More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4020 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4020  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
283 aa  546  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169591  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8964  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  47.99 
 
 
302 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579779  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  49.27 
 
 
309 aa  199  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2345  luciferase family protein  45.45 
 
 
304 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.430269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2758  Luciferase-like monooxygenase  44.49 
 
 
296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  43.82 
 
 
311 aa  175  6e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2715  Luciferase-like monooxygenase  46.92 
 
 
301 aa  175  9e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  44.62 
 
 
298 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4259  luciferase family protein  41.43 
 
 
318 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  42.21 
 
 
318 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  42.21 
 
 
318 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  42.21 
 
 
318 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2389  luciferase family protein  41.43 
 
 
318 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408058  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4308  luciferase family protein  41.98 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1412  luciferase family protein  40.71 
 
 
318 aa  156  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4198  luciferase family protein  40.14 
 
 
317 aa  156  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  36.69 
 
 
318 aa  152  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  38.94 
 
 
301 aa  151  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4934  luciferase-like protein  38.74 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5022  luciferase family protein  38.74 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.125832  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3260  luciferase family protein  41.79 
 
 
304 aa  142  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  37.36 
 
 
309 aa  142  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5315  luciferase family protein  37.42 
 
 
309 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2453  luciferase family protein  39.69 
 
 
317 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3731  luciferase-like protein  41.73 
 
 
318 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3804  luciferase family protein  41.73 
 
 
318 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0754765 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3743  luciferase family protein  41.73 
 
 
318 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0517  luciferase family protein  37.99 
 
 
304 aa  136  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  36.03 
 
 
306 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1261  luciferase family protein  38.03 
 
 
300 aa  135  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.0146024 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3238  luciferase family protein  37.41 
 
 
304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0148661  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7087  luciferase family protein  38.49 
 
 
309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  37.92 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  39.32 
 
 
327 aa  102  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4369  F420-dependent oxidoreductase  32.2 
 
 
329 aa  102  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.257639  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  33.94 
 
 
360 aa  99  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3287  Luciferase-like, subgroup  32.39 
 
 
321 aa  97.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118077  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6536  hypothetical protein  30.39 
 
 
352 aa  96.3  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.8 
 
 
322 aa  95.5  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  35.96 
 
 
318 aa  94.7  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0358  luciferase family protein  26.96 
 
 
348 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2852  luciferase family protein  38.01 
 
 
314 aa  89  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.709446  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2761  luciferase-like  38.3 
 
 
353 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1795  putative oxidoreductase  29.65 
 
 
348 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1842  putative oxidoreductase  29.65 
 
 
353 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1776  putative oxidoreductase  29.65 
 
 
353 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.24 
 
 
336 aa  87.8  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4973  luciferase family protein  34.84 
 
 
360 aa  86.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2690  luciferase family protein  30.92 
 
 
340 aa  86.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0300  Luciferase-like monooxygenase  31.62 
 
 
364 aa  86.7  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  34.83 
 
 
339 aa  86.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4500  hypothetical protein  30.34 
 
 
325 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139462  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  34.18 
 
 
343 aa  85.5  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2020  putative oxidoreductase  27.73 
 
 
343 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  31.21 
 
 
359 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.32 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.73 
 
 
333 aa  83.6  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1557  hypothetical protein  30.51 
 
 
327 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  33.49 
 
 
372 aa  81.3  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1581  hypothetical protein  30.51 
 
 
327 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1527  hypothetical protein  31.76 
 
 
327 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186055  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  32.61 
 
 
344 aa  79.7  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  31.32 
 
 
350 aa  79.7  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  30.61 
 
 
350 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0203  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  34.24 
 
 
320 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  27.42 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  29.47 
 
 
345 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  30 
 
 
339 aa  75.5  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4326  putative oxidoreductase  27.3 
 
 
337 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.94 
 
 
352 aa  74.3  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6623  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33 
 
 
333 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  30.9 
 
 
348 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0941  luciferase-like protein  28.63 
 
 
341 aa  73.9  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  24.43 
 
 
321 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  31.34 
 
 
339 aa  74.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  27.35 
 
 
349 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  34.34 
 
 
349 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1121  luciferase family protein  26.78 
 
 
341 aa  73.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1071  hypothetical protein  31.6 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.46 
 
 
346 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  26.92 
 
 
349 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4112  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  36.69 
 
 
344 aa  73.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.273719  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.87 
 
 
328 aa  73.2  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1168  luciferase family protein  27.75 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.56 
 
 
349 aa  73.2  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  34.8 
 
 
346 aa  72.8  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  27.64 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  29.53 
 
 
346 aa  72.4  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  28.49 
 
 
345 aa  72  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4851  Luciferase-like monooxygenase  35.15 
 
 
321 aa  72  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0116346  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1615  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.85 
 
 
349 aa  72  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0868  hypothetical protein  27.39 
 
 
338 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1519  luciferase-like protein  27.34 
 
 
349 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.59 
 
 
332 aa  70.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1542  luciferase family protein  27.34 
 
 
349 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240997  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  28.38 
 
 
346 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  31.01 
 
 
349 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  25.96 
 
 
349 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  28.81 
 
 
349 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.05 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>