28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4655 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4655  hypothetical protein  100 
 
 		 770 aa  1500    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134449  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3018  hypothetical protein  41.78 
 
 		 603 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0249937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4373  hypothetical protein  45.38 
 
 		 633 aa  325  1e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.32896e-21 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1050  hypothetical protein  52.42 
 
 		 618 aa  317  4e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526264  normal  0.107352 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4347  hypothetical protein  33.96 
 
 		 675 aa  267  5.999999999999999e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0676  hypothetical protein  32.31 
 
 		 659 aa  249  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.758616  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0823  hypothetical protein  32.3 
 
 		 651 aa  239  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0929  hypothetical protein  34.19 
 
 		 692 aa  239  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0568347  normal  0.0205131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2381  hypothetical protein  43.32 
 
 		 584 aa  230  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2071  FAD(NAD)-dependent oxidoreductase  37.39 
 
 		 616 aa  219  1e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6222  hypothetical protein  44 
 
 		 619 aa  211  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.690917  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3711  hypothetical protein  37.32 
 
 		 654 aa  208  4e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3910  hypothetical protein  36.19 
 
 		 673 aa  205  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03600  hypothetical protein  31.2 
 
 		 651 aa  203  9.999999999999999e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1859  FAD(NAD)-dependent oxidoreductase  31.52 
 
 		 623 aa  194  4e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3473  hypothetical protein  38.57 
 
 		 638 aa  186  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02280  predicted dinucleotide-binding enzyme  37.57 
 
 		 867 aa  183  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1458  putative lipoprotein  36.29 
 
 		 624 aa  176  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.342191  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41800  hypothetical protein  33.06 
 
 		 615 aa  158  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11200  hypothetical protein  38.44 
 
 		 593 aa  155  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1163  hypothetical protein  23.95 
 
 		 742 aa  150  8e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17770  hypothetical protein  36.13 
 
 		 644 aa  145  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413089  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0617  hypothetical protein  35.9 
 
 		 624 aa  145  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2744  hypothetical protein  30.13 
 
 		 580 aa  117  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0706789  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1205  hypothetical protein  29.6 
 
 		 593 aa  114  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721959  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11418  hypothetical protein  26.67 
 
 		 580 aa  110  9.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227142  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2959  hypothetical protein  29.76 
 
 		 551 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0119375  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2537  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.8 
 
 		 1072 aa  60.5  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>