More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4235 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  100 
 
 		 400 aa  776    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  47.19 
 
 		 412 aa  312  5.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  46.48 
 
 		 400 aa  298  9e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  41.4 
 
 		 405 aa  296  5e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  44.25 
 
 		 406 aa  295  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  45.24 
 
 		 408 aa  291  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  43.58 
 
 		 411 aa  281  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  43.51 
 
 		 400 aa  280  4e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  35.57 
 
 		 420 aa  272  6e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  40.49 
 
 		 410 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  43.36 
 
 		 394 aa  263  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  38.87 
 
 		 411 aa  262  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  39.64 
 
 		 419 aa  260  3e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  42.86 
 
 		 414 aa  257  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  39.05 
 
 		 412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  39.75 
 
 		 402 aa  249  4e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  40.43 
 
 		 426 aa  249  8e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  41.21 
 
 		 402 aa  247  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  43.63 
 
 		 418 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  39.03 
 
 		 417 aa  245  9e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  41.08 
 
 		 423 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  39.79 
 
 		 401 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  42.01 
 
 		 402 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  39.05 
 
 		 396 aa  242  7e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  39.43 
 
 		 398 aa  241  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  39.07 
 
 		 399 aa  240  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  39.61 
 
 		 410 aa  239  5.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  40.41 
 
 		 406 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  40.41 
 
 		 406 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  40.41 
 
 		 406 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  40.26 
 
 		 406 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  40.93 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  42.71 
 
 		 429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  39.23 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  39.2 
 
 		 420 aa  233  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  42.28 
 
 		 436 aa  233  5e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  38.68 
 
 		 399 aa  232  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  39.59 
 
 		 395 aa  231  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  40.05 
 
 		 402 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  38.56 
 
 		 421 aa  231  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  39.02 
 
 		 406 aa  230  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  33.76 
 
 		 411 aa  230  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  39.14 
 
 		 398 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  42.43 
 
 		 423 aa  229  6e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  39.53 
 
 		 400 aa  229  7e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  40.72 
 
 		 430 aa  229  9e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  37.59 
 
 		 408 aa  228  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  40 
 
 		 422 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  40.25 
 
 		 398 aa  227  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2802  putative cytochrome P450  37.19 
 
 		 409 aa  226  4e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  37.78 
 
 		 399 aa  225  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  40.45 
 
 		 392 aa  225  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  37.24 
 
 		 401 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  37.99 
 
 		 407 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  39.07 
 
 		 388 aa  224  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  37.99 
 
 		 407 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  32.51 
 
 		 411 aa  224  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7442  Cytochrome P450-like protein  38.04 
 
 		 571 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  33.15 
 
 		 411 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  36.57 
 
 		 399 aa  224  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  34.35 
 
 		 380 aa  223  4e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  33.15 
 
 		 411 aa  222  7e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  33.15 
 
 		 411 aa  223  7e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  32.87 
 
 		 411 aa  222  9e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  32.87 
 
 		 411 aa  222  9e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  32.79 
 
 		 411 aa  222  9e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  32.87 
 
 		 411 aa  222  9e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  33.06 
 
 		 411 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  39.18 
 
 		 412 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  36.67 
 
 		 408 aa  222  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1860  cytochrome P450  37.47 
 
 		 459 aa  221  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  39.69 
 
 		 399 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  39.29 
 
 		 405 aa  220  3.9999999999999997e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2750  cytochrome P450  37.69 
 
 		 416 aa  219  5e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  38.64 
 
 		 411 aa  219  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  40.33 
 
 		 395 aa  219  5e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4949  cytochrome P450  37.03 
 
 		 412 aa  219  7e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  37.06 
 
 		 409 aa  219  7.999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  32.32 
 
 		 411 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  44.48 
 
 		 409 aa  219  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  35.9 
 
 		 407 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  38.64 
 
 		 412 aa  216  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0869  cytochrome P450  33.51 
 
 		 415 aa  217  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  38.83 
 
 		 407 aa  216  5.9999999999999996e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  40.91 
 
 		 406 aa  216  7e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  39.32 
 
 		 400 aa  215  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  39.39 
 
 		 398 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  38.18 
 
 		 407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  38.18 
 
 		 407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  38.18 
 
 		 407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  37.1 
 
 		 405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9048  hypothetical protein  37.53 
 
 		 404 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  36.43 
 
 		 395 aa  213  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4485  cytochrome P450  38.89 
 
 		 421 aa  213  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal  0.78931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  38.34 
 
 		 400 aa  212  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  38.38 
 
 		 412 aa  212  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2452  cytochrome P450 family protein  34.06 
 
 		 404 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0252404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2414  cytochrome P450  35.26 
 
 		 404 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000201211  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2632  cytochrome P450 family protein  34.06 
 
 		 404 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290952  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2650  cytochrome P450 family protein  34.06 
 
 		 404 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000122634 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>