More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4442 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  50.14 
 
 		 2107 aa  1231    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  45.88 
 
 		 3494 aa  1379    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  47.75 
 
 		 3711 aa  1251    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  51.36 
 
 		 2376 aa  852    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  56.39 
 
 		 1593 aa  860    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  52.94 
 
 		 2374 aa  860    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  62.71 
 
 		 2966 aa  1461    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  47.54 
 
 		 1602 aa  1005    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  38.57 
 
 		 2333 aa  669    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  53.4 
 
 		 1548 aa  809    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  49.13 
 
 		 2060 aa  907    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  48.51 
 
 		 3463 aa  1550    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  44.43 
 
 		 2719 aa  990    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  41.96 
 
 		 2066 aa  1045    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  36.81 
 
 		 3645 aa  707    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  41.38 
 
 		 2846 aa  1032    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  49.42 
 
 		 4151 aa  1375    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  46.06 
 
 		 7279 aa  1436    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  45.73 
 
 		 2113 aa  1097    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  43.13 
 
 		 4930 aa  1250    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.99 
 
 		 2551 aa  667    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.97 
 
 		 1874 aa  662    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  45.57 
 
 		 1867 aa  1035    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  42.42 
 
 		 2890 aa  706    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  41.81 
 
 		 1587 aa  652    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  44.5 
 
 		 1789 aa  1131    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  37.54 
 
 		 1939 aa  699    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  34.96 
 
 		 1832 aa  676    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  47.9 
 
 		 7210 aa  1623    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  42.25 
 
 		 3930 aa  1386    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  43.68 
 
 		 1924 aa  1050    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  52.07 
 
 		 1101 aa  806    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  46.42 
 
 		 2367 aa  998    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  41.16 
 
 		 3176 aa  763    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  51.57 
 
 		 3158 aa  954    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.37 
 
 		 3092 aa  1076    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  100 
 
 		 3670 aa  6993    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  48.1 
 
 		 2081 aa  801    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  45.63 
 
 		 3424 aa  639    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  41.24 
 
 		 4183 aa  746    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4356  KR domain protein  45.4 
 
 		 3400 aa  647    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  39.96 
 
 		 3508 aa  1194    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  47.68 
 
 		 6768 aa  1119    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  49.76 
 
 		 2090 aa  1091    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  39 
 
 		 3693 aa  802    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.58 
 
 		 1816 aa  1269    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  45.98 
 
 		 2020 aa  932    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  52.02 
 
 		 1305 aa  838    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  51.98 
 
 		 3408 aa  1157    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  39.01 
 
 		 3449 aa  1119    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  49.79 
 
 		 1831 aa  1093    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.79 
 
 		 5400 aa  1622    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3478  Acyl transferase  47.56 
 
 		 1573 aa  705    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.87 
 
 		 1837 aa  1011    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  40.62 
 
 		 1354 aa  664    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  55.38 
 
 		 1143 aa  826    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  40.91 
 
 		 2230 aa  751    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  51.02 
 
 		 3355 aa  1057    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  48.75 
 
 		 2847 aa  1301    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  44.69 
 
 		 4111 aa  1004    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  54.2 
 
 		 3254 aa  1039    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  42.33 
 
 		 4478 aa  784    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  48.54 
 
 		 4080 aa  1327    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  56.88 
 
 		 1584 aa  928    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  39 
 
 		 3693 aa  802    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  43.33 
 
 		 1402 aa  682    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  45.04 
 
 		 4882 aa  1472    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  43.37 
 
 		 2277 aa  1128    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.09 
 
 		 3874 aa  1277    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  37.18 
 
 		 2225 aa  647    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  46.13 
 
 		 5255 aa  1363    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  39.58 
 
 		 3676 aa  798    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  42.72 
 
 		 1820 aa  1082    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  39.84 
 
 		 3696 aa  783    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  49.95 
 
 		 1955 aa  795    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  39.55 
 
 		 1805 aa  647    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  40.54 
 
 		 3427 aa  665    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.76 
 
 		 7110 aa  1637    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  50.25 
 
 		 4607 aa  1030    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  55.92 
 
 		 1601 aa  876    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3476  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.75 
 
 		 2078 aa  932    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.975102  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  40.16 
 
 		 2232 aa  723    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  48.89 
 
 		 2108 aa  1100    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  54.76 
 
 		 3148 aa  1017    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  43.86 
 
 		 2880 aa  763    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  47.83 
 
 		 4840 aa  1478    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  51.03 
 
 		 3033 aa  971    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3479  Acyl transferase  48.9 
 
 		 1077 aa  699    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  39.03 
 
 		 3702 aa  802    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  53.09 
 
 		 2126 aa  1206    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.21 
 
 		 2136 aa  640    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  48.24 
 
 		 4575 aa  1318    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  51.75 
 
 		 1114 aa  837    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  53.21 
 
 		 5154 aa  1156    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  49.24 
 
 		 3493 aa  952    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  40.84 
 
 		 1827 aa  645    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  37.53 
 
 		 1966 aa  661    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  38.7 
 
 		 3679 aa  772    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  47.56 
 
 		 2024 aa  744    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  51.3 
 
 		 1071 aa  732    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>