More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4498 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  37.33 
 
 
2820 aa  684    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  35.51 
 
 
2791 aa  661    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4498  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 
1892 aa  3628    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.693218  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1677  amino acid adenylation domain protein  37.12 
 
 
3289 aa  638    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0362  amino acid adenylation domain-containing protein  39.74 
 
 
2350 aa  627  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.197157 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  38.91 
 
 
7712 aa  620  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  37.58 
 
 
6889 aa  599  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  34.6 
 
 
2867 aa  595  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  36.28 
 
 
3308 aa  595  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  37.05 
 
 
5953 aa  580  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3684  amino acid adenylation domain protein  37.03 
 
 
2109 aa  580  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  37.92 
 
 
8646 aa  582  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  37.57 
 
 
5149 aa  580  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  36.89 
 
 
6676 aa  572  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  36.73 
 
 
9498 aa  567  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  37.2 
 
 
4383 aa  568  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  35.15 
 
 
4531 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  33.49 
 
 
4968 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3577  amino acid adenylation domain protein  39.72 
 
 
2412 aa  566  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  34.9 
 
 
4502 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  32.71 
 
 
3432 aa  563  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2106  amino acid adenylation domain-containing protein  35.66 
 
 
1927 aa  560  1e-158  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  39.31 
 
 
6403 aa  561  1e-158  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  35.04 
 
 
2151 aa  558  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  36.45 
 
 
13537 aa  558  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  37.64 
 
 
4037 aa  557  1e-157  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  37.56 
 
 
5698 aa  558  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  36.3 
 
 
5596 aa  557  1e-157  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  32.36 
 
 
4960 aa  556  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  32.36 
 
 
4960 aa  556  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  36.9 
 
 
5422 aa  555  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  36.69 
 
 
4882 aa  555  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  36.41 
 
 
5328 aa  556  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  35.75 
 
 
2154 aa  553  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  37.96 
 
 
4991 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  36.79 
 
 
2875 aa  550  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  36.47 
 
 
3291 aa  549  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  37.13 
 
 
5654 aa  548  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  36.38 
 
 
3348 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  34.88 
 
 
4747 aa  546  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  39.52 
 
 
1769 aa  545  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0982  amino acid adenylation domain protein  33.6 
 
 
2006 aa  545  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4085  amino acid adenylation domain-containing protein  36.28 
 
 
2606 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  35.79 
 
 
2883 aa  538  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3744  amino acid adenylation domain protein  40.21 
 
 
1110 aa  540  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696362  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  40.09 
 
 
4489 aa  537  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2329  amino acid adenylation domain protein  30.28 
 
 
2752 aa  537  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  38.05 
 
 
4136 aa  536  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  31.59 
 
 
2156 aa  534  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  37 
 
 
5213 aa  536  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  34.11 
 
 
1753 aa  527  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  36.18 
 
 
6176 aa  528  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  36.02 
 
 
1776 aa  530  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3733  amino acid adenylation domain protein  38.73 
 
 
11233 aa  527  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  36.74 
 
 
3470 aa  526  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1859  amino acid adenylation domain-containing protein  35.92 
 
 
2596 aa  526  1e-147  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  38.58 
 
 
3404 aa  526  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3468  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  38.87 
 
 
7541 aa  525  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.247204 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1965  amino acid adenylation domain-containing protein  39.23 
 
 
2439 aa  521  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.229236 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  31.88 
 
 
2156 aa  522  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  38.53 
 
 
1839 aa  523  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  31.83 
 
 
2156 aa  519  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3542  amino acid adenylation domain-containing protein  36.71 
 
 
2845 aa  515  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3731  amino acid adenylation domain-containing protein  39.58 
 
 
1130 aa  513  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201667  normal  0.167868 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  35.63 
 
 
3176 aa  511  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  30.81 
 
 
1336 aa  509  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  36.98 
 
 
3432 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0525  non-ribosomal peptide synthase  37.24 
 
 
3180 aa  505  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4039  amino acid adenylation domain-containing protein  37.67 
 
 
3224 aa  501  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2266  amino acid adenylation  36.68 
 
 
1369 aa  502  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654953  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4786  non-ribosomal peptide synthase  38.45 
 
 
3219 aa  501  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303001  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6558  non-ribosomal peptide synthase  39.54 
 
 
4106 aa  503  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138815 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3685  amino acid adenylation domain protein  33.92 
 
 
1193 aa  500  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3739  amino acid adenylation domain protein  33.92 
 
 
1193 aa  499  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.133452  normal  0.0805981 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4072  amino acid adenylation domain protein  36.84 
 
 
3230 aa  497  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.753138 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1866  amino acid adenylation  41.53 
 
 
1074 aa  495  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.996538  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1598  amino acid adenylation domain-containing protein  39.5 
 
 
3219 aa  496  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546873 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2952  amino acid adenylation domain protein  37.5 
 
 
2012 aa  494  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.537682 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1160  amino acid adenylation  38.35 
 
 
3231 aa  493  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1640  amino acid adenylation domain-containing protein  38.35 
 
 
3231 aa  493  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  30.09 
 
 
3235 aa  490  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2211  amino acid adenylation  35.01 
 
 
2136 aa  489  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  33.91 
 
 
4332 aa  490  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  27.48 
 
 
3291 aa  488  1e-136  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1615  amino acid adenylation domain-containing protein  38.26 
 
 
3221 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0566356 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1558  amino acid adenylation domain-containing protein  38.37 
 
 
3227 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.765691 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21020  putative non-ribosomal peptide synthetase  36.08 
 
 
2352 aa  486  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  33.5 
 
 
4336 aa  481  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3732  amino acid adenylation domain protein  34.95 
 
 
6113 aa  477  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  32.73 
 
 
2571 aa  479  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  32.62 
 
 
2571 aa  479  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1322  amino acid adenylation domain protein  37.31 
 
 
2877 aa  480  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1537  amino acid adenylation domain-containing protein  38.16 
 
 
3227 aa  479  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5751  amino acid adenylation domain protein  32.26 
 
 
1578 aa  479  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  33.42 
 
 
4336 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  34.41 
 
 
4317 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2576  amino acid adenylation  34.12 
 
 
3165 aa  476  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  34.7 
 
 
4342 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  34.59 
 
 
1789 aa  474  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  37.81 
 
 
1779 aa  475  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.279948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>