27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4775 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4775  hypothetical protein  100 
 
 		 492 aa  988    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0542528  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2623  hypothetical protein  36.07 
 
 		 485 aa  233  9e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2030  hypothetical protein  34.16 
 
 		 486 aa  219  7.999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.178771 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2770  metallophosphoesterase  45.95 
 
 		 808 aa  94.4  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0261608  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0452  NHL repeat-containing protein  40.65 
 
 		 525 aa  94.4  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2881  hypothetical protein  40.26 
 
 		 445 aa  93.2  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0091  putative esterase  38.69 
 
 		 882 aa  79  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3874  hypothetical protein  39.53 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172055  normal  0.0781303 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2380  hypothetical protein  38.67 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147185  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2379  hypothetical protein  38.52 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.262289  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2621  cell wall anchor domain-containing protein  35.88 
 
 		 537 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4776  hypothetical protein  30.16 
 
 		 596 aa  70.9  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0346034  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2032  cell wall anchor domain-containing protein  35.47 
 
 		 527 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.870882  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2764  hypothetical protein  32.24 
 
 		 543 aa  68.9  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.671405  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2624  hypothetical protein  32.26 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.589978 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2038  hypothetical protein  31.87 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01070  hypothetical protein  30.34 
 
 		 215 aa  66.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.65358  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03560  Alkaline phosphatase  30.26 
 
 		 631 aa  65.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2037  hypothetical protein  28.74 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4769  hypothetical protein  33.53 
 
 		 278 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147821  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3101  hypothetical protein  28.1 
 
 		 582 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169932  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0072  hypothetical protein  39 
 
 		 332 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2625  hypothetical protein  29.09 
 
 		 215 aa  55.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2379  hypothetical protein  32.32 
 
 		 218 aa  53.9  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.683491  normal  0.011955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1840  Alkaline phosphatase  32.9 
 
 		 615 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1241  surface-anchored protein domain protein  26.25 
 
 		 771 aa  52.8  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212575 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1240  surface-anchored protein domain protein  25.94 
 
 		 399 aa  50.4  0.00008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000376372 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>