More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4679 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4679  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
590 aa  1176    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4463  serine/threonine protein kinase  47.39 
 
 
820 aa  249  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846265  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1754  serine/threonine protein kinase  48.66 
 
 
535 aa  241  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6081  serine/threonine protein kinase  45.02 
 
 
542 aa  232  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.168714 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5221  serine/threonine protein kinase  46.97 
 
 
716 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0344538  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5828  Serine/threonine protein kinase-like protein  47.69 
 
 
557 aa  230  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636001  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7072  serine/threonine protein kinase  45.98 
 
 
644 aa  229  8e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467775  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5943  serine/threonine protein kinase  47.17 
 
 
680 aa  229  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.545721  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1299  serine/threonine protein kinase  48.03 
 
 
608 aa  228  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1517  serine/threonine protein kinase  45.42 
 
 
547 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00657769  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2847  serine/threonine protein kinase  46.88 
 
 
416 aa  219  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32580  protein kinase family protein  45.04 
 
 
637 aa  217  4e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.356943  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2874  serine/threonine protein kinase  44.49 
 
 
604 aa  215  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.422639  normal  0.298046 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3910  serine/threonine protein kinase  45.77 
 
 
637 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0842  serine/threonine protein kinase  39.73 
 
 
695 aa  214  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000042013  decreased coverage  0.00000000202513 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0619  serine/threonine protein kinase  45.59 
 
 
589 aa  212  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1756  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  44.94 
 
 
608 aa  211  4e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4260  serine/threonine protein kinase  47.84 
 
 
551 aa  211  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0338869  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2216  serine/threonine protein kinase  48.45 
 
 
620 aa  210  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000015062  decreased coverage  0.00000142315 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  46.46 
 
 
742 aa  210  7e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5207  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  44.62 
 
 
618 aa  208  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.517469  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2577  serine/threonine protein kinase  44.49 
 
 
573 aa  207  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0093  Serine/threonine protein kinase-like protein  41.06 
 
 
520 aa  207  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3437  serine/threonine protein kinase  36.8 
 
 
771 aa  207  5e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4894  serine/threonine protein kinase  40.97 
 
 
558 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0591  serine/threonine protein kinase  45.11 
 
 
837 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.85194  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1406  Serine/threonine protein kinase-like protein  44.49 
 
 
716 aa  204  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0179739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7386  Serine/threonine protein kinase-like protein  42.05 
 
 
585 aa  204  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0631  serine/threonine protein kinase  39.75 
 
 
544 aa  204  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5206  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  41.48 
 
 
687 aa  203  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228236  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0245  serine/threonine protein kinase  43.54 
 
 
623 aa  203  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442956  normal  0.53946 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1446  serine/threonine protein kinase  47.49 
 
 
646 aa  203  7e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0259009 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2474  serine/threonine protein kinase  42.96 
 
 
738 aa  203  9e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5934  serine/threonine protein kinase  42.62 
 
 
550 aa  202  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0503162  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2229  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  40.3 
 
 
644 aa  201  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277557  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32590  serine/threonine protein kinase  42.37 
 
 
630 aa  201  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4168  serine/threonine protein kinase  47.79 
 
 
870 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1947  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  41.57 
 
 
932 aa  201  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  0.992815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5479  serine/threonine protein kinase  41.79 
 
 
870 aa  200  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.915288 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0592  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  42.97 
 
 
603 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4722  serine/threonine protein kinase  44.96 
 
 
749 aa  199  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5244  serine/threonine protein kinase  40.28 
 
 
601 aa  197  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1927  serine/threonine protein kinase  44.28 
 
 
522 aa  197  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4915  serine/threonine protein kinase  42.41 
 
 
586 aa  197  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.636265  hitchhiker  0.00645126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2000  serine/threonine protein kinase  46.79 
 
 
597 aa  196  9e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0547084 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0089  serine/threonine protein kinase  44.22 
 
 
571 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6355  Serine/threonine protein kinase-like protein  40.38 
 
 
599 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555336  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2699  serine/threonine protein kinase  43.28 
 
 
743 aa  194  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0467419  normal  0.85773 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4116  serine/threonine protein kinase  47.15 
 
 
514 aa  194  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2372  serine/threonine protein kinase  42.31 
 
 
638 aa  193  7e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354832  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5592  serine/threonine protein kinase  40.84 
 
 
721 aa  193  7e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.294025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8723  serine/threonine protein kinase  49.23 
 
 
770 aa  193  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196332  normal  0.0764847 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0406  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  43.56 
 
 
624 aa  193  9e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6716  serine/threonine protein kinase  39.39 
 
 
696 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2875  serine/threonine protein kinase  42.91 
 
 
541 aa  192  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0446464  normal  0.277743 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3002  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  42.19 
 
 
835 aa  192  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.774494  normal  0.214944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3605  serine/threonine protein kinase  43.51 
 
 
481 aa  192  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.170818  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3577  serine/threonine protein kinase  40.59 
 
 
624 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0586603  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2371  serine/threonine protein kinase  44.06 
 
 
694 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513467  normal  0.0774186 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5981  serine/threonine protein kinase  40.77 
 
 
594 aa  191  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.381836  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4730  serine/threonine protein kinase  44.33 
 
 
564 aa  190  5.999999999999999e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0024  serine/threonine protein kinase  44.12 
 
 
572 aa  190  7e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3758  serine/threonine protein kinase  34.34 
 
 
455 aa  189  8e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143716  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3742  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  40.77 
 
 
806 aa  189  9e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575594  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0023  serine/threonine protein kinase  45.06 
 
 
560 aa  187  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2849  serine/threonine protein kinase  45.08 
 
 
709 aa  187  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390264  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2448  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.84 
 
 
641 aa  187  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2662  Serine/threonine protein kinase-like protein  36.3 
 
 
814 aa  186  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00893552  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1866  serine/threonine protein kinase  45.1 
 
 
551 aa  186  9e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2507  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  38.93 
 
 
421 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  40.7 
 
 
898 aa  186  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2698  serine/threonine protein kinase  40 
 
 
696 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200844  normal  0.152894 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2563  serine/threonine protein kinase  41.91 
 
 
476 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000933415  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0948  serine/threonine protein kinase  37.94 
 
 
734 aa  184  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.21638 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1696  serine/threonine protein kinase  39.37 
 
 
569 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00691581  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2433  serine/threonine protein kinase  44.32 
 
 
526 aa  184  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.263911  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3365  protein kinase  40.39 
 
 
545 aa  184  5.0000000000000004e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.345301  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5538  serine/threonine protein kinase  43.03 
 
 
542 aa  183  6e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2848  serine/threonine protein kinase  41.22 
 
 
617 aa  183  8.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509331  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1460  serine/threonine protein kinase  43.19 
 
 
611 aa  183  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0255  serine/threonine protein kinase  39.84 
 
 
754 aa  182  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0438219  normal  0.0628344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1299  serine/threonine protein kinase  39.48 
 
 
564 aa  182  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5095  serine/threonine protein kinase  42.19 
 
 
585 aa  182  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0160466  normal  0.222813 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4005  serine/threonine protein kinase  41.67 
 
 
652 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.599637  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6100  serine/threonine protein kinase  40.77 
 
 
624 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0281 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0650  serine/threonine protein kinase  39.23 
 
 
548 aa  180  7e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0794789  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0163  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  39.53 
 
 
569 aa  180  8e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.910763  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0531  serine/threonine protein kinase  39.37 
 
 
612 aa  179  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.145867 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4012  serine/threonine protein kinase  39.08 
 
 
528 aa  179  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4425  serine/threonine protein kinase  39.85 
 
 
613 aa  179  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.373285 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0921  protein kinase  42.23 
 
 
651 aa  179  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0130475  normal  0.23221 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0666  serine/threonine protein kinase  38.85 
 
 
292 aa  177  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  0.126887 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  40.29 
 
 
833 aa  177  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1302  serine/threonine protein kinase  42.15 
 
 
589 aa  177  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0592381  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6447  serine/threonine protein kinase  40 
 
 
514 aa  176  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0751813  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0797  serine/threonine protein kinase  42.4 
 
 
587 aa  176  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.367858  normal  0.015256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8117  Serine/threonine protein kinase-like protein  43.03 
 
 
733 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4688  serine/threonine protein kinase  41.6 
 
 
520 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414102  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3842  serine/threonine protein kinase  38.83 
 
 
357 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.276356  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7045  Serine/threonine protein kinase-like protein  36.14 
 
 
600 aa  174  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>