150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4183 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4183  Tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 549 aa  1038    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4182  AAA ATPase  35.25 
 
 		 690 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24570  DNA integrity scanning protein DisA  44.76 
 
 		 361 aa  99  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0156  hypothetical protein  41.06 
 
 		 394 aa  95.1  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0229  DNA integrity scanning protein DisA  37.93 
 
 		 368 aa  93.6  9e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.743855 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5343  DNA integrity scanning protein DisA  37.25 
 
 		 373 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1441  DNA integrity scanning protein DisA  36.6 
 
 		 373 aa  92  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69371  normal  0.310912 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4270  DNA integrity scanning protein DisA  39.86 
 
 		 391 aa  92.4  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0977721 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4700  DNA integrity scanning protein DisA  39.86 
 
 		 391 aa  92.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  31.37 
 
 		 941 aa  91.7  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9144  DNA integrity scanning protein DisA  41.22 
 
 		 361 aa  90.9  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4467  protein of unknown function DUF147  40.69 
 
 		 361 aa  90.1  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4743  DNA integrity scanning protein DisA  39.58 
 
 		 371 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557904  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4829  DNA integrity scanning protein DisA  39.58 
 
 		 371 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.832483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5129  DNA integrity scanning protein DisA  39.58 
 
 		 371 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8362  DNA integrity scanning protein DisA  38.73 
 
 		 362 aa  87.4  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  22.41 
 
 		 1238 aa  87.4  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0602  DNA integrity scanning protein DisA  37.76 
 
 		 359 aa  86.7  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.594606  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0966  protein of unknown function DUF147  37.25 
 
 		 359 aa  84.7  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105667  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0159  DNA integrity scanning protein DisA  35.1 
 
 		 363 aa  84.7  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000331383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3280  DNA integrity scanning protein DisA  36.3 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.360002  hitchhiker  0.00479784 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13619  DNA integrity scanning protein DisA  37.67 
 
 		 358 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.391574  normal  0.0991007 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06870  predicted nucleic-acid-binding protein (contains the HHH domain)  36.36 
 
 		 361 aa  82.8  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0343  DNA integrity scanning protein DisA  31.6 
 
 		 358 aa  82.4  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0863  DNA integrity scanning protein DisA  37.76 
 
 		 362 aa  82.8  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.51042 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0083  DNA integrity scanning protein DisA  35.71 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0083  DNA integrity scanning protein DisA  35.71 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0080  DNA integrity scanning protein DisA  35.71 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0079  DNA integrity scanning protein DisA  35.71 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0082  DNA integrity scanning protein DisA  35.71 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0565  DNA integrity scanning, DisA, linker region  37.5 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.336088  hitchhiker  0.00662065 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0644  DNA integrity scanning, DisA, linker region  33.77 
 
 		 361 aa  81.6  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0358  DNA integrity scanning protein DisA  33.77 
 
 		 359 aa  82  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121799  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0093  DNA integrity scanning protein DisA  35.71 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0598  protein of unknown function DUF147  34.87 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198983  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0396  protein of unknown function DUF147  36.11 
 
 		 361 aa  81.6  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 1071 aa  81.6  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0113  DNA integrity scanning protein DisA  33.11 
 
 		 357 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0104  DNA integrity scanning protein DisA  35.71 
 
 		 357 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0360377  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0190  DNA integrity scanning protein DisA  30.19 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0078  DNA integrity scanning protein DisA  33.78 
 
 		 357 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 		 1101 aa  80.5  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0078  DNA integrity scanning protein DisA  35.71 
 
 		 357 aa  80.5  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4259  DNA integrity scanning protein DisA  38.46 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.321081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5222  DNA integrity scanning protein DisA  35 
 
 		 357 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0527052  unclonable  8.74316e-26 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0469  DNA integrity scanning protein DisA  37.41 
 
 		 360 aa  79.7  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0469661  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1902  DNA integrity scanning protein DisA  32.68 
 
 		 356 aa  80.1  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.659686  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0492  DNA integrity scanning protein DisA  33.97 
 
 		 362 aa  78.2  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0442874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 		 1060 aa  78.2  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  28.09 
 
 		 1020 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1478  DNA integrity scanning protein DisA  31.76 
 
 		 351 aa  76.3  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.108423  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.06 
 
 		 991 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  31.02 
 
 		 940 aa  75.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  24.78 
 
 		 1313 aa  75.5  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2429  DNA integrity scanning protein DisA  30.07 
 
 		 354 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  32.92 
 
 		 792 aa  74.7  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 1048 aa  73.9  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2457  protein of unknown function DUF147  28.25 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  25.64 
 
 		 782 aa  73.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1785  DNA integrity scanning protein DisA  30.5 
 
 		 360 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000327916  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2738  DNA integrity scanning protein DisA  33.1 
 
 		 359 aa  72.8  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.403042  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  25.12 
 
 		 1266 aa  70.9  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0397  DNA integrity scanning protein DisA  32.33 
 
 		 352 aa  70.5  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.265601  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0183  DNA integrity scanning protein DisA  32.14 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.876068  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0337  DNA integrity scanning protein DisA  29.19 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.828831  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 		 850 aa  70.1  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  33.96 
 
 		 788 aa  69.3  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1686  DNA integrity scanning, DisA, linker region  31.97 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.464542  normal  0.642292 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 		 343 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  28.29 
 
 		 1025 aa  67  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  29.78 
 
 		 412 aa  66.6  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0257  DNA integrity scanning protein DisA  31.21 
 
 		 359 aa  66.6  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000169312  normal  0.123305 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 1063 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2365  DNA integrity scanning protein DisA  35.94 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000427921  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  27.59 
 
 		 985 aa  64.3  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2177  DNA integrity scanning protein DisA  31.76 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.441332  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1857  DNA integrity scanning protein DisA  24.66 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.340997  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0183  DNA integrity scanning protein DisA  31.58 
 
 		 358 aa  63.5  0.000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00396468  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0939  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 		 714 aa  62.8  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00890  DNA integrity scanning protein DisA  31.91 
 
 		 359 aa  63.5  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000509025  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  28.19 
 
 		 967 aa  62.4  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  22.91 
 
 		 957 aa  61.6  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  27.66 
 
 		 928 aa  60.8  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 		 1526 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  29.17 
 
 		 1914 aa  60.1  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0775  protein of unknown function DUF147  28.37 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0087  DNA integrity scanning protein DisA  26.28 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1185  DNA integrity scanning protein DisA  30.13 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0217461 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0724  DNA integrity scanning protein DisA  25 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0748  DNA integrity scanning protein DisA  28.48 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3944  Tetratricopeptide TPR_4  30.43 
 
 		 705 aa  57  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.664408  normal  0.0198084 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  26.21 
 
 		 755 aa  56.6  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  28.62 
 
 		 992 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  27.01 
 
 		 965 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 		 408 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  27.76 
 
 		 946 aa  54.7  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4985  Tetratricopeptide TPR_4  32.28 
 
 		 687 aa  54.3  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.688243  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  29.5 
 
 		 978 aa  54.7  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 1450 aa  54.3  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  31.84 
 
 		 931 aa  54.3  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>