138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4331 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  100 
 
 		 414 aa  849    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2053  Chitosanase  76.5 
 
 		 291 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  48.39 
 
 		 634 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  48 
 
 		 426 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.11 
 
 		 933 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  42.52 
 
 		 492 aa  113  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.6 
 
 		 1072 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  43.75 
 
 		 803 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  39.13 
 
 		 417 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  41.79 
 
 		 890 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  44.44 
 
 		 732 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  41.84 
 
 		 801 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  44.35 
 
 		 452 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  44.26 
 
 		 1207 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  44.88 
 
 		 574 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  44.03 
 
 		 492 aa  102  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  41.27 
 
 		 522 aa  99.8  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  40.87 
 
 		 469 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  40.17 
 
 		 446 aa  96.7  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  39.68 
 
 		 488 aa  96.3  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  41.53 
 
 		 558 aa  96.3  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  40.98 
 
 		 479 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  41.38 
 
 		 489 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  42.11 
 
 		 516 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  40.17 
 
 		 368 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  40.8 
 
 		 373 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  41.67 
 
 		 498 aa  93.2  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  32.92 
 
 		 589 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  37.42 
 
 		 384 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  37.5 
 
 		 472 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  36.67 
 
 		 801 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  36.72 
 
 		 603 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  39.32 
 
 		 801 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  36.67 
 
 		 490 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  39.17 
 
 		 380 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  39.68 
 
 		 627 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  41.23 
 
 		 1128 aa  88.2  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  40.8 
 
 		 497 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  36.03 
 
 		 709 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  41.32 
 
 		 423 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  37.5 
 
 		 493 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  38.58 
 
 		 451 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  34.27 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  36.75 
 
 		 374 aa  83.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01820  conserved hypothetical protein  35.2 
 
 		 571 aa  82.8  0.000000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  37.59 
 
 		 548 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  38.14 
 
 		 489 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  36.67 
 
 		 547 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  35.54 
 
 		 496 aa  80.9  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  36.75 
 
 		 468 aa  80.5  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  36.8 
 
 		 500 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  33.61 
 
 		 461 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  33.99 
 
 		 165 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  35.71 
 
 		 568 aa  77.4  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  34.85 
 
 		 567 aa  73.9  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  29.88 
 
 		 672 aa  73.2  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  32.79 
 
 		 642 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  34.78 
 
 		 476 aa  70.9  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  43.24 
 
 		 580 aa  70.9  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0179568 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3775  Ricin B lectin  34.43 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.37 
 
 		 815 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  41.76 
 
 		 487 aa  67.4  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  31.85 
 
 		 503 aa  66.6  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  32.52 
 
 		 535 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  33.9 
 
 		 465 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  40.43 
 
 		 436 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.03 
 
 		 531 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  32.37 
 
 		 794 aa  60.5  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  34.4 
 
 		 497 aa  60.5  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  37.36 
 
 		 474 aa  60.1  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1280  YD repeat-containing protein  34.13 
 
 		 2615 aa  57.4  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0638094 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  33.11 
 
 		 597 aa  57  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  33.06 
 
 		 653 aa  56.6  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  35.34 
 
 		 1259 aa  56.6  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  31.67 
 
 		 806 aa  56.2  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  28.05 
 
 		 482 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1395  galactose oxidase  32.52 
 
 		 1100 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.610012  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  33.33 
 
 		 648 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  26.38 
 
 		 644 aa  54.7  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3632  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  37.97 
 
 		 468 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4177  Pectate lyase  31.45 
 
 		 430 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4280  Ricin B lectin  32.77 
 
 		 494 aa  53.9  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.104165 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  32.14 
 
 		 483 aa  53.5  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  30 
 
 		 494 aa  53.5  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  32 
 
 		 571 aa  53.1  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.08 
 
 		 507 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6476  Ricin B lectin  30.71 
 
 		 166 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  31.3 
 
 		 695 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6977  hypothetical protein  33.12 
 
 		 897 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449457  normal  0.690746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  29.03 
 
 		 493 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  29.1 
 
 		 858 aa  51.2  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1368  galactose oxidase-related protein  29.85 
 
 		 858 aa  50.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0445018  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1597  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  29.85 
 
 		 858 aa  50.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  31.75 
 
 		 566 aa  50.4  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0847  galactose oxidase-related protein  29.85 
 
 		 805 aa  50.4  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1758  lectin repeat-containing protein  29.85 
 
 		 807 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0506  galactose oxidase-related protein  29.85 
 
 		 800 aa  50.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0650  galactose oxidase-related protein  29.85 
 
 		 800 aa  50.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.173202  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  31.9 
 
 		 1139 aa  50.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  33.59 
 
 		 737 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>