59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4089 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4089  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  779    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3685  hypothetical protein  39.25 
 
 		 420 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2198  hypothetical protein  40.14 
 
 		 408 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2916  hypothetical protein  40 
 
 		 470 aa  138  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189824  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4234  sugar transporter superfamily protein  40.73 
 
 		 402 aa  137  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2282  Protein of unknown function DUF2029  35.02 
 
 		 469 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291881  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06020  Protein of unknown function (DUF2029)  34.68 
 
 		 444 aa  130  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.179625 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0993  hypothetical protein  38.23 
 
 		 411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4020  Protein of unknown function DUF2029  37.5 
 
 		 426 aa  125  9e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643753  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21610  Protein of unknown function (DUF2029)  36.89 
 
 		 421 aa  125  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0338543  normal  0.0110628 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4322  mannosyltransferase  33.74 
 
 		 417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21600  Protein of unknown function (DUF2029)  34.28 
 
 		 467 aa  121  3e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0988113  hitchhiker  0.00696231 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2502  Protein of unknown function DUF2029  32.91 
 
 		 414 aa  116  8.999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0425  hypothetical protein  35.42 
 
 		 417 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0435  hypothetical protein  35.42 
 
 		 417 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0453  mannosyltransferase  29.23 
 
 		 438 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0466  mannosyltransferase  29.23 
 
 		 438 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0477  mannosyltransferase  29.23 
 
 		 438 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5506  hypothetical protein  34.4 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344164  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0743  mannosyltransferase  33.91 
 
 		 398 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5329  hypothetical protein  32.55 
 
 		 478 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4545  hypothetical protein  33.99 
 
 		 477 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11183  mannosyltransferase  33.8 
 
 		 431 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1385  hypothetical protein  33.82 
 
 		 412 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3057  hypothetical protein  33.33 
 
 		 494 aa  98.6  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6115  hypothetical protein  30.23 
 
 		 479 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112096  normal  0.027736 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0243  putative integral membrane protein  34.77 
 
 		 417 aa  97.4  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5433  hypothetical protein  31.99 
 
 		 420 aa  97.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5055  hypothetical protein  33.76 
 
 		 477 aa  97.1  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0468  mannosyltransferase  31.83 
 
 		 422 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0455  mannosyltransferase  31.83 
 
 		 422 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0479  mannosyltransferase  31.83 
 
 		 422 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0467  mannosyltransferase  33.22 
 
 		 428 aa  93.2  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0454  mannosyltransferase  33.22 
 
 		 428 aa  93.2  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0478  mannosyltransferase  33.22 
 
 		 428 aa  93.2  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2153  mannosyltransferase  31.93 
 
 		 369 aa  92.8  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0955915  normal  0.0100871 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  33.13 
 
 		 570 aa  92.4  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1343  hypothetical protein  34.53 
 
 		 410 aa  92  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3057  Protein of unknown function DUF2029  31.57 
 
 		 455 aa  91.3  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0888832  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2968  putative integral membrane protein  30.36 
 
 		 430 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12209  integral membrane protein  32.21 
 
 		 427 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1016  hypothetical protein  28.72 
 
 		 419 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2285  Protein of unknown function DUF2029  36.51 
 
 		 463 aa  88.2  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3543  putative integral membrane protein  32.09 
 
 		 428 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1126  Protein of unknown function DUF2029  29.23 
 
 		 425 aa  85.9  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3276  putative integral membrane protein  28.57 
 
 		 418 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3338  putative integral membrane protein  28.57 
 
 		 418 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3287  putative integral membrane protein  30.31 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505534  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4120  mannosyltransferase  30.05 
 
 		 443 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.703888 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4045  mannosyltransferase  30.05 
 
 		 443 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4274  mannosyltransferase  31.03 
 
 		 443 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4550  mannosyltransferase  31.36 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0139  hypothetical protein  32.13 
 
 		 437 aa  76.3  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1125  hypothetical protein  33.1 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.51418  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3060  hypothetical protein  31.43 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.647331  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3224  hypothetical protein  36.69 
 
 		 378 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0070  hypothetical protein  30.02 
 
 		 455 aa  67.4  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0119  hypothetical protein  32.29 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3880  putative conserved membrane protein  26.97 
 
 		 375 aa  55.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561968 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>