132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4761 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4761  methyltransferase  100 
 
 
313 aa  609  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.991548  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4234  methyltransferase  61.09 
 
 
298 aa  321  8e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2708  methyltransferase  51.26 
 
 
301 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3327  methyltransferase  50 
 
 
278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103507  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11925  hypothetical protein  46.57 
 
 
303 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.728522  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4929  putative methyltransferase  51.27 
 
 
283 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83161  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0369  hypothetical protein  46.63 
 
 
300 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0379  putative methyltransferase  46.63 
 
 
300 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.976099  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0358  putative methyltransferase  46.63 
 
 
300 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5025  putative methyltransferase  38.41 
 
 
307 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.056649  normal  0.20395 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7735  protein of unknown function Mtu_121  42.86 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10912  hypothetical protein  36.77 
 
 
325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13434  hypothetical protein  36.27 
 
 
348 aa  145  9e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5024  putative methyltransferase  37.5 
 
 
301 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.199097  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1344  putative methyltransferase  40.71 
 
 
305 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514876  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1043  hypothetical protein  38.04 
 
 
304 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1059  putative methyltransferase  38.04 
 
 
304 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.769331  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1018  methyltransferase  43.84 
 
 
312 aa  142  6e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.514126 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1071  putative methyltransferase  39.31 
 
 
304 aa  142  7e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10146  hypothetical protein  43.14 
 
 
317 aa  142  8e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10288  hypothetical protein  36.57 
 
 
302 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.59683e-26  normal  0.455495 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0743  putative methyltransferase  37.59 
 
 
309 aa  139  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10845  hypothetical protein  35.27 
 
 
301 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000203136  hitchhiker  0.000000140012 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10745  hypothetical protein  39.21 
 
 
318 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.397623 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0933  putative methyltransferase  36.96 
 
 
304 aa  132  7.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1345  putative methyltransferase  37.7 
 
 
306 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10740  hypothetical protein  38.77 
 
 
367 aa  130  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.508563 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1072  putative methyltransferase  39.22 
 
 
297 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.373937  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0078  putative methyltransferase  36.3 
 
 
312 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.809042  normal  0.434766 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11746  hypothetical protein  35.5 
 
 
312 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.399672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0088  hypothetical protein  36.3 
 
 
312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0097  putative methyltransferase  36.3 
 
 
312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0973562 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1044  hypothetical protein  38.73 
 
 
297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1060  putative methyltransferase  38.73 
 
 
297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1073  putative methyltransferase  36.4 
 
 
308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10147  hypothetical protein  42.35 
 
 
310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1045  hypothetical protein  36.4 
 
 
308 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1061  putative methyltransferase  36.4 
 
 
308 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.435592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0104  putative methyltransferase  39.65 
 
 
309 aa  125  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3182  methyltransferase  48.26 
 
 
313 aa  125  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.374487  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13821  hypothetical protein  43.14 
 
 
308 aa  124  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1573  protein of unknown function Mtu_121  35.23 
 
 
279 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0894053  normal  0.0567385 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0168  putative methyltransferase  40.78 
 
 
246 aa  124  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.627272 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13799  hypothetical protein  41.59 
 
 
314 aa  122  7e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.224674 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1346  putative methyltransferase  37.17 
 
 
310 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10739  hypothetical protein  40.64 
 
 
301 aa  119  6e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.195713  normal  0.904261 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5023  putative methyltransferase  40.21 
 
 
307 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.388  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0592  putative methyltransferase  40.51 
 
 
249 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0567855 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0580  hypothetical protein  40.51 
 
 
242 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.832218  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0570  putative methyltransferase  40.51 
 
 
249 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.723796 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0495  putative methyltransferase  42.29 
 
 
798 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.722631  normal  0.300307 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3841  methyltransferase  35.63 
 
 
305 aa  110  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0879  hypothetical protein  38.39 
 
 
329 aa  107  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.967499  normal  0.737994 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0079  putative methyltransferase  43.07 
 
 
263 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.331361 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0089  hypothetical protein  43.07 
 
 
263 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0098  putative methyltransferase  43.07 
 
 
263 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.154609 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0910  putative methyltransferase  33.48 
 
 
295 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2358  methyltransferase  32.47 
 
 
291 aa  94.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.341035  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1545  putative methyltransferase  33.17 
 
 
297 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106357  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0738  putative methyltransferase  44.53 
 
 
245 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30355  predicted protein  40.3 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.074058 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0123  hypothetical protein  26.57 
 
 
310 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000106694  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2741  hypothetical protein  28.9 
 
 
311 aa  73.6  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.321866  hitchhiker  0.000409678 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1696  hypothetical protein  31.13 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.152352 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3295  hypothetical protein  29.31 
 
 
306 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.589501 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1534  methyltransferase  30.14 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1105  methyltransferase  27.64 
 
 
295 aa  69.7  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0581586  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3289  hypothetical protein  28.71 
 
 
307 aa  68.9  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1821  putative methyltransferase  25.57 
 
 
291 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.135863  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3294  hypothetical protein  27.49 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.814215 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2540  methyltransferase  35.08 
 
 
276 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.266861  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5616  methyltransferase  34.08 
 
 
287 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3293  hypothetical protein  29.89 
 
 
209 aa  67  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.779586 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1136  protein of unknown function Mtu_121  34.08 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.200581  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3683  hypothetical protein  34.08 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4684  putative methyltransferase  34.08 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0882703 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4009  methyltransferase  33.54 
 
 
286 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0764257  normal  0.338849 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0483  methyltransferase  38.81 
 
 
292 aa  64.7  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00128266  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2218  hypothetical protein  32.17 
 
 
351 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432005  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4542  methyltransferase  34.29 
 
 
292 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.165839 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2748  methyltransferase  39.1 
 
 
285 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4828  methyltransferase  34.78 
 
 
286 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3751  methyltransferase  34.78 
 
 
286 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0904683  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4078  putative methyltransferase  33.71 
 
 
293 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3964  methyltransferase  30.74 
 
 
290 aa  62.8  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0986536  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0683  methyltransferase  35.29 
 
 
285 aa  62.8  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2234  methyltransferase  34.78 
 
 
276 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0473874  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1213  protein of unknown function Mtu_121  37.59 
 
 
285 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311438  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6184  methyltransferase  35.1 
 
 
289 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2654  methyltransferase  38.35 
 
 
285 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.340781  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26560  predicted protein  34.43 
 
 
219 aa  59.7  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00221113 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3549  putative methyltransferase  37.5 
 
 
285 aa  59.7  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5836  putative methyltransferase  33.16 
 
 
282 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0641  Na(+)/H(+) antiporter 1 (Sodium/proton antiporter 1)  24.17 
 
 
279 aa  59.7  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0022  hypothetical protein  36 
 
 
286 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3713  methyltransferase  34.16 
 
 
285 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.364762 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4307  hypothetical protein  26.6 
 
 
311 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0649  methyltransferase  34.33 
 
 
283 aa  56.2  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1091  MerR family transcriptional regulator  32.92 
 
 
286 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0738969  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2390  putative methyltransferase  36.36 
 
 
290 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206641  normal  0.0346266 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>