36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4515 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4515  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 378 aa  751    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0335182  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19510  trypsin family protease proenzyme  50.58 
 
 		 381 aa  291  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal  0.125325 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1493  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.99 
 
 		 381 aa  269  7e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.03081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5805  peptidase, S1E (streptogrisin A) subfamily  45.24 
 
 		 374 aa  264  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  47.87 
 
 		 496 aa  259  4e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8917  streptogrisin C  45.59 
 
 		 500 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8916  streptogrisin C  44.87 
 
 		 499 aa  256  6e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8915  streptogrisin C  43.82 
 
 		 522 aa  249  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  46.51 
 
 		 488 aa  248  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2479  streptogrisin C  48.54 
 
 		 501 aa  243  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0239994  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  45.75 
 
 		 522 aa  242  7.999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8918  hypothetical protein  39.54 
 
 		 500 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1492  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.4 
 
 		 384 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0362438 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0814  peptidase alpha-lytic pro domain-containing protein  42.62 
 
 		 399 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8919  hypothetical protein  40.47 
 
 		 507 aa  230  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7728  streptogrisin C  40.64 
 
 		 503 aa  229  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2899  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.91 
 
 		 372 aa  229  7e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.520156 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1566  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.47 
 
 		 380 aa  206  7e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1565  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.57 
 
 		 494 aa  205  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0484  streptogrisin C. Serine peptidase. MEROPS family S01A  40.51 
 
 		 368 aa  196  7e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4297  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.65 
 
 		 368 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2317  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.31 
 
 		 457 aa  193  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.702389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2441  peptidase alpha-lytic pro domain protein  38.89 
 
 		 349 aa  169  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000713419  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3177  peptidase  39.94 
 
 		 344 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0022  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.98 
 
 		 387 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2955  peptidase  38.48 
 
 		 346 aa  146  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.869876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03540  Trypsin  39.83 
 
 		 366 aa  132  7.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.528018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4796  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.13 
 
 		 220 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04150  Trypsin  30.91 
 
 		 392 aa  99  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0409839 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2075  hypothetical protein  24.4 
 
 		 494 aa  62  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.277625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3456  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30.69 
 
 		 800 aa  55.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2547  hypothetical protein  27.37 
 
 		 372 aa  53.9  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3261  hypothetical protein  27.59 
 
 		 823 aa  44.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3056  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.78 
 
 		 696 aa  43.9  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6012  hypothetical protein  26.74 
 
 		 217 aa  43.5  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3387  hypothetical protein  29.45 
 
 		 240 aa  43.1  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>