serine/threonine protein kinase  53.22 
 
 
601 aa  283  8.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5934  serine/threonine protein kinase  50.17 
 
 
550 aa  265  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0503162  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7072  serine/threonine protein kinase  53.79 
 
 
644 aa  257  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467775  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5828  Serine/threonine protein kinase-like protein  51.4 
 
 
557 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636001  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1756  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  47.1 
 
 
608 aa  253  7e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0245  serine/threonine protein kinase  45.63 
 
 
623 aa  251  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442956  normal  0.53946 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1754  serine/threonine protein kinase  49.13 
 
 
535 aa  249  8e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4463  serine/threonine protein kinase  48.75 
 
 
820 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846265  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1517  serine/threonine protein kinase  50.19 
 
 
547 aa  247  4e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00657769  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2216  serine/threonine protein kinase  49.83 
 
 
620 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000015062  decreased coverage  0.00000142315 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5479  serine/threonine protein kinase  46.99 
 
 
870 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.915288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5207  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  51.38 
 
 
618 aa  244  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.517469  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1406  Serine/threonine protein kinase-like protein  52.79 
 
 
716 aa  243  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0179739 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4168  serine/threonine protein kinase  52.41 
 
 
870 aa  242  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  48.47 
 
 
742 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0842  serine/threonine protein kinase  46.99 
 
 
695 aa  239  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000042013  decreased coverage  0.00000000202513 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5221  serine/threonine protein kinase  48.57 
 
 
716 aa  238  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0344538  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5943  serine/threonine protein kinase  48.12 
 
 
680 aa  236  6e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.545721  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2000  serine/threonine protein kinase  54.96 
 
 
597 aa  235  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0547084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0619  serine/threonine protein kinase  49.22 
 
 
589 aa  231  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7045  Serine/threonine protein kinase-like protein  45.79 
 
 
600 aa  229  9e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1696  serine/threonine protein kinase  47.24 
 
 
569 aa  229  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00691581  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1927  serine/threonine protein kinase  49.26 
 
 
522 aa  227  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5206  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  45.64 
 
 
687 aa  226  8e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228236  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6716  serine/threonine protein kinase  46.62 
 
 
696 aa  221  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5592  serine/threonine protein kinase  45.77 
 
 
721 aa  219  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.294025 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0093  Serine/threonine protein kinase-like protein  47.69 
 
 
520 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5095  serine/threonine protein kinase  48.26 
 
 
585 aa  217  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0160466  normal  0.222813 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0948  serine/threonine protein kinase  45.77 
 
 
734 aa  217  5e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.21638 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0591  serine/threonine protein kinase  50.37 
 
 
837 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.85194  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2372  serine/threonine protein kinase  46.67 
 
 
638 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354832  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4012  serine/threonine protein kinase  44.23 
 
 
528 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0531  serine/threonine protein kinase  45.31 
 
 
612 aa  214  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.145867 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2507  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  43.63 
 
 
421 aa  211  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2874  serine/threonine protein kinase  45.8 
 
 
604 aa  211  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.422639  normal  0.298046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7434  Serine/threonine protein kinase-like protein  36.3 
 
 
673 aa  211  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1130  serine/threonine protein kinase  43.19 
 
 
555 aa  210  5e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1299  serine/threonine protein kinase  46.15 
 
 
564 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7386  Serine/threonine protein kinase-like protein  44.92 
 
 
585 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2371  serine/threonine protein kinase  47.35 
 
 
694 aa  207  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513467  normal  0.0774186 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2699  serine/threonine protein kinase  47.39 
 
 
743 aa  207  5e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0467419  normal  0.85773 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1947  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  42.97 
 
 
932 aa  207  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  0.992815 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2229  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  43.68 
 
 
644 aa  206  9e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277557  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2577  serine/threonine protein kinase  44.27 
 
 
573 aa  205  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3910  serine/threonine protein kinase  45.04 
 
 
637 aa  205  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0631  serine/threonine protein kinase  47.74 
 
 
544 aa  205  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4915  serine/threonine protein kinase  48 
 
 
586 aa  205  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.636265  hitchhiker  0.00645126 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4679  serine/threonine protein kinase  42.59 
 
 
590 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6355  Serine/threonine protein kinase-like protein  43.19 
 
 
599 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555336  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6100  serine/threonine protein kinase  44.83 
 
 
624 aa  204  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0281 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2698  serine/threonine protein kinase  41.36 
 
 
696 aa  204  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200844  normal  0.152894 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8723  serine/threonine protein kinase  52.09 
 
 
770 aa  204  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196332  normal  0.0764847 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0163  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  41.92 
 
 
569 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.910763  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  41.6 
 
 
751 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1299  serine/threonine protein kinase  43.89 
 
 
608 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4116  serine/threonine protein kinase  51.15 
 
 
514 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3002  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  43.8 
 
 
835 aa  201  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.774494  normal  0.214944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2614  Serine/threonine protein kinase-like protein  47.04 
 
 
1148 aa  201  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2860  serine/threonine protein kinase  45.8 
 
 
780 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3758  serine/threonine protein kinase  41.76 
 
 
455 aa  200  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143716  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0666  serine/threonine protein kinase  42.01 
 
 
292 aa  200  5e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  0.126887 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3437  serine/threonine protein kinase  42.53 
 
 
771 aa  200  6e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0650  serine/threonine protein kinase  44.66 
 
 
548 aa  200  7e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0794789  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  46.74 
 
 
828 aa  199  7e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2662  Serine/threonine protein kinase-like protein  42.97 
 
 
814 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00893552  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0864  serine/threonine protein kinase  41.6 
 
 
360 aa  197  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.572478  normal  0.162904 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3911  serine/threonine protein kinase  46.53 
 
 
632 aa  197  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0023  serine/threonine protein kinase  46.27 
 
 
560 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2433  serine/threonine protein kinase  48.3 
 
 
526 aa  196  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.263911  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0089  serine/threonine protein kinase  42.35 
 
 
571 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4730  serine/threonine protein kinase  44.79 
 
 
564 aa  195  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2875  serine/threonine protein kinase  44.32 
 
 
541 aa  194  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0446464  normal  0.277743 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2448  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  44.32 
 
 
641 aa  194  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6447  serine/threonine protein kinase  41.67 
 
 
514 aa  193  7e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0751813  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  41.99 
 
 
833 aa  192  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3605  serine/threonine protein kinase  45.69 
 
 
481 aa  192  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.170818  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5538  serine/threonine protein kinase  44.06 
 
 
542 aa  192  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5981  serine/threonine protein kinase  43.13 
 
 
594 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.381836  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1460  serine/threonine protein kinase  46.22 
 
 
611 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1302  serine/threonine protein kinase  46.01 
 
 
589 aa  192  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0592381  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3742  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  43.89 
 
 
806 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575594  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1446  serine/threonine protein kinase  46.39 
 
 
646 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0259009 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3365  protein kinase  41.6 
 
 
545 aa  191  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.345301  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3577  serine/threonine protein kinase  42.47 
 
 
624 aa  190  5e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0586603  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2849  serine/threonine protein kinase  42.54 
 
 
709 aa  190  5.999999999999999e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390264  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0592  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  41.57 
 
 
603 aa  190  5.999999999999999e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1974  Serine/threonine protein kinase-like protein  43.68 
 
 
481 aa  189  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3954  Serine/threonine protein kinase-like protein  43.51 
 
 
587 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214407  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  45.04 
 
 
865 aa  189  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2847  serine/threonine protein kinase  42.52 
 
 
416 aa  188  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  43.35 
 
 
898 aa  187  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2474  serine/threonine protein kinase  41.54 
 
 
738 aa  186  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0500  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  45.09 
 
 
490 aa  186  7e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4425  serine/threonine protein kinase  40.8 
 
 
613 aa  186  7e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.373285 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0255  serine/threonine protein kinase  40.3 
 
 
754 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0438219  normal  0.0628344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>