More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4174 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
493 aa  986  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04840  protein kinase family protein  53.07 
 
 
575 aa  263  5e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576208  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3275  serine/threonine protein kinase  53.64 
 
 
855 aa  263  6e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667019  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16830  serine/threonine protein kinase  43.57 
 
 
559 aa  261  2e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.753908  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24040  protein kinase family protein  53.14 
 
 
509 aa  260  3e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0282375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6520  serine/threonine protein kinase  53.62 
 
 
466 aa  260  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397338  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6521  serine/threonine protein kinase  55.59 
 
 
553 aa  261  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3766  serine/threonine protein kinase  52.51 
 
 
571 aa  250  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102258  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0472  serine/threonine protein kinase  50.72 
 
 
554 aa  243  6e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1744  Serine/threonine protein kinase-related protein  49.47 
 
 
405 aa  227  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.679027  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0916  serine/threonine protein kinase  42.02 
 
 
385 aa  227  4e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1813  serine/threonine protein kinase  45.7 
 
 
411 aa  217  3e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  42.57 
 
 
776 aa  218  3e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3968  serine/threonine protein kinase  46.55 
 
 
528 aa  216  6e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2884  serine/threonine protein kinase  44.7 
 
 
525 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824247 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  42.12 
 
 
419 aa  200  4e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  44.87 
 
 
468 aa  199  1e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0683  serine/threonine protein kinase  41.79 
 
 
695 aa  197  4e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.923157  normal  0.0435731 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6420  serine/threonine protein kinase  39.68 
 
 
605 aa  197  5e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1079  serine/threonine protein kinase  44.4 
 
 
422 aa  195  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2888  Serine/threonine protein kinase-like protein  47.21 
 
 
659 aa  193  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.301029  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6454  serine/threonine protein kinase  44.81 
 
 
705 aa  193  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00864828 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  43.87 
 
 
562 aa  193  7e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3084  serine/threonine protein kinase  40.59 
 
 
766 aa  192  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25260  protein kinase family protein  40.71 
 
 
501 aa  191  3e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.981301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5936  serine/threonine protein kinase  40.96 
 
 
1029 aa  190  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0831  protein kinase  42.38 
 
 
675 aa  189  9e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.060355 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6592  serine/threonine protein kinase  46.27 
 
 
468 aa  188  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.700225  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8510  Serine/threonine protein kinase-like protein  41.48 
 
 
596 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  43.63 
 
 
461 aa  188  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6676  Serine/threonine protein kinase-like protein  41.1 
 
 
678 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520926  normal  0.364825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7153  Serine/threonine protein kinase-like protein  42.91 
 
 
531 aa  186  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.917924  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1619  serine/threonine protein kinase  45.1 
 
 
703 aa  186  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.682192  normal  0.0463489 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2236  serine/threonine protein kinase  41.95 
 
 
632 aa  186  8e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129729  normal  0.143063 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1354  serine/threonine protein kinase  40.52 
 
 
535 aa  186  1e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153882  normal  0.839237 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4419  serine/threonine protein kinase  41.25 
 
 
563 aa  185  2e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4747  serine/threonine protein kinase  43.27 
 
 
470 aa  185  2e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0359  serine/threonine protein kinase  42.35 
 
 
631 aa  185  2e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0775  serine/threonine protein kinase  42.01 
 
 
659 aa  184  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.37143 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05660  serine/threonine protein kinase  43.77 
 
 
419 aa  184  4e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8509  protein kinase  40.92 
 
 
377 aa  184  4e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355272  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0406  serine/threonine protein kinase  42.38 
 
 
418 aa  183  6e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0682  serine/threonine protein kinase  41.09 
 
 
674 aa  183  6e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239095  normal  0.045288 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1978  protein kinase  47.19 
 
 
482 aa  183  7e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193562  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1542  Serine/threonine protein kinase-like protein  41.24 
 
 
521 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8906  serine/threonine protein kinase  43.7 
 
 
525 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1544  Serine/threonine protein kinase-like protein  40.54 
 
 
532 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.372452  normal  0.854726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2889  Serine/threonine protein kinase-like protein  44.73 
 
 
668 aa  177  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888363  normal  0.315784 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0106  serine/threonine protein kinase  40.53 
 
 
674 aa  177  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0852  protein kinase  41.13 
 
 
621 aa  176  1e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0129  serine/threonine protein kinase  44.44 
 
 
345 aa  175  2e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0798  serine/threonine protein kinase  38.83 
 
 
638 aa  173  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  1.82668e-05 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0729  serine/threonine protein kinase  39.1 
 
 
464 aa  173  5e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.44074  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4798  Serine/threonine protein kinase-like protein  39.33 
 
 
446 aa  173  7e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263981  normal  0.132611 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5809  serine/threonine protein kinase  41.43 
 
 
487 aa  173  7e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  34.75 
 
 
646 aa  172  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2411  serine/threonine protein kinase  41.33 
 
 
507 aa  172  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380657  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  41.22 
 
 
596 aa  172  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1382  serine/threonine protein kinase  43.27 
 
 
316 aa  171  3e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0097  serine/threonine protein kinase  41.52 
 
 
675 aa  170  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.255203  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2438  Serine/threonine protein kinase-like protein  41 
 
 
620 aa  170  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00115665 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  38.19 
 
 
615 aa  169  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4395  serine/threonine protein kinase  41.77 
 
 
465 aa  167  3e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1643  serine/threonine protein kinase  39.51 
 
 
534 aa  167  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0994433  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  37.89 
 
 
666 aa  167  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4070  serine/threonine protein kinase  41.61 
 
 
673 aa  166  7e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00170756  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  37.93 
 
 
403 aa  166  7e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.86 
 
 
632 aa  166  1e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  38.97 
 
 
623 aa  166  1e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  35.02 
 
 
612 aa  166  1e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2410  serine/threonine protein kinase  39.57 
 
 
460 aa  165  1e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1389  protein kinase  41.64 
 
 
412 aa  165  2e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00892717  normal  0.37108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1316  serine/threonine protein kinase  41.72 
 
 
503 aa  165  2e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  38.97 
 
 
651 aa  164  3e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  36.16 
 
 
618 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5937  serine/threonine protein kinase  40.89 
 
 
617 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.59 
 
 
591 aa  164  4e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  35.82 
 
 
593 aa  164  4e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  37.67 
 
 
776 aa  164  4e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.42 
 
 
740 aa  164  4e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.56 
 
 
613 aa  164  5e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5771  serine/threonine protein kinase  38.56 
 
 
405 aa  163  5e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.427583 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5484  serine/threonine protein kinase  38.56 
 
 
403 aa  163  5e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.403058  normal  0.388642 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5395  serine/threonine protein kinase  38.56 
 
 
403 aa  163  5e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300977  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4028  serine/threonine protein kinase  35.2 
 
 
493 aa  163  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0137121  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  32.18 
 
 
691 aa  163  7e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.93 
 
 
650 aa  162  9e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  32.57 
 
 
692 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  44.29 
 
 
642 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3066  serine/threonine protein kinase  34.29 
 
 
598 aa  162  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370725  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  34.41 
 
 
612 aa  161  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3421  serine/threonine protein kinase  42.35 
 
 
391 aa  161  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000661816  hitchhiker  0.000104495 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.92 
 
 
614 aa  161  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0635  serine/threonine protein kinase  38.46 
 
 
721 aa  160  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.54 
 
 
598 aa  160  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  1.13845e-05  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3648  Serine/threonine protein kinase-related protein  34.18 
 
 
1655 aa  160  5e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152194  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  38.32 
 
 
468 aa  160  6e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2069  serine/threonine protein kinase  44.86 
 
 
501 aa  159  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.832371  normal  0.49505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7418  serine/threonine protein kinase  37.29 
 
 
543 aa  159  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125442  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3681  serine/threonine protein kinase  37.94 
 
 
614 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232479 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>