More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4602 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 
382 aa  741    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  48.48 
 
 
388 aa  305  6e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  34.75 
 
 
376 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  35.39 
 
 
382 aa  182  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  34.46 
 
 
376 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  37.07 
 
 
388 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  29.49 
 
 
378 aa  149  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  35.31 
 
 
378 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  32.12 
 
 
364 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  32.12 
 
 
364 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3328  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  38.06 
 
 
407 aa  143  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150159  normal  0.347251 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  31.82 
 
 
360 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  36 
 
 
388 aa  143  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7785  FAD-dependent oxidoreductase  32.33 
 
 
425 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786204  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  34.15 
 
 
404 aa  139  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3561  monooxygenase, FAD-binding protein  36.48 
 
 
389 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.014092  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3634  monooxygenase, FAD-binding  36.48 
 
 
389 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.231418  normal  0.598375 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2329  hypothetical protein  27.22 
 
 
374 aa  138  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2372  hypothetical protein  27.22 
 
 
374 aa  138  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  25.14 
 
 
377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3566  monooxygenase, FAD-binding  35.85 
 
 
389 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  27.42 
 
 
374 aa  137  5e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0778  monooxygenase FAD-binding  36.53 
 
 
393 aa  136  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373747  decreased coverage  0.000456942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2514  monooxygenase FAD-binding protein  34.58 
 
 
391 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_56492  zeaxanthin epoxidase  31.09 
 
 
557 aa  135  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688102  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0229  monooxygenase FAD-binding  35.06 
 
 
409 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  25.14 
 
 
377 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  33.78 
 
 
390 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  24.53 
 
 
377 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  30.41 
 
 
384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5386  monooxygenase FAD-binding  32.92 
 
 
392 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.336288 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0307  FAD dependent oxidoreductase  37.07 
 
 
378 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000823237 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  32.47 
 
 
397 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  33.23 
 
 
410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  32.25 
 
 
392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  27.95 
 
 
392 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  31.53 
 
 
396 aa  126  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4378  monooxygenase FAD-binding  32.29 
 
 
420 aa  126  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  31.02 
 
 
397 aa  126  8.000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  24.31 
 
 
377 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3466  monooxygenase, FAD-binding  32.61 
 
 
392 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4900  monooxygenase, FAD-binding  32.61 
 
 
392 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.99121 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  30.86 
 
 
395 aa  122  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  31.4 
 
 
377 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  29.89 
 
 
388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2339  monooxygenase FAD-binding  29.08 
 
 
388 aa  120  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000167175  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  30.58 
 
 
403 aa  119  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  28.81 
 
 
413 aa  119  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2527  monooxygenase FAD-binding protein  32.39 
 
 
388 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  32.02 
 
 
410 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  29.18 
 
 
376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  29.92 
 
 
396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1561  monooxygenase FAD-binding  33.42 
 
 
392 aa  117  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0688558  normal  0.0725424 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  32.37 
 
 
378 aa  117  5e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  30.45 
 
 
386 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  33.33 
 
 
421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  31.51 
 
 
385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  30.52 
 
 
412 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1611  zeaxanthin epoxidase (ABA1) (NPQ2)  28.65 
 
 
429 aa  114  3e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.539309  normal  0.0529961 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  34.37 
 
 
400 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  30.56 
 
 
367 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30630  putative FAD-dependent monooxygenase  30 
 
 
382 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0241073 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  29.41 
 
 
385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  29.71 
 
 
385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4355  hypothetical protein  32.82 
 
 
421 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0233973  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  28.49 
 
 
395 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  30.52 
 
 
385 aa  109  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  30.99 
 
 
404 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  32.6 
 
 
420 aa  109  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  28.53 
 
 
378 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  30.56 
 
 
422 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  28.88 
 
 
385 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  30.29 
 
 
404 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2369  monooxygenase FAD-binding protein  33.88 
 
 
371 aa  108  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  30.46 
 
 
391 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  29.19 
 
 
385 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  29.19 
 
 
385 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  33.42 
 
 
402 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  34.23 
 
 
421 aa  107  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7773  monooxygenase FAD-binding  29.65 
 
 
374 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  28.31 
 
 
382 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  30.29 
 
 
404 aa  106  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  32.12 
 
 
412 aa  106  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2705  monooxygenase, FAD-binding protein  31.48 
 
 
423 aa  106  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2701  monooxygenase FAD-binding protein  35.64 
 
 
377 aa  106  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  28.31 
 
 
382 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  32.18 
 
 
402 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  27.99 
 
 
386 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  26.5 
 
 
376 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  32.2 
 
 
399 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  28.53 
 
 
382 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  31 
 
 
388 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  32.76 
 
 
408 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  31.78 
 
 
377 aa  104  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  28.83 
 
 
382 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  30.55 
 
 
400 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  29.6 
 
 
385 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  30.26 
 
 
399 aa  102  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03569  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10180)  30.53 
 
 
711 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.417638  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0019  monooxygenase FAD-binding protein  31.11 
 
 
384 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>