77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4712 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4712  protein of unknown function DUF1680  100 
 
 		 881 aa  1756    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2836  protein of unknown function DUF1680  38.14 
 
 		 614 aa  318  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4617  protein of unknown function DUF1680  32.08 
 
 		 1025 aa  261  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602011  normal  0.370298 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  34.17 
 
 		 846 aa  257  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  32.4 
 
 		 771 aa  245  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0478  protein of unknown function DUF1680  32.43 
 
 		 641 aa  242  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2080  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  30.76 
 
 		 795 aa  239  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.254608  hitchhiker  0.00000268125 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0778  Acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  30.59 
 
 		 803 aa  236  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.163489 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1993  hypothetical protein  30.59 
 
 		 795 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0573537  hitchhiker  0.00434895 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1982  hypothetical protein  30.59 
 
 		 795 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0591519  hitchhiker  0.000518937 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  28.83 
 
 		 955 aa  233  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3876  hypothetical protein  26.59 
 
 		 765 aa  223  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2153  protein of unknown function DUF1680  27.9 
 
 		 792 aa  218  4e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.299284  normal  0.0915146 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01470  hypothetical protein  30.8 
 
 		 783 aa  215  2.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1422  protein of unknown function DUF1680  26.17 
 
 		 760 aa  212  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428296  normal  0.497833 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0997  protein of unknown function DUF1680  28.01 
 
 		 597 aa  212  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3214  hypothetical protein  31.91 
 
 		 844 aa  206  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.77483  normal  0.454399 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1194  protein of unknown function DUF1680  31.4 
 
 		 749 aa  172  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11690  hypothetical protein  30.66 
 
 		 752 aa  166  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0363  protein of unknown function DUF1680  29.19 
 
 		 744 aa  153  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1859  protein of unknown function DUF1680  35.23 
 
 		 736 aa  149  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0320  hypothetical protein  25.96 
 
 		 607 aa  131  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.280201  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1938  protein of unknown function DUF1680  27.3 
 
 		 711 aa  116  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0164  hypothetical protein  25.08 
 
 		 602 aa  108  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.935603  normal  0.0626406 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0062  protein of unknown function DUF1680  28.74 
 
 		 596 aa  94  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.560227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3839  hypothetical protein  28.86 
 
 		 654 aa  86.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254825  normal  0.0525361 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4720  protein of unknown function DUF1680  26.12 
 
 		 655 aa  82.8  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.827878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0635  protein of unknown function DUF1680  26.27 
 
 		 656 aa  80.9  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1696  hypothetical protein  27.53 
 
 		 634 aa  78.6  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.298068 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3619  protein of unknown function DUF1680  27.01 
 
 		 640 aa  78.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4996  protein of unknown function DUF1680  24.23 
 
 		 800 aa  77.4  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0292235  normal  0.0722722 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4162  hypothetical protein  26.38 
 
 		 640 aa  76.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549846 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4835  protein of unknown function DUF1680  23.67 
 
 		 648 aa  77  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2215  protein of unknown function DUF1680  27.27 
 
 		 638 aa  75.9  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4148  protein of unknown function DUF1680  29.63 
 
 		 652 aa  75.1  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.834889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2720  protein of unknown function DUF1680  25.65 
 
 		 640 aa  75.1  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3907  protein of unknown function DUF1680  26.89 
 
 		 648 aa  73.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.373018 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0969  hypothetical protein  27.48 
 
 		 634 aa  70.5  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00300565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4097  hypothetical protein  23.44 
 
 		 672 aa  70.5  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121081  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0668  hypothetical protein  26.46 
 
 		 620 aa  70.1  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0502  protein of unknown function DUF1680  24.33 
 
 		 617 aa  69.3  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.171957  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0643  hypothetical protein  26.77 
 
 		 620 aa  69.3  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000119693  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2738  protein of unknown function DUF1680  24.84 
 
 		 680 aa  68.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0391777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2831  protein of unknown function DUF1680  26.45 
 
 		 629 aa  68.2  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2133  protein of unknown function DUF1680  23.35 
 
 		 673 aa  67  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2748  protein of unknown function DUF1680  25.39 
 
 		 684 aa  66.6  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0072487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0636  protein of unknown function DUF1680  25.22 
 
 		 667 aa  65.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.788531 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4952  hypothetical protein  26.18 
 
 		 656 aa  62.4  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03438  conserved hypothetical protein  26.18 
 
 		 659 aa  62  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03389  hypothetical protein  26.18 
 
 		 667 aa  62  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3909  hypothetical protein  26.18 
 
 		 656 aa  61.6  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4064  hypothetical protein  26.19 
 
 		 651 aa  61.6  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4474  protein of unknown function DUF1680  25.89 
 
 		 636 aa  60.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3877  hypothetical protein  26.19 
 
 		 651 aa  59.3  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2907  protein of unknown function DUF1680  24.84 
 
 		 659 aa  58.5  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0376366  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0407  protein of unknown function DUF1680  29.17 
 
 		 633 aa  58.5  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  29.81 
 
 		 1224 aa  57  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0910  hypothetical protein  22.82 
 
 		 665 aa  57  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.027132  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4002  hypothetical protein  25.79 
 
 		 651 aa  57.4  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.563325 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3957  hypothetical protein  25.4 
 
 		 651 aa  57  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  0.86497 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01840  hypothetical protein  27.39 
 
 		 643 aa  57  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3893  hypothetical protein  25.4 
 
 		 651 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0591  hypothetical protein  22.22 
 
 		 646 aa  55.8  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000770924  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0089  protein of unknown function DUF1680  26.16 
 
 		 677 aa  55.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2242  protein of unknown function DUF1680  23.38 
 
 		 652 aa  55.1  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1126  protein of unknown function DUF1680  23.38 
 
 		 628 aa  54.3  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6525  protein of unknown function DUF1680  23.99 
 
 		 647 aa  53.5  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0294245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2035  protein of unknown function DUF1680  23.41 
 
 		 678 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337709 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3930  protein of unknown function DUF1680  26.8 
 
 		 640 aa  52.4  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1342  hypothetical protein  25.8 
 
 		 669 aa  51.2  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21200  copper binding protein, plastocyanin/azurin family  27.17 
 
 		 513 aa  50.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229231  normal  0.551456 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1728  protein of unknown function DUF1680  23.76 
 
 		 675 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.670849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0212  hypothetical protein  23.62 
 
 		 397 aa  50.1  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000517482  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4989  protein of unknown function DUF1680  25.87 
 
 		 647 aa  48.5  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0192762 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7232  protein of unknown function DUF1680  21.95 
 
 		 666 aa  48.9  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00213031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2143  hypothetical protein  22.02 
 
 		 648 aa  46.6  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.56985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1151  protein of unknown function DUF1680  26.67 
 
 		 679 aa  45.4  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>