More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4278 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 199 aa  386  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  48.07 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  41.62 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02120  transcriptional regulator, tetR family  44.57 
 
 		 194 aa  115  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.19222  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 174 aa  99.4  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4504  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 216 aa  98.2  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  35.96 
 
 		 174 aa  93.2  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 184 aa  92.8  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 188 aa  92  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  34.24 
 
 		 188 aa  91.7  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  34.87 
 
 		 231 aa  90.5  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 266 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 209 aa  90.5  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 199 aa  89.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 220 aa  89.4  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  37.57 
 
 		 190 aa  87.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 185 aa  86.7  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5370  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 187 aa  85.5  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  36.6 
 
 		 203 aa  85.9  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 194 aa  85.1  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 214 aa  85.1  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 207 aa  84.7  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 222 aa  85.1  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 222 aa  84.7  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  35.86 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  35.6 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  39.26 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0256  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 227 aa  81.3  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.968825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  36.84 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  33.84 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2057  putative transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334012  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  33.84 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  31.61 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  35.86 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  35.32 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4137  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.857074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5248  putative transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  31.52 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4122  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4496  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4583  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.204371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4879  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  32.51 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19730  transcriptional regulator, tetR family  35.14 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.453369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5157  transcriptional regulator, TetR family  37.16 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  35.83 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009380  Strop_2944  regulatory protein, TetR  31.55 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0291175  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 216 aa  72  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_1574  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0394993 
 
 
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NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
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NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
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NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
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NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  35.08 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
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NC_009921  Franean1_0927  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.468026  normal  0.980038 
 
 
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NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
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NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  33.99 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_2371  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0164383  normal  0.061065 
 
 
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NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_1551  TetR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_1574  TetR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_0024  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.823038 
 
 
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