118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4711 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  100 
 
 		 648 aa  1327    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  45.16 
 
 		 626 aa  519  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  43.37 
 
 		 626 aa  515  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  27.91 
 
 		 663 aa  192  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  29.53 
 
 		 681 aa  189  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  28.97 
 
 		 653 aa  162  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0257  hypothetical protein  51.03 
 
 		 159 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00160125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  24.57 
 
 		 564 aa  114  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.53 
 
 		 589 aa  100  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.65 
 
 		 607 aa  95.1  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.98 
 
 		 605 aa  95.1  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  24.65 
 
 		 564 aa  95.1  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2624  hypothetical protein  25.48 
 
 		 505 aa  87.4  8e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  24.58 
 
 		 579 aa  85.5  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.11 
 
 		 591 aa  82  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.68 
 
 		 573 aa  77.8  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.24 
 
 		 594 aa  77.8  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.19 
 
 		 595 aa  77.4  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  23.05 
 
 		 607 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.05 
 
 		 634 aa  74.3  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  21.08 
 
 		 603 aa  73.9  0.000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  23.95 
 
 		 685 aa  72  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3567  OLD family ATP-dependent endonuclease-like protein  28.1 
 
 		 604 aa  68.6  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  23.6 
 
 		 780 aa  68.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.2 
 
 		 616 aa  65.5  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.57 
 
 		 603 aa  64.3  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3102  ATP-dependent OLD family endonuclease  20.96 
 
 		 582 aa  63.9  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  29.38 
 
 		 598 aa  63.9  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  24.09 
 
 		 613 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  38.1 
 
 		 513 aa  60.1  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.66 
 
 		 793 aa  57.8  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  22.43 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3650  hypothetical protein  28.97 
 
 		 426 aa  57  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574815  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  52.08 
 
 		 608 aa  56.2  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1387  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.78 
 
 		 550 aa  55.5  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.398618  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.4 
 
 		 652 aa  55.5  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  25.63 
 
 		 712 aa  55.1  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.01 
 
 		 640 aa  54.7  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  23.43 
 
 		 688 aa  53.9  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  34.04 
 
 		 891 aa  53.9  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  22.97 
 
 		 399 aa  53.9  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.79 
 
 		 669 aa  53.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  24.29 
 
 		 584 aa  52.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  31.43 
 
 		 628 aa  52.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.51 
 
 		 613 aa  51.6  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  31.69 
 
 		 924 aa  51.6  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  20.38 
 
 		 714 aa  52  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.7 
 
 		 674 aa  51.2  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2587  chromosome segregation protein SMC  40 
 
 		 1151 aa  50.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000427179 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  30.68 
 
 		 529 aa  50.4  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  22.9 
 
 		 606 aa  50.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  33.33 
 
 		 497 aa  50.1  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  41.67 
 
 		 339 aa  50.4  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  42.86 
 
 		 1178 aa  49.3  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  21.62 
 
 		 707 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02258  hypothetical protein  45.65 
 
 		 626 aa  49.7  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  21.46 
 
 		 728 aa  49.3  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  39.68 
 
 		 1176 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  24.45 
 
 		 666 aa  48.9  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0163  chromosome segregation protein SMC  37.14 
 
 		 1150 aa  48.9  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  37.04 
 
 		 424 aa  48.9  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  23.87 
 
 		 773 aa  48.9  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0374  chromosome segregation protein SMC  39.29 
 
 		 1151 aa  48.1  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  24.08 
 
 		 695 aa  48.5  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  26.03 
 
 		 703 aa  48.5  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  46.15 
 
 		 669 aa  48.5  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0640  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  21.29 
 
 		 601 aa  48.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0196  hypothetical protein  23.55 
 
 		 654 aa  48.5  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5469  hypothetical protein  23.4 
 
 		 763 aa  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  44.19 
 
 		 680 aa  48.1  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  42.22 
 
 		 994 aa  47.8  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  26.14 
 
 		 596 aa  47.4  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4907  hypothetical protein  24.8 
 
 		 769 aa  47.4  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50635  normal  0.10457 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3860  ATPase-like  42.31 
 
 		 370 aa  47.4  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.247695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  40.91 
 
 		 890 aa  47.4  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1696  hypothetical protein  26.47 
 
 		 641 aa  46.6  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0144  chromosome segregation protein SMC  35.71 
 
 		 1170 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0901  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.56 
 
 		 672 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0225  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.04 
 
 		 578 aa  46.6  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000140656 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0876  chromosome segregation protein SMC2  35.71 
 
 		 1151 aa  46.2  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.601564  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1750  ATPase  45.65 
 
 		 515 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.52576  normal  0.584982 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  37.14 
 
 		 1174 aa  45.8  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  23.42 
 
 		 642 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  39.58 
 
 		 1141 aa  46.2  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3009  SMC domain protein  36.73 
 
 		 514 aa  45.4  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0144  ATPase  30.59 
 
 		 565 aa  45.8  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  44.19 
 
 		 369 aa  45.8  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2270  chromosome segregation protein SMC  34.29 
 
 		 1147 aa  45.4  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  31.58 
 
 		 1164 aa  45.4  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 645 aa  45.4  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  33.33 
 
 		 440 aa  45.4  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2199  condensin subunit Smc  37.5 
 
 		 1148 aa  45.1  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.53129 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  40.48 
 
 		 647 aa  45.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  38.6 
 
 		 1186 aa  45.1  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0419  chromosome segregation protein SMC  36.84 
 
 		 1190 aa  44.7  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327904  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  30.26 
 
 		 1138 aa  44.7  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  30.07 
 
 		 895 aa  44.7  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2536  chromosome segregation protein SMC  33.93 
 
 		 1170 aa  44.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3887  hypothetical protein  25.22 
 
 		 546 aa  45.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1507  SMC domain protein  39.29 
 
 		 1115 aa  44.7  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.44218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>