More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4770 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  100 
 
 		 250 aa  481  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2381  ABC transporter related protein  66.53 
 
 		 251 aa  287  1e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.722045  normal  0.0115307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2618  ABC transporter related  59.41 
 
 		 247 aa  261  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.314848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2035  ABC transporter related  59.66 
 
 		 247 aa  256  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.470588  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1237  anchored repeat-type ABC transporter, ATP-binding subunit  46.99 
 
 		 262 aa  224  9e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000165117 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  46.43 
 
 		 262 aa  196  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  40.99 
 
 		 249 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  39.74 
 
 		 249 aa  192  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  48.1 
 
 		 271 aa  192  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0794  ABC transporter related  41.32 
 
 		 248 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  40.17 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  40.17 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  40.54 
 
 		 249 aa  189  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1662  ABC-type Mn/Zn transport systems ATPase component  42.8 
 
 		 243 aa  183  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.184218  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2601  ABC transporter related  41.89 
 
 		 298 aa  182  6e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0327  iron ABC transporter, ATP-binding protein  41.89 
 
 		 252 aa  181  8.000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000461185  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2999  ABC transporter related  44.93 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000922039  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06281  ABC transporter ATP-binding protein  38.79 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0602  ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0038  ABC transporter ATP-binding protein  40.89 
 
 		 265 aa  179  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06581  ABC transporter ATP-binding protein  38.79 
 
 		 254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.505293  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  39.06 
 
 		 264 aa  179  4e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06581  ABC transporter ATP-binding protein  40.89 
 
 		 265 aa  179  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.173088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3979  ABC transporter related  43.24 
 
 		 252 aa  178  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.97942 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1658  metal transport system ATP-binding protein  43.69 
 
 		 298 aa  178  7e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150041 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2210  ABC transporter related protein  42.79 
 
 		 296 aa  177  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0132469  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2574  ATPase  43.97 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.523052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0248  ABC transporter related  47.09 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2894  ABC transporter component  47.71 
 
 		 300 aa  176  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.630242  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  44.4 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2142  ABC transporter related protein  43.57 
 
 		 248 aa  176  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3261  ABC transporter related  42.79 
 
 		 257 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000189494  normal  0.195184 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3045  ABC transporter related  43.53 
 
 		 286 aa  176  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155685  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1704  chelated iron ABC transporter, ATP-binding protein YfeB  40.99 
 
 		 296 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2631  ATP-binding transport protein  40.99 
 
 		 296 aa  176  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0977377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1814  ABC transporter related  40.99 
 
 		 296 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381501  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06671  ABC transporter ATP-binding protein  39.22 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.12917  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  41.15 
 
 		 258 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  41.15 
 
 		 258 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2132  ABC transporter-related protein  44.17 
 
 		 296 aa  176  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.350282 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18701  ABC transporter ATP-binding protein  42.92 
 
 		 265 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  40.74 
 
 		 246 aa  175  6e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1918  ABC transporter related  41.89 
 
 		 296 aa  175  6e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0148813  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  43.66 
 
 		 258 aa  175  6e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0801  ABC transporter related  40.47 
 
 		 252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0712793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  50 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0774  ABC transporter related  40 
 
 		 252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0842  ABC transporter-like protein protein  41.12 
 
 		 273 aa  172  3.9999999999999995e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  43.93 
 
 		 278 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0533  ABC transporter related  48.1 
 
 		 255 aa  172  5e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.622469  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  37.9 
 
 		 256 aa  171  9e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4438  ABC transporter related  45.53 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.845686  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_573  cation ABC transporter, ATP-binding protein  40.71 
 
 		 254 aa  171  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0632  cation ABC transporter, ATP-binding protein  43.33 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  41.48 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1142  ABC transporter related  44.78 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  42.92 
 
 		 258 aa  170  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1258  ABC transporter related  42.92 
 
 		 289 aa  170  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  39.48 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  37.92 
 
 		 263 aa  169  3e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2915  ABC transporter related  43.32 
 
 		 311 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1011  ATPase  41.15 
 
 		 255 aa  169  4e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.204422  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3219  ABC transporter related  37.02 
 
 		 249 aa  169  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10481  ABC transporter ATP-binding protein  38.22 
 
 		 265 aa  169  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.194871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1317  ATPase  41.81 
 
 		 245 aa  169  6e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  40.6 
 
 		 262 aa  168  8e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3279  ABC transporter related  38.49 
 
 		 267 aa  168  9e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2484  ABC transporter related  39.66 
 
 		 246 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3171  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  41.75 
 
 		 275 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.775494 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3624  ABC transporter related  40.08 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3172  chelated iron transport system membrane protein YfeB  42.23 
 
 		 273 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.513641  normal  0.970851 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  43.72 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  40.34 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3015  chelated iron transport system membrane protein YfeB  41.75 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.105627 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3067  chelated iron transport system membrane protein YfeB  41.75 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381864  normal  0.0646347 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2552  ABC transporter related  38.26 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0083  iron/manganese transport system membrane protein SitB  42.72 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921207  hitchhiker  0.000000822462 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1389  ABC transporter related  44.16 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0369589  normal  0.478115 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3167  ABC transporter related  42.37 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.473142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2984  chelated iron transport system membrane protein YfeB  41.75 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  37.16 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1206  ABC transporter related  44.66 
 
 		 299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  43.75 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3403  ABC transporter related  41.89 
 
 		 292 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1440  manganese ABC transporter ATP-binding protein  36.24 
 
 		 237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1611  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  42.23 
 
 		 275 aa  166  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00104171  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3726  ABC transporter related  39.91 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3051  chelated iron transport system membrane protein YfeB  41.75 
 
 		 273 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0128316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  42.29 
 
 		 263 aa  165  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  36.07 
 
 		 236 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  36.97 
 
 		 254 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  35.19 
 
 		 261 aa  164  8e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1600  ABC transporter-like  38.7 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0157688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1487  ATPase  41.15 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51658  normal  0.183723 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  40.08 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0605  ABC transporter related  40.48 
 
 		 254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1112  ABC transporter related  39.37 
 
 		 274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3699  ABC transporter related  39.48 
 
 		 288 aa  163  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0995  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  45.33 
 
 		 254 aa  162  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  41.32 
 
 		 268 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>