282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4251 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4251  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  100 
 
 		 447 aa  880    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.044314  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7573  putative short chain dehydrogenase  61.96 
 
 		 454 aa  513  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2398  oxidoreductase  60.72 
 
 		 437 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4441  putative short chain dehydrogenase  53.91 
 
 		 474 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5303  oxidoreductase  51.77 
 
 		 463 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4871  putative short chain dehydrogenase  52.84 
 
 		 495 aa  410  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00534901  normal  0.736841 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2139  putative short chain dehydrogenase  48.41 
 
 		 483 aa  395  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.538588  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1886  putative oxidoreductase  48.62 
 
 		 483 aa  393  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00334435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0884  putative short chain dehydrogenase  48.24 
 
 		 570 aa  393  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00530  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  48.08 
 
 		 482 aa  390  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.191096  normal  0.164201 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0270  putative short chain dehydrogenase  51.35 
 
 		 503 aa  390  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0850168  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.06 
 
 		 485 aa  386  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1920  putative short chain dehydrogenase  58.05 
 
 		 500 aa  375  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1055  oxidoreductase  46.53 
 
 		 507 aa  373  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.730863  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00730  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  48.85 
 
 		 529 aa  363  2e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1517  oxidoreductase  50.65 
 
 		 492 aa  362  6e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04190  oxidoreductase  47.04 
 
 		 527 aa  321  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10158  short-chain dehydrogenase  40.14 
 
 		 509 aa  288  1e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44390  predicted protein  38.94 
 
 		 433 aa  278  1e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0516105 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2199  oxidoreductase  45.89 
 
 		 539 aa  266  7e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0323008  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1626  oxidoreductase  44.96 
 
 		 539 aa  264  3e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.498473  normal  0.638708 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1678  oxidoreductase  45.64 
 
 		 538 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00133842  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1749  oxidoreductase  45.64 
 
 		 535 aa  261  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0726127  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45855  predicted protein  38.24 
 
 		 650 aa  159  8e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.306932  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0068  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 		 368 aa  57  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.521735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  35.51 
 
 		 317 aa  57  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 		 239 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5585  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 		 265 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.892025  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 324 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1793  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33 
 
 		 268 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152096  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37 
 
 		 328 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.392114 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.77 
 
 		 240 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 314 aa  54.3  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.04 
 
 		 340 aa  54.3  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138732  normal  0.0406215 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.14 
 
 		 255 aa  53.5  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6414  gluconate 5-dehydrogenase  35.92 
 
 		 254 aa  53.1  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118789  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.3 
 
 		 238 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.539797 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 		 263 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.46 
 
 		 300 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319997  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.46 
 
 		 341 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 		 253 aa  51.2  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0335723  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4511  gluconate 5-dehydrogenase  33.98 
 
 		 254 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2577  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 		 316 aa  51.2  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.64 
 
 		 227 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4174  short chain dehydrogenase  36.54 
 
 		 312 aa  50.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.865375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.48 
 
 		 255 aa  50.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.19 
 
 		 285 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2394  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 268 aa  50.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.097477 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.53 
 
 		 265 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.276999  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.53 
 
 		 265 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.395097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.53 
 
 		 265 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0685989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0277  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.79 
 
 		 251 aa  50.1  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1674  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.85 
 
 		 254 aa  50.1  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.69 
 
 		 288 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000784864  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.7 
 
 		 241 aa  49.7  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10815  conserved hypothetical protein  30.39 
 
 		 323 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 		 252 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 		 258 aa  48.9  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.5 
 
 		 206 aa  48.5  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0777  gluconate 5-dehydrogenase  35.92 
 
 		 251 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618291  hitchhiker  0.00200145 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 343 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0949  gluconate 5-dehydrogenase  30.28 
 
 		 264 aa  49.3  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161447 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.71 
 
 		 233 aa  48.9  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.5 
 
 		 286 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2559  Short-chain alcohol dehydrogenase  25.26 
 
 		 339 aa  48.5  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 		 312 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711865  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 		 266 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4753  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.97 
 
 		 284 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163262  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7084  gluconate 5-dehydrogenase  32.71 
 
 		 255 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.86 
 
 		 257 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.105018 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3748  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.67 
 
 		 331 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5032  gluconate 5-dehydrogenase  36.89 
 
 		 252 aa  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.8 
 
 		 341 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.406343  normal  0.0918592 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.11 
 
 		 339 aa  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.56 
 
 		 265 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3494  short chain dehydrogenase  32.06 
 
 		 664 aa  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.447449 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3854  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 262 aa  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.449254  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22650  short-chain alcohol dehydrogenase like protein  35.19 
 
 		 306 aa  48.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 		 286 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453828  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1267  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26 
 
 		 232 aa  47.8  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.139748 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4591  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.1 
 
 		 261 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 315 aa  47.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 		 328 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 		 260 aa  47.8  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.64 
 
 		 265 aa  47.4  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.69 
 
 		 351 aa  47.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1310  acetoacetyl-CoA reductase  34 
 
 		 248 aa  47.4  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0726  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.67 
 
 		 366 aa  47.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.642345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46750  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 		 257 aa  47.4  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.658343  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2129  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.35 
 
 		 289 aa  47  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 259 aa  47.4  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.68 
 
 		 268 aa  47.4  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110514  normal  0.280758 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6825  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.85 
 
 		 255 aa  47  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.966986 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0947  gluconate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  33.01 
 
 		 258 aa  47  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.815693 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.9 
 
 		 339 aa  47  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0273  short chain dehydrogenase  26.54 
 
 		 334 aa  47  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.698832 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4202  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 		 344 aa  47  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2450  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 248 aa  47  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00157623  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 		 253 aa  46.6  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.129193  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3899  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 		 284 aa  47  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.190456 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>