229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3978 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3978  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
400 aa  746    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19000  sugar phosphate permease  72.02 
 
 
387 aa  471  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.874746  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  63.64 
 
 
414 aa  437  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3581  major facilitator superfamily MFS_1  63 
 
 
435 aa  406  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  59.07 
 
 
396 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  59.35 
 
 
447 aa  390  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2868  major facilitator transporter  60.96 
 
 
399 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2912  major facilitator superfamily transporter  60.96 
 
 
399 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452412  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2898  major facilitator transporter  60.96 
 
 
399 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.681989 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  52.38 
 
 
408 aa  369  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3420  major facilitator transporter  60.06 
 
 
414 aa  358  7e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00336809  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2704  major facilitator superfamily MFS_1  51.16 
 
 
439 aa  286  7e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0226  major facilitator superfamily MFS_1  53.72 
 
 
421 aa  277  3e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.550832  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12450  Major Facilitator Superfamily transporter  42.37 
 
 
428 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0744182  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  45.1 
 
 
398 aa  268  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  44.76 
 
 
403 aa  263  3e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 
388 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 
386 aa  170  4e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  29.04 
 
 
385 aa  162  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06120  Major Facilitator Superfamily transporter  39.75 
 
 
437 aa  160  5e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  27.68 
 
 
386 aa  159  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 
387 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  28.53 
 
 
405 aa  155  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  34.29 
 
 
381 aa  147  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  31.07 
 
 
384 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 
390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 
383 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  30.61 
 
 
396 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  34.6 
 
 
417 aa  133  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  34.66 
 
 
398 aa  133  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  32.25 
 
 
369 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 
378 aa  126  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 
407 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 
391 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  31.46 
 
 
397 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  35.83 
 
 
393 aa  120  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  32.9 
 
 
384 aa  119  7e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  31.89 
 
 
396 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 
402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  29.85 
 
 
396 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  31.94 
 
 
408 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  32.42 
 
 
391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  33.79 
 
 
441 aa  117  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  25.41 
 
 
432 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  32.85 
 
 
413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  32.43 
 
 
400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  32.23 
 
 
388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  29.64 
 
 
397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  27.88 
 
 
397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  35.68 
 
 
391 aa  113  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  31.2 
 
 
400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0367  putative transporter  30.4 
 
 
462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  31.01 
 
 
388 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 
387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  32.32 
 
 
392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0408  major facilitator transporter  30.77 
 
 
443 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0666  major facilitator superfamily MFS_1  36.24 
 
 
409 aa  110  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0347459  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  34.16 
 
 
387 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4953  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 
465 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 
425 aa  106  8e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 
415 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2856  major facilitator transporter  33.13 
 
 
374 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  31.48 
 
 
373 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2690  major facilitator superfamily MFS_1  32.22 
 
 
464 aa  103  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2626  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  33.07 
 
 
392 aa  103  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686935  hitchhiker  0.0081174 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  30.12 
 
 
403 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  30.56 
 
 
404 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 
405 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0160  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 
384 aa  102  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.165984 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3074  major facilitator superfamily protein  29.71 
 
 
413 aa  101  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 
403 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  28.99 
 
 
383 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4705  major facilitator superfamily MFS_1  31.51 
 
 
470 aa  101  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00787464  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2534  major facilitator transporter  31.38 
 
 
417 aa  100  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.441567  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1030  major facilitator transporter  26.15 
 
 
411 aa  100  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3179  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 
413 aa  99.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8490  major facilitator superfamily permease  27.69 
 
 
396 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249724  normal  0.30566 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  30.96 
 
 
385 aa  97.8  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07710  Major Facilitator Superfamily transporter  28.81 
 
 
502 aa  97.8  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.18857  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  27.56 
 
 
383 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  29 
 
 
385 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3180  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 
446 aa  97.4  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0150137 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  28.75 
 
 
385 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  29.2 
 
 
383 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  28.75 
 
 
385 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5400  major facilitator superfamily permease  32.79 
 
 
395 aa  96.7  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  0.864795 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  30.87 
 
 
386 aa  96.3  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3060  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 
402 aa  95.9  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154269  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2714  major facilitator transporter  33.92 
 
 
404 aa  95.1  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.773773  hitchhiker  0.00188089 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  27.82 
 
 
383 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2780  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 
395 aa  93.6  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109964  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0049  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 
480 aa  92.4  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200181  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3213  major facilitator superfamily MFS_1  37.11 
 
 
390 aa  92.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00200336  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 
427 aa  92.8  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  23.87 
 
 
387 aa  92  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 
379 aa  91.3  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4139  major facilitator transporter  30.91 
 
 
400 aa  90.9  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.896136  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 
394 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1792  major facilitator superfamily protein  32.22 
 
 
403 aa  88.6  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  31.13 
 
 
403 aa  87.8  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>