More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4426 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4426  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
364 aa  728    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0345572  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0025  protein serine/threonine phosphatase  63.27 
 
 
474 aa  276  4e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0922005  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0019  protein serine/threonine phosphatases  64.16 
 
 
491 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.678049  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  64.16 
 
 
491 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308307  hitchhiker  0.00998453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0019  protein phosphatase 2C domain-containing protein  64.16 
 
 
491 aa  272  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.888724 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  57.37 
 
 
477 aa  271  1e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  63.27 
 
 
517 aa  271  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  58.33 
 
 
472 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  44.72 
 
 
505 aa  268  1e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  60.09 
 
 
478 aa  268  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0808  protein phosphatase 2C domain-containing protein  62.39 
 
 
516 aa  268  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10018  serine/threonine phosphatase ppp  62.95 
 
 
514 aa  262  6.999999999999999e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000837689  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  53.78 
 
 
519 aa  246  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  54.39 
 
 
463 aa  244  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  52.07 
 
 
482 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  52.07 
 
 
478 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  52.19 
 
 
441 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  52.99 
 
 
463 aa  240  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  52.3 
 
 
421 aa  237  3e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  50.6 
 
 
540 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  50.41 
 
 
500 aa  233  6e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  52.26 
 
 
426 aa  232  9e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  40.56 
 
 
474 aa  225  9e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  51.05 
 
 
507 aa  225  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  52.61 
 
 
467 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  45.18 
 
 
449 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  46.34 
 
 
466 aa  223  6e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0029  protein serine/threonine phosphatase  50.56 
 
 
479 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  51.88 
 
 
469 aa  219  5e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  49.58 
 
 
239 aa  206  4e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1591  Phosphoprotein phosphatase  49.61 
 
 
253 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0030  protein serine/threonine phosphatase  49.15 
 
 
462 aa  204  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  43.32 
 
 
567 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1581  Phosphoprotein phosphatase  50.63 
 
 
265 aa  203  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4818  protein serine/threonine phosphatase  48.8 
 
 
259 aa  202  8e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4532  protein serine/threonine phosphatase  49.37 
 
 
239 aa  200  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1726  protein serine/threonine phosphatase  47.52 
 
 
241 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459048  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1743  protein phosphatase 2C domain-containing protein  47.5 
 
 
241 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0024  protein serine/threonine phosphatases  41.81 
 
 
558 aa  197  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00790  serine/threonine protein phosphatase  45.64 
 
 
571 aa  196  6e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10380  serine/threonine protein phosphatase  47.37 
 
 
255 aa  193  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0515655 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  46.41 
 
 
247 aa  187  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0022  protein serine/threonine phosphatase  47.66 
 
 
511 aa  182  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  42.49 
 
 
395 aa  180  4e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1379  serine/threonine protein phosphatase  43.57 
 
 
564 aa  177  3e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  42.86 
 
 
452 aa  175  9.999999999999999e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  43.15 
 
 
554 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  41.06 
 
 
438 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4033  protein serine/threonine phosphatase  44.35 
 
 
404 aa  172  6.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  42.44 
 
 
425 aa  172  9e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00220  serine/threonine protein phosphatase  44.74 
 
 
519 aa  169  9e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  42.68 
 
 
394 aa  162  1e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0035  protein serine/threonine phosphatase  48.31 
 
 
687 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6203  protein serine/threonine phosphatase  42.98 
 
 
239 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00400248  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  37.55 
 
 
238 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.29 
 
 
247 aa  149  9e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  42.37 
 
 
369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  36.96 
 
 
323 aa  147  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  41.67 
 
 
236 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1292  protein serine/threonine phosphatases  37.99 
 
 
325 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  43.32 
 
 
361 aa  144  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  37.3 
 
 
276 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1155  protein serine/threonine phosphatase  46.29 
 
 
267 aa  143  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21560  serine/threonine protein phosphatase  44.34 
 
 
293 aa  142  7e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.146725  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2562  protein serine/threonine phosphatases  40.17 
 
 
256 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144925  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  40.24 
 
 
422 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  36.75 
 
 
538 aa  140  4.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5189  protein serine/threonine phosphatase  40.16 
 
 
266 aa  139  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  37.07 
 
 
258 aa  139  8.999999999999999e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  39.33 
 
 
416 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3382  protein serine/threonine phosphatase  37.5 
 
 
240 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3847  protein serine/threonine phosphatase  37.83 
 
 
239 aa  138  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000749886  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  36.86 
 
 
236 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0912  protein serine/threonine phosphatase  39.48 
 
 
276 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1992  protein phosphatase 2C family protein  34.93 
 
 
239 aa  137  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.82 
 
 
237 aa  136  5e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  38.3 
 
 
259 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  38.3 
 
 
259 aa  135  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  39.3 
 
 
611 aa  135  9e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  40.42 
 
 
355 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1303  protein phosphatase 2C-like protein  36.07 
 
 
247 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.244984  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1278  protein phosphatase 2C-like protein  36.07 
 
 
247 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1710  protein phosphatase 2C family protein  34.5 
 
 
239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  40 
 
 
597 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3950  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.8 
 
 
261 aa  134  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0256176 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  34.41 
 
 
245 aa  134  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3050  protein serine/threonine phosphatase  37.67 
 
 
267 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  36.13 
 
 
236 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.45 
 
 
271 aa  133  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  36.48 
 
 
256 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3965  protein serine/threonine phosphatase  35.66 
 
 
244 aa  132  7.999999999999999e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0785  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.86 
 
 
247 aa  132  9e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0068  serine/threonine specific protein phosphatase (putative)  38.27 
 
 
269 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  36.13 
 
 
250 aa  130  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0437  protein phosphatase 2C-like  37.19 
 
 
296 aa  130  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.018902 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0192  protein serine/threonine phosphatase  37.86 
 
 
268 aa  130  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4004  protein serine/threonine phosphatase  37.28 
 
 
256 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467216  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1044  protein serine/threonine phosphatase  33.05 
 
 
245 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0477  protein serine/threonine phosphatases  38.16 
 
 
256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3389  protein serine/threonine phosphatase  36.63 
 
 
271 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.830216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>