More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4632 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 295 aa  569  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  59.41 
 
 		 309 aa  325  5e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  60 
 
 		 288 aa  322  4e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  59.52 
 
 		 288 aa  316  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  55.7 
 
 		 308 aa  277  2e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5452  transcriptional regulator, LysR family  52.19 
 
 		 297 aa  249  5e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  47.68 
 
 		 305 aa  229  5e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  48.99 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  47.73 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  43.29 
 
 		 327 aa  197  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  43.08 
 
 		 301 aa  189  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  42.17 
 
 		 312 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  40.21 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  40.34 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  37.2 
 
 		 304 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  43.72 
 
 		 287 aa  152  7e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  41.27 
 
 		 291 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4073  transcriptional regulator, LysR family  41.64 
 
 		 313 aa  142  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.127902  normal  0.817309 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 301 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  38.96 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  37.76 
 
 		 328 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1602  fhu operon transcriptional regulator  35.14 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  38.96 
 
 		 324 aa  136  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 304 aa  136  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  40.32 
 
 		 316 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  32.55 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1423  LysR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 339 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174338  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  31.21 
 
 		 298 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  32.62 
 
 		 312 aa  132  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  35.69 
 
 		 308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  39.84 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  34.96 
 
 		 310 aa  129  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  36.26 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  35.62 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  45.24 
 
 		 301 aa  125  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 298 aa  125  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0838  LysR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00258172  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7868  transcriptional regulator, LysR family  35.25 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.365024 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 306 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  37.2 
 
 		 311 aa  122  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2187  LysR substrate-binding protein  34.36 
 
 		 309 aa  122  9e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 338 aa  122  9e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34330  transcriptional regulator  36.29 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  36.91 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8459  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.983783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  38.6 
 
 		 301 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  38.55 
 
 		 319 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  34.92 
 
 		 302 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 295 aa  118  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  40.17 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  34.18 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  35.92 
 
 		 343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3497  transcriptional regulator, LysR family  39.57 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137062 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2243  transcriptional regulator, LysR family  35.2 
 
 		 296 aa  115  7.999999999999999e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  37.01 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  32.39 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22480  transcriptional regulator  39.37 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.542371 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0129  transcriptional regulator, LysR family  37.75 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00685914  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2544  transcriptional regulator, LysR family  38.61 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0984343  normal  0.803064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1120  transcriptional regulator, LysR family  34.67 
 
 		 350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2872  transcriptional regulator, LysR family  32.61 
 
 		 302 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5225  transcriptional regulator, LysR family  34.6 
 
 		 316 aa  113  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  36.51 
 
 		 314 aa  113  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4518  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  36.14 
 
 		 304 aa  112  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 300 aa  112  9e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 327 aa  112  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1279  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  37.21 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1575  transcriptional regulator, LysR family  26.21 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381269  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2454  lysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  33.78 
 
 		 298 aa  109  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0807  transcriptional regulator, LysR family  32.75 
 
 		 304 aa  109  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  35.88 
 
 		 350 aa  109  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2948  LysR family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 292 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.871741  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2921  LysR family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 292 aa  109  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.493083  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3170  LysR family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 292 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3576  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 305 aa  109  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300569  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3178  transcriptional regulator, LysR family  28.2 
 
 		 292 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0898  transcriptional regulator, LysR family  27.82 
 
 		 293 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4979  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 294 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398741  normal  0.422466 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3170  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0383  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715241  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3924  transcriptional regulator, LysR family  34.39 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4307  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0280475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3122  LysR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4529  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3524  LysR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.76062  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3675  transcriptional regulator, LysR family  34.54 
 
 		 303 aa  106  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5149  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 294 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3293  transcriptional regulator, LysR family  32.93 
 
 		 294 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>