35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4674 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4674  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
334 aa  667    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0615733  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4673  lipolytic protein G-D-S-L family  58.33 
 
 
331 aa  319  3.9999999999999996e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.187557  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  41.14 
 
 
503 aa  235  9e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  30.56 
 
 
814 aa  97.4  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2162  lipolytic protein G-D-S-L family  26.3 
 
 
436 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0912  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.96 
 
 
366 aa  71.2  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.273013  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4327  GDSL family lipase  25.44 
 
 
366 aa  68.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2370  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  24.63 
 
 
360 aa  68.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00713619  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3337  acetylxylan esterase  23.66 
 
 
402 aa  63.9  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00939156 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0698  lysophospholipase L1 related esterase  29.44 
 
 
296 aa  61.6  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000348792  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1254  GDSL family lipase  25.34 
 
 
357 aa  58.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000525756  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1778  hypothetical protein  26.02 
 
 
322 aa  57.8  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  35.07 
 
 
358 aa  56.2  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  29.09 
 
 
495 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05320  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G00620)  24.14 
 
 
307 aa  55.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.426041 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3143  hypothetical protein  23.05 
 
 
369 aa  53.5  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387409  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3977  lipolytic protein G-D-S-L family  30.89 
 
 
593 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410599  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.57 
 
 
366 aa  50.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0113749 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1831  cellulose-binding family II  29.03 
 
 
374 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  31.54 
 
 
353 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0721  hypothetical protein  22.61 
 
 
387 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.706774  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  25.47 
 
 
1234 aa  47.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1105  lysophospholipase L1 or related esterase  23.23 
 
 
321 aa  47.8  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1295  lipase/acylhydrolase, putative  32.14 
 
 
390 aa  46.6  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.336383  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  24.77 
 
 
522 aa  46.2  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2682  lipolytic protein G-D-S-L family  22.69 
 
 
593 aa  46.2  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.825886 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  28.67 
 
 
366 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0744  lysophospholipase L1 related esterase  36.96 
 
 
180 aa  44.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0831  GDSL family lipase  25.59 
 
 
248 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.386587  normal  0.0593626 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3163  lipolytic protein G-D-S-L family  34.91 
 
 
241 aa  43.9  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.384554  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1343  lysophospholipase L1 or related esterase  25.2 
 
 
171 aa  43.1  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000279155  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3614  lipolytic protein G-D-S-L family  28 
 
 
220 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0768739  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0191  GDSL family lipase  26.23 
 
 
201 aa  42.7  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  26.55 
 
 
373 aa  42.7  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10529  hypothetical protein  31.97 
 
 
231 aa  42.7  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>