52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3868 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3868  putative esterase  100 
 
 		 282 aa  573  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000571996  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4948  putative esterase  61.54 
 
 		 289 aa  350  1e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.999794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4207  putative esterase  38.54 
 
 		 345 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.419848  normal  0.920837 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3612  putative esterase  29.11 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0832475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4516  putative esterase  33.33 
 
 		 422 aa  67.8  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3796  putative esterase  24.4 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2307  putative esterase  31.61 
 
 		 439 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.686614 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3579  hypothetical protein  26.67 
 
 		 275 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0266188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3863  hypothetical protein  26.67 
 
 		 275 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3745  hypothetical protein  26.67 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000059605 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3479  esterase  27 
 
 		 275 aa  57  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2085  putative esterase  25.56 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1192  putative esterase  25.13 
 
 		 329 aa  57  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00663281  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3767  hypothetical protein  26.83 
 
 		 272 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1825  putative esterase  23.14 
 
 		 276 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261111  normal  0.167809 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1466  IroE protein  25.81 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000298906 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0242  putative esterase  26.07 
 
 		 310 aa  57  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3833  IroE protein  26.27 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.934207  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3502  putative esterase  26.37 
 
 		 272 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3491  esterase  26 
 
 		 275 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.254505  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3783  hypothetical protein  25.5 
 
 		 275 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159518  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3040  putative esterase  24.82 
 
 		 291 aa  53.1  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91008 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5552  putative esterase  25.53 
 
 		 297 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.927665 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2349  putative esterase  29.68 
 
 		 460 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.705233  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0737  putative esterase  26.24 
 
 		 437 aa  52.4  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1097  putative esterase  25.58 
 
 		 295 aa  52.4  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.808292 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21170  esterase  36.67 
 
 		 365 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165865  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0711  putative esterase  28.21 
 
 		 448 aa  51.6  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000350604  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2538  putative esterase  28.3 
 
 		 312 aa  51.6  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4870  putative esterase  29.47 
 
 		 335 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533976  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3083  putative esterase  26.06 
 
 		 294 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00394287  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2437  putative esterase  29.22 
 
 		 462 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.580514  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0079  hypothetical protein  21.74 
 
 		 298 aa  50.4  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0868984  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4575  putative esterase  27.31 
 
 		 259 aa  50.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.971846 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2868  cysteine synthase A  27.03 
 
 		 309 aa  49.7  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.965819  normal  0.710891 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1658  putative esterase  25.96 
 
 		 430 aa  49.3  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.125907  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4960  putative esterase  32.65 
 
 		 420 aa  48.9  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2405  putative esterase  24.4 
 
 		 273 aa  48.9  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000464858  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1694  putative esterase  29.59 
 
 		 313 aa  48.9  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286431  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0696  putative esterase  26.17 
 
 		 304 aa  48.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.665195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0681  putative esterase  29.03 
 
 		 284 aa  48.9  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2707  putative esterase  24.2 
 
 		 285 aa  48.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.427697 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1537  30S ribosomal protein S12  25.2 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0975  putative esterase  37.5 
 
 		 321 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.527064 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1979  IroE protein  31.43 
 
 		 273 aa  45.8  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0583  putative esterase  27.92 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.397071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6478  esterase  24.58 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1265  putative esterase  20.38 
 
 		 287 aa  43.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1666  putative esterase  33.68 
 
 		 445 aa  43.1  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0598325  normal  0.0397493 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1518  putative esterase  28.11 
 
 		 442 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0083  putative esterase  22.5 
 
 		 379 aa  42.4  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2182  putative esterase  21.11 
 
 		 287 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000263766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>