65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4670 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4670  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  575  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610067  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2943  hypothetical protein  63.82 
 
 		 309 aa  374  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000846327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3288  hypothetical protein  64.97 
 
 		 308 aa  375  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3164  hypothetical protein  62.29 
 
 		 309 aa  366  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3190  hypothetical protein  55.88 
 
 		 324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525581 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2969  hypothetical protein  54.46 
 
 		 324 aa  302  4.0000000000000003e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4327  hypothetical protein  55.59 
 
 		 319 aa  297  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2206  hypothetical protein  55.3 
 
 		 336 aa  280  3e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3287  hypothetical protein  56.12 
 
 		 322 aa  265  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0390  hypothetical protein  43.1 
 
 		 318 aa  236  5.0000000000000005e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.752733 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2084  hypothetical protein  44.41 
 
 		 322 aa  225  7e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1237  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  29.93 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1117  dienelactone hydrolase-like protein  29.49 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.218404  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1126  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  29.93 
 
 		 350 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  27.98 
 
 		 546 aa  63.2  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5886  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  35.37 
 
 		 361 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.695825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  28.51 
 
 		 607 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  29.01 
 
 		 568 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  28.28 
 
 		 567 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  27.92 
 
 		 569 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  25.68 
 
 		 543 aa  59.3  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  28.29 
 
 		 526 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  30.63 
 
 		 565 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2163  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  25.08 
 
 		 330 aa  57  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0271635  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  35.37 
 
 		 365 aa  57  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  23.91 
 
 		 551 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  31.58 
 
 		 547 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  25 
 
 		 382 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  30.4 
 
 		 567 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  36.84 
 
 		 345 aa  54.3  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1295  hypothetical protein  24.11 
 
 		 369 aa  54.3  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.103756  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30181  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.51 
 
 		 505 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.157772 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  34.51 
 
 		 568 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5818  hypothetical protein  37.75 
 
 		 300 aa  52.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  32.77 
 
 		 328 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1079  hypothetical protein  25.23 
 
 		 369 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000122089  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  23.05 
 
 		 601 aa  51.6  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  27.55 
 
 		 338 aa  51.2  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  28.29 
 
 		 430 aa  50.8  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  28.77 
 
 		 374 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1107  dienelactone hydrolase-like protein  25.23 
 
 		 369 aa  50.4  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.12853  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2227  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  27.33 
 
 		 488 aa  50.1  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  31.25 
 
 		 572 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  25 
 
 		 545 aa  49.7  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  31.53 
 
 		 572 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2228  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  24.21 
 
 		 406 aa  48.9  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  31.13 
 
 		 347 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3493  dienelactone hydrolase-like protein  27.35 
 
 		 433 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  31.78 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3992  hypothetical protein  24.91 
 
 		 340 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  25.32 
 
 		 605 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  29.3 
 
 		 372 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  30.36 
 
 		 347 aa  47  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  29.26 
 
 		 464 aa  47  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2690  hypothetical protein  29.38 
 
 		 498 aa  46.2  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1883  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  35.86 
 
 		 393 aa  46.2  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  25.4 
 
 		 600 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  30 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  28.24 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  25.4 
 
 		 600 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3459  carboxylic ester hydrolase  24.82 
 
 		 456 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.675018  hitchhiker  1.26241e-19 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  28.38 
 
 		 410 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1278  Triacylglycerol lipase  30 
 
 		 289 aa  43.5  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5444  hypothetical protein  25.63 
 
 		 327 aa  42.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0680915  normal  0.105622 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0593  hydrolase protein  27.5 
 
 		 320 aa  42.4  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>