217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3963 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 314 aa  615  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  60.93 
 
 		 303 aa  329  4e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1586  transcriptional regulator, XRE family  57.39 
 
 		 317 aa  323  3e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6984  helix-turn-helix domain protein  47.74 
 
 		 286 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118873  normal  0.27222 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  41.23 
 
 		 302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  43.53 
 
 		 309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  44.24 
 
 		 297 aa  199  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 301 aa  196  5.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0682  transcriptional regulator, XRE family  43.34 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2441  transcriptional regulator, XRE family  45.88 
 
 		 275 aa  190  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  43.94 
 
 		 293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 299 aa  188  8e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04290  Helix-turn-helix protein  41.02 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  42.34 
 
 		 302 aa  186  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3750  helix-turn-helix domain-containing protein  42.09 
 
 		 298 aa  183  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0445  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 296 aa  183  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  42.65 
 
 		 310 aa  183  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7348  hypothetical protein  43.22 
 
 		 291 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2784  transcriptional regulator, XRE family  47.13 
 
 		 284 aa  182  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.583087  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4080  XRE family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 312 aa  182  8.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0766168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  42.7 
 
 		 293 aa  182  9.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1568  transcriptional regulator, XRE family  39.02 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1690  transcriptional regulator, XRE family  41.88 
 
 		 305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal  0.186529 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3008  helix-turn-helix domain protein  40.22 
 
 		 303 aa  179  4e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000207491 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3277  helix-turn-helix domain protein  41.09 
 
 		 294 aa  179  7e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  42.18 
 
 		 278 aa  178  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 285 aa  176  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0180  XRE family transcriptional regulator  47.29 
 
 		 288 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0189  helix-turn-helix domain-containing protein  47.29 
 
 		 288 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  40.78 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  46.93 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3498  transcriptional regulator, XRE family  41.49 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4445  XRE family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 289 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0367  helix-turn-helix domain protein  41.97 
 
 		 284 aa  170  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4218  XRE family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 289 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4284  XRE family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 289 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19300  Helix-turn-helix protein  38.93 
 
 		 302 aa  168  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4120  helix-turn-helix domain protein  42.18 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31240  Helix-turn-helix protein  37.5 
 
 		 290 aa  165  6.9999999999999995e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5666  putative transcriptional regulator, XRE family  41.39 
 
 		 273 aa  165  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  41.16 
 
 		 287 aa  165  9e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14370  hypothetical protein  40.15 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  41.94 
 
 		 281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  42.49 
 
 		 299 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  40.08 
 
 		 277 aa  162  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3700  transcriptional regulator, XRE family  42.22 
 
 		 273 aa  162  8.000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.564208  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6833  helix-turn-helix domain protein  40.07 
 
 		 292 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0411  helix-turn-helix domain protein  40.5 
 
 		 303 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  40.86 
 
 		 318 aa  160  4e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2109  transcriptional regulator, XRE family  37.45 
 
 		 299 aa  159  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611283 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14230  Helix-turn-helix protein  42.59 
 
 		 277 aa  158  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.814537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1949  transcriptional regulator, XRE family  39.16 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8805  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 298 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  39.27 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0777  transcriptional regulator, XRE family  38.87 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245899  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  37.55 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12000  Helix-turn-helix protein  40 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2622  XRE family transcriptional regulator  38.77 
 
 		 304 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2666  helix-turn-helix domain-containing protein  38.77 
 
 		 297 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.372203  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2649  helix-turn-helix domain-containing protein  38.37 
 
 		 303 aa  149  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1893  helix-turn-helix domain protein  40.43 
 
 		 285 aa  149  9e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.792434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  34.56 
 
 		 276 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3682  helix-turn-helix domain protein  37.5 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2651  XRE family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 297 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  37.02 
 
 		 313 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4329  transcriptional regulator, XRE family  41.37 
 
 		 290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4361  transcriptional regulator, XRE family  40.51 
 
 		 265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20310  hypothetical protein  37.28 
 
 		 297 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.643001  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19630  Helix-turn-helix protein  37.92 
 
 		 288 aa  144  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.879989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1824  transcriptional regulator, XRE family  35.16 
 
 		 259 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375176 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4196  transcriptional regulator, XRE family  44.27 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1995  transcriptional regulator, XRE family  40.36 
 
 		 313 aa  144  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000234374  normal  0.041772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 282 aa  143  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1003  putative transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 291 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4458  transcriptional regulator, XRE family  37.86 
 
 		 272 aa  143  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4077  helix-turn-helix domain protein  36.53 
 
 		 275 aa  142  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2188  transcriptional regulator, XRE family  39.58 
 
 		 281 aa  142  7e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371471  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2718  helix-turn-helix domain protein  39.58 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.479107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7620  putative transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350779  normal  0.254497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4541  helix-turn-helix domain-containing protein  36.97 
 
 		 307 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4092  XRE family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 263 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  38.04 
 
 		 280 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3785  helix-turn-helix domain-containing protein  40.79 
 
 		 285 aa  139  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.48754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4741  XRE family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 263 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678188  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3425  XRE family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 263 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0368  transcriptional regulator, XRE family  37.55 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  38.43 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4588  XRE family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 286 aa  136  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000221272 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4317  helix-turn-helix domain protein  38.67 
 
 		 257 aa  135  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5476  XRE family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 290 aa  135  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4999  transcriptional regulator, XRE family  37.36 
 
 		 301 aa  135  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.662496 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3276  transcriptional regulator, XRE family  36.29 
 
 		 281 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16850  Helix-turn-helix protein  38.43 
 
 		 280 aa  134  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.950659  normal  0.0208664 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7046  helix-turn-helix domain protein  40.36 
 
 		 278 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  37.41 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20270  hypothetical protein  32.95 
 
 		 277 aa  134  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.161196 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1162  XRE family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 281 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157815  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2366  transcriptional regulator, XRE family  37.72 
 
 		 279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>